نام پژوهشگر: پریسا فرنیا

بررسی ژنوتیپ پنوموسیستیس ایرووتسی در بیماران مبتلا به عفونت های ریوی و تعیین شیوع پلی مورفیسم های ایجاد کننده مقاومت دارویی در سویه های جدا شده از بیماران hiv+ شهر تهران
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس - دانشکده پزشکی 1391
  فاطمه-مریم شیخ الاسلامی   پریسا فرنیا

پنوموسیستیس ایرووتزی یکی از عوامل بیماریزای فرصت طلب می باشد که قادر به ایجاد بیماری کشنده در افراد مبتلا به نقص سیستم ایمنی می باشد. مطالعه حاضر اولین مطالعه مولکولار اپیدمیولوژی ارگانیسم فوق در بیماران مبتلا به نقص ایمنی در ایران می باشد. در این مطالعه از سه گروه بیمار مبتلا به نقص ایمنی مراجعه کننده به مرکز رفرانس سل و بیماریهای ریوی و مرکز رفرانس hiv/aids تعداد 372 نمونه جمع آوری شد. جهت تشخیص وجود dna ارگانیسم یک قطعه از ژن mt lsu rrna با استفاده از nested pcr تکثیر گردید. به منظور تشخیص موارد مقاوم به دارو، موتاسیون در دو کدون 55 و 57 از ژن dhps با استفاده از روش pcr-rflp بررسی شد. و به منظور تعیین ژنوتیپ سوش جدا شده از بیمار یک قطعه از ژن its1-its2 تکثیر و تعیین توالی گردید. در این مطالعه، dna ارگانیسم از نمونه 130/16 بیمارhiv مثبت (3/12%)،89/7 بیمار (8/7%) مبتلا به aecopd و 153/11 بیمار (2/7%) مبتلا به انواع بدخیمی جدا گردید. 34/5 نمونه (7/14%) جدا شده از بیماران مثبت موتاسیون در کدون های 55 و 57 را نشان دادند. نتایج این تحقیق نشان داد که هاپلوتایپ غالب در نمونه های جدا شده از بیماران ایرانی تایپ eg با فرکانس 25% می باشد. آنالیزها نشان داد که هاپلوتایپ eg سرمنشاء تایپ های جدا شده از بیماران ایرانی می باشد. دو هاپلوتایپ جدید hb و hi که تا کنون از هیچ نقطه ایی از دنیا گزارش نشده است و یک ژنوتایپ جدید (edelt) در این مطالعه مشاهده گردید. ارتباطی بین موتاسیون در ژن dhps و تایپ های جدا شده از بیماران ایرانی مشاهده نشد. آنالیز فیلوژنتیک بر اساس پلی مرفیسم قطعه ژنی mt lsu rrna نشان داد که سوش های جدا شده از بیماران ایرانی با 99% تشابه، شبیه به سوشهای جدا شده از بیماران هندی می باشد.

تنوع ژنتیکی ساب تایپ های مایکوباکتریوم بوویس به وسیله روش های اسپولیگوتایپینگ و pcr-rflp
پایان نامه دانشگاه آزاد اسلامی - دانشگاه آزاد اسلامی واحد گرمسار - دانشکده دامپزشکی 1391
  پویان خالقیان   پریسا فرنیا

زمینه وهدف : اهداف این پژوهش بررسی شیوع سویه های مایکوباکتریوم بویس در انسان و مقایسه تنوع ژنتیکی جدایه های مایکوباکتریوم بوویس از انسان و گاو است وهمچنین شناسایی زیر گونه های م.بوویس(م.بوویس ساب تایپ بوویس و م.بوویس ساب تایپ کاپریه ) در انسان و دام انجام گردید. به علت متفاوت بودن درمان سل در موارد درگیری فرد با گونه های م.بوویس در انسان بررسی این زیر گونه ها با کمک تکنیک های مولکولار اپیدمیولوژی اهمیت ویژه ای پیدا می کند . مواد و روش: پس از انتخاب نمونه ها و جداسازی از محیط کشت لوان اشتاین جانسون و انجام تست های افتراقی (تست نیاسین،احیاء نیترات،تست کاتالاز وتست مهار رشد بوسیله tch) م.بوویس ها از م.توبرکلوزیس ها تمایز داده شد. سپس استخراج dna برای نمونه های انسانی به روش کیت کیاژن و برای نمونه های دامی از کلنی های رشد کرده در محیط کشت سوسپانسیونی در بافر لیز کننده مایکوباکتریوم ها تهیه و به روش جوشانیدن dna آن استخراج گردید. سپس اسپولیگوتایپینگ با استفاده ازپرایمرهای dra و drb انجام شد و نتایج حاصله در سایت 4spoldb آنالیز شدند. واز روش rflpـpcr برای ژن pnca جهت بررسی مقاومت به پیرازینامد استفاده شد. یافته ها و نتایج: از ???? نمونه کشت مثبت بیماران مسلول تعداد ? بیمار (6/0 ?) مبتلا به م.بوویس بودندکه دارای st??? و st??? بودند. و از ?? نمونه دامی مبتلا به م.بوویس با کمک روش اسپولیگوتایپینگ ?? سویه (1/91 ?) در ? کلاستر طبقه بندی شدند: کلاستر?: ?? سویه(5/45 ?) با st??? ، کلاستر?: ??سویه (1/19 ?) با st????، کلاستر?: ??سویه (6/17 ?) با st ناشناخته، کلاستر?:?سویه(9/2 ?) با st??? ، کلاستر? و? : هرکدام ?سویه (9/2 ?) با st ناشناخته، و باقی ? سویه (?/? ?) به صورت منفرد بودند و در هیچ کلاستر طبقه بندی نشدند که ? سویه دارای st??? بود. بحث و نتیجه گیری: م.بوویس ساب تایپ بوویس در جمعیت ایرانی با فراوانی 0.6 ? گزارش شد که پایین تر از میانگین موارد بررسی شده پیشین است.در این مطالعه همه سویه ها م.بوویس ساب تایپ بوویس بودند که مقاوم به پیرازینامید بودند و هیچ سویه م.بوویس ساب تایپ کاپریه یافت نشد.همچنین تنها stمشترک بین سویه های دامی و انسانی st ??? بود و م.بوویس ساب تایپ بوویس با st ??? شاخص بوویس انسانی گزارش شد.