استافیلوکوکوس اورئوس یکـی از مهمتـرین عوامـل عفونـت هـای بیمارستانی و عفونت های کسب شده از اجتماع است و سویه استافیلوکوک اورئوس مقاوم به متی سیلین mrsa)) مهمترین عامل ایجاد عفونت بیمارستانی است. مقاومت به متی سیلین توسط ژن meca که پروتینی به نام (pbp2a) را کد می کند ایجاد می شود، این ژن در ناحیه ژنومی متحرکی به نام کاست کروموزوم استافیلوکوکی (sccmec) قرار گرفته است. تیپ بندی این منطقه برای درک مسیرهای انتقال و مطالعات ژنتیکی این باکتری ضروری است. علاوه بر این مطالعه دقیق استافیلوکوکوس در سطح ژنتیکی برای درک عمیق مکانیسم های درگیر در ایجاد مقاومت ضروری است. هدف اصلی این پژوهش شناسایی تیپهای i - v sccmec در ایزوله های استافیلوکوک اورئوس جدا شده از نمونه های بالینی شهرستان زابل به روش multiplex - pcr بود. این تحقیق بر روی 100 ایزوله باکتری استافیلوکوکوس اورئوس انجام گرفت. پس از استخراج dna به روش جوشاندن و با استفاده از روش pcr multiplex و پرایمرهای اختصاصی، ژنهای sccmec در این باکتری مورد شناسایی قرار گرفت. نتایج نشان می دهد از میان 100 ایزوله استافیلوکوک اورئوس، 5? تیپ i، 45? تیپ ii، 30? تیپ iii و 20? تیپ v بودند و sccmec ii در باکتریهای استافیلوکوک اورئوس جدا شده از بیمارستانهای منطقه سیستان غالب می باشد.