نام پژوهشگر: علی اسمعیلی زاده کشکوئیه

مطالعه بیان ژن cib4 در بیضه، تخمدان، کلیه و کبد گوسفند کرمانی
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهید باهنر کرمان - پژوهشکده کشاورزی 1392
  امیرحسین جعفری دره در   محمدرضا محمدآبادی

پروتئین cib4 یکی از اعضای خانواده ی پروتئین های متصل شونده به کلسیم و اینتگرین، cib، می باشد که در باروری بالا موثر است. این پروتئین دارای 2 توالی نکلئوتیدی l-cib4 و s-cib4 می باشد. تا کنون وظایف بیولوژیکی cib4 در پستانداران به خوبی مشخص نشده، به هرحال اخیراً به دلیل اثر بالقوه cib4 در افزایش باروری توجه زیادی به این پروتئین شده است. لذا با توجه به نقش و اهمیت این پروتئین بر باروری، در مطالعه حاضر بیان این ژن در گوسفند کرمانی مورد ارزیابی قرار گرفت. در این مطالعه بیان ژن cib4 در بافت های مختلف شامل بیضه، تخمدان، کلیه و کبد در گوسفند کرمانی بررسی شد، در ابتدا بافت های مختلف از گوسفند تازه ذبح شده از کشتارگاه شهر ماهان تهیه و در ازت مایع به آزمایشگاه منتقل شد و سپس rnaکل از تمامی نمونه ها استخراج و کتابخانه cdna توسط آنزیم mmulv و پرایمر عمومی الیگو dt ساخته شد. پس از تکثیر ژن cib4 و gapdh به عنوان کنترل داخلی، محصول تکثیر شده بر روی ژل آگارز 1 درصد تفکیک شد. نتایج نشان دهنده حضور این ژن تنها در بیضه می باشد. علاوه بر این تعیین توالی این ژن و بلاست نمودن آن نشان داد که با توالی ژن گوسفند هان دم کوتاه 100 درصد مشابهت دارد و با ژنهای مشابه در گوسفند، بز، گاو و انسان به ترتیب 100، 99، 98 و 90 درصد هم خوانی دارد . نتایج حاصل بیانگر حفاظت بالای این توالی در گونه های مختلف می باشد.

بررسی اثر متقابل ژنوتیپ و متیونین بر صفات رشد و بیان ژن هورمون رشد در بافت سینه بلدرچین ژاپنی
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهید باهنر کرمان - دانشکده کشاورزی 1392
  سعیده نخعی مدیح   ملک حسین اسدی

چکیده: در این تحقیق به منظور بررسی اثر متقابل ژنوتیپ و متیونین بر صفات رشد و بیان ژن هورمون رشد در بافت سینه بلدرچین ژاپنی، تعداد 200 بلدرچین ژاپنی یک روزه در شرایط کاملا یکسان تا سن یک هفتگی پرورش داده شدند. این پرندگان براساس وزن یک هفتگی و همچنین جیره مورد استفاده به چهار گروه مختلف شامل ژنوتیپ سبک وزن با جیره استاندارد، ژنوتیپ سبک وزن با جیره بدون مکمل متیونین، ژنوتیپ سنگین وزن با جیره استاندارد و ژنوتیپ سنگین وزن با جیره بدون مکمل متیونین تقسیم شدند. رکورد های انفرادی وزن های هفتگی جمع آوری شد. همچنین در دو سن 24 و 35 روزه گی در هر سن تعداد 40 بلدرچین کشتار شده و صفات استخوانی شامل طول ، ضخامت و وزن استخوان های ران، ساق و بازو اندازه گیری شد. همچنین از بافت سینه 12 بلدرچین کشتار شده در سن 24 روزه گی نمونه برداری گردید. برای بررسی میزان بیان ژن هورمون رشد از تکنیک real time pcr استفاده شد. نتایج حاصل نشان داد که ژنوتیپ سنگین وزن که با مکمل متیونین نیز تغذیه شده بالاترین وزن و ژنوتیپ سبک وزن که تحت محدودیت متیونین بود کمترین میزان رشد را در بین این چهار گروه دارد همچنین نتایج نشان داد که اثر کمبود متیونین روی رشد در سنین ابتدایی بارزتر است اما با افزایش سن اثر متیونین کاهش پیدا می کند در نتیجه سنین ابتدایی نیازمند مدیریت تغذیه ای مناسب تر و جیره ای کامل تر می باشد. تمامی خصوصیات استخوان های گروه سنگین وزن از گروه سبک وزن بیشتر بود اما حذف مکمل متیونین اثر معنی داری بر این خصوصیات نداشت. آنالیزها اثر متقابل معنی داری را بین ژنوتیپ و متیونین برای وزن بدن و همچنین صفات استخوانی نشان نداد (p>0.05). همچنین نتایج نشان داد که بین دو جنس از نظر وزن بدن و صفات استخوان تا سن 35 روزه گی اختلاف معنی داری وجود ندارد. لازم به ذکر است برای بررسی بیان ژن هورمون رشد، rna کل از بافت سینه استخراج و cdna ساخته شد و بهینه سازی شرایط pcr و real- time pcr برای ژن های هورمون رشد و ?- actin انجام گرفت. واژه های کلیدی: اثر متقابل ژنوتیپ و متیونین، وزن بدن، خصوصیات استخوان، بیان ژن هورمون رشد، بلدرچین ژاپنی

