در این تحقیق به منظور بررسی آنالیز ژنتیکی نمره¬ی سلول¬های بدنی گاوهای هلشتاین ایران در روزهای شیردهی مختلف و همچنین سطوح متفاو ت تولید شیر از 76577 رکورد روزآزمون شمار سلول¬های بدنی دوره های شیردهی اول، دوم و سوم مربوط به 100400 حیوان از 182 پدر و 11700 مادر و متعلق به 57 گله که توسط مرکز اصلاح دام کشور طی سال های 1386 تا 1388جمع آوری شده بودند، استفاده گردید. آنالیز ژنتیکی رکوردهای روزآزمون نمره¬ی سلول¬های بدنی شیر با استفاده از روش تابعیت تصادفی و با کمک نرم افزار asreml انجام شد. به این منظور اثرات سن حیوان، تعداد روزهای شیردهی و اثر سال زایش بعنوان اثرات ثابت در نظر گرفته شدند همچنین اثر ژنتیکی حیوان، اثرمحیط دائمی حیوان و اثر گله-تاریخ رکورد گیری بعنوان اثرات تصادفی لحاظ شدند. وراثت پذیری برآورد شده صفت نمره¬ی سلول¬های بدنی شیر برای سه دوره شیردهی اول تا سوم بر مبنای تعداد روزهای شیردهی به ترتیب 07/0، 07/0 و 08/0 برآورد گردید ، این مقادیر برمبنای سطوح مختلف تولید شیر به 03/0، 02/0 و 02/0 کاهش یافت. بر اساس این نتایج بررسی نمره¬ی سلول¬های بدنی شیر در روزهای مختلف شیردهی بدلیل وراثت¬پذیری بالاتر کارایی بیشتری نسبت به بررسی این صفت در سطوح مختلف تولید شیر دارد. همبستگی ژنتیکی نمره¬ی سلول¬های بدنی در ماه¬های مختلف شیردهی در دامنه¬ی 99/0+ تا 98/0- برآورد گردید که بیشترین همبستگی بین ماههای مجاور هم و در یک سوم میانی دوره شیردهی مشاهده شد، همچنین همبستگی ژنتیکی بین سطوح مختلف شیردهی در دامنه¬ی 99/0+ تا 81/0- برآورد گردید و مشخص شد که با افزایش فاصله¬ی بین سطوح مختلف شیردهی از همبستگی ژنتیکی آنها کاسته می¬شود. مقایسه نتایج حاصل از آنالیز ژنتیکی نمره¬ی سلول¬های بدنی در روزهای مختلف شیردهی و سطوح مختلف تولید شیر نشان می¬دهد که تغییرات ژنتیکی شمار سلول¬های بدنی شیر تنها تابع میزان تولید شیر نمی¬باشد بلکه متاثر از تعداد روزهای شیردهی نیز می¬باشد. بنابراین به ¬منطور افزایش دقت بهتر است به هر دوی این موارد توجه شود.