هویج گیاهی علفی دوساله به نام علمی daucus carato ssp sativus از تیره چتریان است. این گیاه در معرض انواع بیماری¬های قارچی، باکتریایی، ویروسی قرار دارد. یکی از بیماری¬های مهم هویج بیماری پوسیدگی نرم باکتریایی ناشی از pectobacterium caratovorum است. مبارزه با این بیماری دشوار بوده و یکی از مهم¬ترین روش¬ها کنترل بیولوژیک است که این بررسی در همین راستا انجام گرفته ¬است. نمونه¬های هویج مشکوک به بیماری پوسیدگی نرم از مزارع استان همدان، در پاییز سال 1392 جمع¬آوری و استرین¬های p. caratovorum روی محیط کشت emb جدا شد. غده¬های هویج از مزارع استان همدان به طور تصادفی با حرکت زیگزاگی در مزرعه انتخاب و جمع آوری شدند. باکتری¬های رایزوسفر از ریشه هویج جدا و توانایی بازدارندگی 44 استرین منتخب علیهp. caratovorum در قالب طرح کاملا تصادفی در شرایط آزمایشگاه ارزیابی شد. براساس قطر هاله بازدارندگی در این شرایط استرین¬های mm2 و mm8 به ترتیب بیشترین و کمترین اثر علیه p. caratovorum را نشان دادند. با توجه به تفاوت در میزان بازدارندگی و با مقایسه الگوی الکتروفورزی پروتئین¬های محلول سلولی هشت استرین به عنوان نماینده انتخاب شدند. براساس آزمون¬های بیوشیمیایی و فیزیولوژیکی مشخص شد که این استرین¬ها وابسته به جنس¬های pseudomonas ,xanthomonas ,enterobater و pantoa هستند. بازدارندگی باکتری¬های رایزوسفر در شرایط گلخانه با روش آغشته سازی بذر و خاک در قالب طرح کاملا تصادفی با سه تکرار مورد بررسی قرار¬گرفت. در این شرایط ویژگی¬های طول و وزن برگ و غده، و شدت بیماریزایی بر اساس شادابی و میزان¬لهیدگی و هم چنین فراوانی کلنی¬های p. caratovorum مورد سنجش قرار¬گرفت. نتایج نشان داد که استرین¬هایmm2a2, و mm1a2 به ترتیب بیشترین تاثیر را در افزایش رشد گیاه و کاهش شدت بیماری داشتند. ژن¬های کد کننده 16srrna استرین¬های برگزیده با استفاده از پرایمر¬های اختصاصی در واکنش زنجیره¬ای پلی¬مراز(pcr) تکثیر و تعیین توالی شد. توالی¬های به دست¬آمده با داده¬های موجود در بانک اطلاعاتی سایت ncbi بلاست شد. نتایج نشان داد که استرین¬هایmm2,mm1,mm8 به ترتیب 99 درصد باتوالیsrrna16 در باکتری¬هایpantoa conspicua، pseudomonas fleuresant وenterobacter amniginus شباهت دارند.