مسئله پیچش پروتئین یکی از موضوعات مهم در شاخه‏های مختلف ژنتیک و فیزیک است، که این اهمیت ناشی از ارتباط رفتار پروتئین با ساختار آن است. در این تحقیق، رفتار پیچیده پلیمرهای خطی با شاخه‏های با طول مختلف که در فواصل معینی روی زنجیره اصلی قرار گرفته‏اند با بهره از اتوماتای سلولی شبیه‏سازی شد. ابتدا شعاع چرخش بر حسب گام‏های زمانی و سپس میانگین شعاع چرخش در هر مورد به عنوان تابعی از طول پلیمر و زمان آسایش در هر یک از حالات محاسبه گردید. نتایج به دست آمده با نتایج حاصل از مدل‏ فلوری و مدل رُز مقایسه شد. در نهایت، مقایسه‏ای بین رفتار و پیچش پلیمرهای خطی شاخه دار و بدون شاخه نشان داد که در پلیمر شاخه دار به دلیل وجود ممانعت فضایی ناشی از شاخه‏ها، پلیمر به راحتی حالت‏های بدون شاخه پیچیده نمی‏شود و به همین دلیل میانگین شعاع چرخش در این حالت نسبت به زنجیره خطی بدون شاخه بیشتر است. هر چه بر تعداد مونومرهای موجود در شاخه‏ها افزوده، و شاخه‏ها طویل‏تر می‏شوند، این رفتار بیشتر مشهود است و انحراف از نتایج حاصل از مدل فلوری و رُز بیشتر می‏شود.