نام پژوهشگر: سیدجواد ظهیری

پیشگویی پروتئین های ضدیخ با استفاده از روشهای محاسباتی مبتنی بر اطلاعات موجود در توالی
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه اراک - دانشکده فنی 1393
  مرتضی اسلامی   رضا رافع

برخی از موجودات سردزی پروتئینی به نام پروتئین های ضدیخ را تولید می کنند که مایع های سلول را دربرابر یخ زدگی محافظت می کنند. این دسته از پروتئین ها در افزایش تحمل دانه های گیاهان در برابریخ زدگی، نگهداری بافت ها در شرایط سرد و تولید گیاهان سردزی کاربرد دارند. شناسایی پروتئین های ضدیخ به خاطر شباهت بسیار کم توالی ها مشکل می باشد. برخی از محققین این موضوع را جهت مطالعه انتخاب کردند اما هنوز درصد دقت پیشگویی به مرز قابل قبولی نرسیده است. ما روشی برای تشخیص پروتئین های ضدیخ ارائه دادیم که از ماشین بردار پشتیبان به عنوان طبقه بندی کننده و اجتماع چهار دسته از ویژگی های آب دوستی، خواص فیزیکی وشیمیایی، درصد حضور اسید های آمینه و اطلاعات تکاملی به عنوان بردار ویژگی استفاده می کند. نتایج تجربی نشان می دهد که روش پیشنهادی کارایی بهتری نسبت به دیگر کارهای انجام شده مشابه در این زمینه دارد.