چندشکلی آللی اگزون 2 ژن bmp15 در گوسفندان آمیخته نسل اول حاصل از تلاقی قوچهای نژاد رومانف با میش های نژاد کرمانی و لری بختیاری
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهید باهنر کرمان - دانشکده کشاورزی 1393
  منصوره رجایی نژاد   احمد آیت اللهی مهرجردی

در این پژوهش چند شکلی ژن bmp15 با استفاده از تکنیک pcr-sscp در گوسفندان آمیخته حاصل از تلاقی قوچ های نژاد رومانف با میش های نژاد کرمانی و لری بختیاری بررسی شد. بر اساس فرم باندهی بدست آمده از تکنیک pcr-sscp، 5 نمونه از فرآورده pcr، تعیین توالی شد، پس از بررسی، دو جهش تک نوکلئوتیدی در جایگاههای bp32 وbp 95 پیدا شد، جهش اول در موقعیت bp 32 تغییری در توالی اسید آمینه ها ایجاد نمی کرد اما جهش تک نوکلئوتیدی دوم در جایگاه bp 95، منجر به تغییر در اسید آمینه شماره 40 گردید که بر اساس آن یک اسید آمینه لایزین را جایگزین یک اسید آمینه آسپارژین می کرد. با توجه به جایگزینی یک اسید آمینه باردار به جای یک اسید آمینه بدون بار، به نظر می رسد که این جهش موجب اختلال در دایمریزاسیون می شود، به گونه ای که سبب تغییر در پتانسیل سطح الکتریکی در این جایگاه می گردد، که این رخداد فعالیت زیستی را به چالش می کشد. فراوانی الگوهای ژنوتیپی aa، ab، bb، ac، ad، ae، af و ag در آمیخته های رومانف-کرمانی به ترتیب 0/24، 0/17، 0/24، 0/08، 0/05، 0/10 0/09، 0/03 و در آمیخته های رومانف_ لری بختیاری فراوانی الگوهای ژنوتیپی aa، ab به ترتیب 0/2، 0/8 بود و فراوانی¬ های آللی برای آلل های a، b، c، d، e، f وg به ترتیب 0/500، 0/3250، 0/0417، 0/0250، 0/0500، 0/0458 و 0/0125 و برای آلل های a و b به ترتیب 0/6و 0/4بدست آمد. تمامی میش های لری بختیاری و کرمانی نیز برای این جایگاه منومورف بودند. شاخص شانون و میزان هتروزگوسیتی مشاهده شده در آمیخته های رومانف –کرمانی و رومانف_ لری بختیاری، بر اساس ژنوتیپ های دیده شده در این جایگاه به ترتیب 1/2823، 5167/ 0و 0/6730، 0/8000بدست آمد که گویای تنوع بسیار بالای این جایگاه در جمعیت مورد بررسی می باشد. انتظار می رود این آمیخته ها باروری و رکوردهای بالاتری نسبت به گوسفندان کرمانی و لری بختیاری داشته و صفات برترگوسفندان رومانف مانند چند قلوزایی و بلوغ زود رس را داشته باشند. می توان با وارد نمودن این ژنها و برنامه ریزی برای تکثیر و تثبیت جهش های اتفاق افتاده مرتبط با ژنهای باروری کمک قابل توجهی به افزایش تولید و درآمد دامداران کشور انجام داد.

بررسی آثار تولیدی و اقتصادی کاهش طول دورة خشکی گاوهای شیری پر تولید و متوسط تولید هلشتاین در دوره¬های شیردهی اول تا سوم در ایران
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهید باهنر کرمان - دانشکده کشاورزی 1393
  عباس تیموری   علی اسمعیلی زاده کشکوئیه

دورة خشکی گاو اثر زیادی بر میزان تولید شیر و تولید مثل گاو دارد. بازده تولید مثلی درگاوهای پرتولید درسال¬های اخیر کاهش یافته که انتخاب ژنتیکی برای افزایش تولید شیر، با وجود تولید شیر بیشتر در گاوها باعث کاهش باروری شده است. بین شایستگی ژنتیکی گاوها از نظر تولید شیر و عملکرد تولید مثلی رابطه ای منفی وجود دارد. تداوم تولید گاوهای شیری پر تولید باعث افزایش درآمد حاصل از تولید شیر به ازای هر راس گاو در سال می شوند. از طرف دیگر مدیریت تغذیه گاوهای خشک به خاطر تغییرات کمتر جیره غذایی ساده تر می شود. تاثیر طول دورة خشکی بر بهره ¬وری تولید شیر با استفاده از 1887 گله و 1556631 رکورد ثبت شده گاوهای شیری هلشتاین در کشور بررسی شد. متوسط تعداد روزهای خشکی در گاوهای پر تولید 67 روز برآورد شد در حالی که این رقم برای گاوهای متوسط تولید 82 روز بود. کاهش تعداد روزهای خشکی از 67 به 40 روز در گاوهای پر تولید باعث بهبود 9 درصدی درآمد منهای هزینه خوراک به ازای هر روز از فاصلة زایش به ازای هر راس گاو می شود.

