امروزه تمایل زیادی به استفاده از کاربردهای اپتیک در پزشکی دیده می شود از جمله این کاربردها می توان برای نمونه به فتودینامیک تراپی و جراحی با لیزر اشاره کرد. اندازه گیری و بررسی خواص اپتیکی بافت قبل و بعد از فتودینامیک تراپی را می توان مهمترین کاربرد اپتیکی این پایان نامه در پزشکی به شمار آورد. هدف از این پروژه در وحله اول مشخص کردن خواص اپتیکی بافت به منظور پیش بینی پارامترهای کلینیکی و در مرحله دوم بررسی چگونگی تاثیر فتودینامیک تراپی بر خواص اپتیکی بافت می باشد. به این منظور شماری از امکانات آزمایشگاهی و روش های ریاضی مورد استفاده قرار گرفته اند. کره کامل، طیف سنج نوری، فیبرهای نوری و لیزر هلیوم - نئون بعضی از ابزار استفاده شده در این آزمایش می باشند. علاوه بر این برای استخراج خواص اپتیکی از اندازه گیری های آزمایشگاهی نیازمند استفاده از روش های ریاضی مانند روش رگرسیون چند جمله ای و همچنین شبیه سازی مونته کارلو می باشیم. خواص اپتیکی اندازه گیری شده از گوش موش نشان دهنده افزایش ضریب جذب در حین درمان است از آنجا که این افزایش بر روند درمان و همچنین یافتن دوز نوری مناسب برای درمان تاثیر گذار است، دانستن مقدار این افزایش از اهمیت ویژه ای برخوردار می باشد. علاوه بر این دلیل افزایش ضریب جذب از دیگر موضوعات مهمی بود که به آن اشاره شد.