گیاه فلفل (capsicum annuum) یکی از محصولات مهم زراعی در جهان است که باتوجه به اهمیت غذایی و مصرف قابل توجه آن اخیراً کشت آن در کشور بالاخص در گلخانه ها توسعه یافته است. ولی، بیماری های متفاوتی رشد و نمو تولید این محصول را تهدید می نماید که در این راستا بیماری های قارچی از شدت بالایی برخوردار می باشند. لذا، در این راستا تحقیقاتی در مزارع و گلخانه های مورد کشت فلفل دلمه ای در جهت بررسی و شناسایی عوامل بیماری قارچی این محصول انجام گردید. در این تحقیق گیاهان آلوده فلفل از مزارع و گلخانه های مورد کشت برداشت، و در کیسه های نایلونی جمع آوری و به آزمایشگاه انتقال داده شد. بررسی ها نشان داد که برخی از عوامل قارچی موجب بیماری روی اندام های هوایی گیاه می شوند از جمله سفیدک دروغی، سفیدک حقیقی، پوسیدگی اسکلروتینیایی ساقه، لکه موجی، کپک خاکستری میوه تشخیص داده شد دسته ی دیگر از عوامل قارچی موجب بیماری روی اندام های زیر زمینی از جمله طوقه و ریشه بودند که بررسی نشان داد، بیماری های پوسیدگی و ورتیسلیومی، بوته میری فیتوفترایی، پوسیدگی فوزاریومی، پوسیدگی ریزوکتونیایی و پوسیدگی پیتیومی می باشند. برای مشاهده این دسته از قارچ ها از حد فاصل بخش آلوده و سالم ریشه و طوقه گیاهان آلوده نمونه برداری و به منظور جداسازی و رشد نمونه قارچ ها از محیط کشت های پایه wa,cma,pda محلول پتری و محیط کشت های اختصاصی pepton pcnb,agar,bnprah و برای خالص سازی از قارچ های مذکور از دو روش تک ریسه و تک اسپور کردن استفاده و نیز در شرایط گلخانه اثبات بیماری زایی گردید. با بررسی های ماکروسکوپی و میکروسکوپی گونه های peronospora tabacina (بیماری سفیدک دروغی)، erysiphe taurica (بیماری سفیدک حقیقی) a.alternata, alternaria solani (بیماری موجی)، botrytis cinerea (بیماری کپک خاکستری)، sclerotinia sclerotiorum (بیماری پوسیدگی ساقه) در اندام های هوایی و گونه های v.albo-atrum ، verticillium dahlia (پوسیدگی و رتیسلیومی، p.citrophthora ، phytophthora capsici (پوسیدگی فیتوفترایی)، fusariumm f.oxysporum , solani ( پوسیدگی فوزاریومی)، rhizoctonia solani ( پوسیدگی ریزوکتونیایی)، pythium aphanidermatum (پوسیدگی پیتیومی) از طوقه و ریشه شناسایی گردید. بررسی چگونه های بیماری زایی عوامل قارچی مربوط در شرایط گلخانه به طور جداگانه در مقایسه با مشاهد، در شش شاخص متمایز 0،10،25،50،75،100 مشخص نمود که گونه های مورد آزمون از نظر شدت و شاخص بیماری روی گیاه فلفل از تفاوت قابل توجه و فاحشی برخوردار می باشد. بررسی اثر جدایه ها بر روند رشد و اجرای عملکرد گیاه فلفل در شرایط گلخانه شامل طول، وزن تر و خشک قسمت های هوایی، ریشه نشان داد که جدایه های مربوط اثرات متفاوت با اثر معنی دار نسبت به یکدیگر و شاهد در رشد و اجرای عملکرد گیاه فلفل داشته اند.