مطالعه چند شکلی ژن گیرنده fsh در بره-های آمیخته حاصل از قوچ های رومانوف و میش-های بومی با استفاده از تکنیکpcr-sscp
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهید باهنر کرمان - دانشکده کشاورزی 1393
  زینب سلیمانی ده دیوان   احمد آیت اللهی مهرجردی

هدف از این پژوهش، بررسی چند شکلی ژن گیرنده هورمون محرک فولیکول (fshr) در بره های آمیخته حاصل از میش های بومی کرمانی با قوچ های رومانوف و میش های بومی کرمانی و بره های نر بومی-پاکستانی بود. برای این منظور نمونه های خون 173 راس گوسفند شامل بومی و بومی- رومانوف و هفت راس بره نر بومی-پاکستانی ازگله ای در کرمان، جمع آوری و با حفظ زنجیره سرد به آزمایشگاه منتقل شد. dna به روش نمکی بهینه یافته استخراج شد و سپس با استفاده از دو جفت آغازگر اختصاصی دو قطعه از جایگاه تنظیمی ژن به طول 205 و 247 جفت باز به کمک واکنش زنجیره ای پلی مراز (pcr) تکثیر شد، و با روش sscp آنالیز شد، بدین صورت که الگوها از dna تک رشته ای جدا شده توسط الکتروفورز ژل پلی اکریل آمید، به دست آمد و توسط رنگ آمیزی نیترات نقره مشاهده شدند.

مطالعه چند شکلی ژن های igfi وfecbدر بره-های آمیختهحاصل از قوچ های رومانوف و میش-هایلری بختیاری با استفاده از تکنیکpcr-sscp
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهید باهنر کرمان - دانشکده کشاورزی 1393
  نرجس بذرکار   مسعود اسدی فوزی

ایران یکی از مهم ترین مراکز پرورش گوسفند است. نژاد لری بختیاری از جمله گوسفندان چندقلوزای کشور است. رومانوف نیز نام یک نژاد گوسفند روسی است که دارای رکورد چند قلوزایی می باشد. این دو نژاد از نژاد های گوشتی گوسفند بوده و دارای رشد خوبی نیز می باشند. هدف از این مطالعه بررسی وجود جهش ژن های fecb و igfi در گوسفندان آمیخته رومانوف ولری بختیاری است. بررسی ها نشان می دهد که جهش ژن بورولا، یکی از ژن های بزرگ وموثر بر میزان تخمک ریزی وچندقلوزایی وژن igfi یک ژن تاثیرگذار روی رشد در گوسفند است. در این مطالعه 60 نمونه خون (36 بره آمیخته) ، (24 میش) جمع-آوری شد.

بررسی چند شکلی ژن آلفای گیرنده استروژن (esr?) در بره های آمیخته رومانف و بومی ایران با استفاده از pcr- sscp
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهید باهنر کرمان - دانشکده کشاورزی 1393
  مهدیه نژاد مقبلی قرائی   احمد آیت اللهی مهرجردی

هدف از پژوهش حاضر، بررسی چند شکلی در ژن گیرنده آلفای استروژن (esr?) در بره های آمیخته حاصل از قوچ های رومانف و میش های بومی ایران بود. برای این منظور نمونه های خون 172 راس گوسفند از گله ای در اطراف شهر کرمان، متشکل از 52 راس میش بومی، 57 راس بره ماده آمیخته رومانف- بومی و 64 راس بره نر آمیخته رومانف- بومی، جمع آوری شد. استخراج dna به روش نمکی بهینه یافته از خون کامل انجام شد. سپس با استفاده از یک جفت آغازگر طراحی شده تکثیر قطعه ی 258 جفت بازی این ژن با واکنش زنجیره ای پلی مراز (pcr) انجام گردید. پس از تعیین چند شکلی فضایی تک رشته ای (sscp) محصولات pcr، الگوهای باندی مربوط به ژن گیرنده ی آلفای استروژن با استفاده از ژل آکریل آمید و رنگ آمیزی نیترات نقره به دست آمد. نتایج به دست آمده نشاندهنده مونومورف (یک شکل) بودن dna ژنومی برای ژن esr? در این گله گوسفند می باشد.