ژن tlr4 بر روی کروموزوم 17 قرار گرفته و دارای 3 اگزون و 2 اینترون است. این ژن باعث سنتز پروتئینی با تعداد843 اسید آمینه می شود که تنظیم و شروع کننده یپاسخ های ایمنی به هنگام آلودگی با باکتری های گرم منفی است. هدف از این مطالعه تجزیه و تحلیل ساختاری ژن tlr4 و ارتباط آن با صفات ایمنی در دو سویه بومی و تجاری بود. برخی از صفات ایمنی مثل میزان عیار پادتن های تولید شده علیه srbc (عیار پادتن کل، ta؛ عیار ایمونوگلوبولین y، igy؛ و عیار ایمونوگلوبولین m، igm)، در دو سن 22 و 50 هفتگی رکورد برداری شده و مورد مقایسه قرار گرفتند. تجزیه و تحلیل داده ها با نرم افزار minitab مشخص کرد عیار پادتن کل، ta و عیار ایمونوگلوبولین y، igy در سن 22 هفتگی بین دو سویه تفاوت معنی داری دارد(05/0p<). بطوریکه هر دو معیار برای سویه بومی بالاتر از آرین ها بود ولی برای عیار ایمونوگلوبولین m، igm در سن 22 هفتگی تفاوت معنی داری از لحاظ آماری مشاهده نشد(05/0p<). برای هیچ کدام از معیارهای پاسخ ایمنی همورال در سن 50 هفتگی از نظر آماری تفاوت معنی داری وجود نداشت (05/0>p)، هر چندمقادیر در سوی? بومی اندکی بیشتر از سوی? آرین بود. شاخص ریش بعنوان معیاری از ایمنی سلولی در سن 50 هفتگی در هر دو سویه آرین و بومی مورد بررسی قرار گرفت که تفاوت معنی داری مشاهده نشد (05/0p<).در این تحقیق از هر دو نژاد مختلف به تعداد120قطعهمرغ وخروس خون گیری شد و استخراج dna و تکثیر ژن مورد نظر انجام شد.با توالی یابی ژن مورد نظر در دو سویه آرین و بومی2 نوع snp جدید شناسایی شد که با معرفی سایت برش برای آنزیم های محدودگر ecori، mseiواکنش هضم آنزیمی صورت گرفت. نتایج نشان دادکه هیچکدام از جایگاه های مورد مطالعه پلی مورف نیستند. همچنین بیان ژن tlr4 در سه بافت کبد، طحال، ریه مورد بررسی قرار گرفت. پس از استخراج rna سنتز cdna انجام شد. باندهای حاصل از تکثیر قطعه ای از ژن tlr4 با الکتروفورز ژل آگارز 1% توسط نرم افزار image j پردازش شد و تجزیه تحلیل آماری با نرم افزار minitab نشان داد در بین دو نژاد بومی و تجاری، بیان ژن tlr4 در بافت های کبد، طحال و ریه تفاوت معنی داری ندارد(05/0p<).