نام پژوهشگر: زهرا بدر

بررسی مارکرهای پلی مورفیک واقع در ناحیه ژن gcdh مرتبط با بیماری گلوتاریک اسیدیوریا
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه گیلان - دانشکده علوم پایه 1393
  زهرا بدر   صادق ولیان بروجنی

گلوتاریک اسیدیوریای نوع 1 (ga1) نوعی اختلال متابولیکی عصبی ارثی می باشد که در اثر جهش در ژن گلوتاریل کوادهیدروژناز (gcdh) ایجادمی شود. ga1 یک اختلال اتوزومی مغلوب ویکی ازعلل شایع آسیبهای متابولیکی حادمغزی در نوزادان وکودکان مبتلا است. اصولاً تشخیص مولکولی این بیماری با استفاده ازبررسی جهش¬های مسبب بیماری انجام می¬شود. اما به دلیل جهش های فراوان موجوددراین بیماری، تشخیص مستقیم با هزینه زیاد همراه بوده و بسیار وقت گیر است. لذا بررسی غیرمستقیم جهش ها با استفاده از آنالیز پیوستگی توسط مارکرهای چند شکلی متصل به ژن به عنوان روش جایگزین درخانواده¬های دارای یک فرد مبتلا پیشنهاد می¬شود. مارکر¬های چند شکلی متعددی در ناحیه¬ی ژنی gcdh گزارش شده¬اند. با بررسی بیوانفرماتیک مارکرهای مذکور، دو چند شکلی تک نوکلئوتیدی (snp) شامل rs11085824 و rs9384، به ترتیب واقع در ناحیه¬ی پروموتری و 3utr این ژن جهت مطالعه در جمعیت ایرانی انتخاب شدند. تعیین ژنوتیپ در 100 فرد غیر خویشاوند با استفاده از تکنیک arms pcr صورت گرفت. جهت تعیین فراوانی آللی- درجه¬ی هتروزیگوسیتی -فراوانی هاپلوتیپی و عدم تعادل پیوستگی از نرم افزارهای genepop و powermarker استفاده شد. فراوانی آلل a وg در مارکر rs11085824 به¬ترتیب 63/0% و 36/0% بود و در مارکر rs9384، فراوانی آلل های g و t به ترتیب 65/0% و 34/0% بدست آمد. هتروزیگوسیتی محاسبه شده برای مارکر rs11085824 ، 55/0% ، و برای مارکر rs9384 ، 53/0%، محاسبه گردید. در بررسی هاپلوتیپ ها، دو هاپلوتیپ¬a-g,g-t فراوانی بالای 5 % را در این جمعیت نشان دادند. همچنین نتایج بیانگر وجود عدم تعادل پیوستگی در جفت ¬مارکر rs11085824 و rs9384 می¬باشد. بطور کلی نتایج به دست آمده در این مطالعه، می تواند دو مارکر rs11085824 و rs9384 در ژن gcdh را در جمعیت ایرانی بعنوان مارکرهایی آگاهی¬دهنده در تشخیص¬های مولکولی گلوتاریک اسیدیوریای نوع 1 معرفی نماید.