ماهی کپور معمولی(cyprinus carpio) جزء ماهیان آب شیرین است که از نظراقتصادی ارزش بالایی داشته و بطور گسترده در ایران پرورش داده می شود. وجود منابع زیاد آب شیرین در منطقه و همچنین سازگاری بالایی که کپور ماهیان با محیط اطراف خود دارند تولید و پرورش این ماهیان را آسان ساخته است. شناخت مسیر گوارشی برای درک فیزیولوژی و شرایط غیر طبیعی ضروری به نظر می رسد، در تحقیق حاضر بخش های مختلف دستگاه گوارش ماهی کپور معمولی از لحاظ آناتومی بررسی و سپس ساختار بافتی طبیعی و ویژگی های هیستوشیمیائی و فراساختار لایه مخاطی مری و روده در این نوع ماهی مورد مطالعه قرار گرفت. در این مطالعه 10 عدد ماهی کپور معمولی از استخرهای خاکی پرورش ماهی خانه سالمندان واقع در اردبیل تهیه شده بود، استفاده شد. طول تقریبی بدن تمامی نمونه ها 30-28 سانتی متر و میانگین وزنی بین 750-500 گرم بود. بعد از انتقال به آزمایشگاه (پس از خارج نمودن حیوان از آب) دیواره شکمی ماهی گشوده شده و نمونه های بافتی به ضخامت 6-5 میکرون از مری و قسمت های قدامی ، میانی و خلفی روده توسط اسکالپل تیز و به روش استاندارد تهیه گردید. نمونه های تهیه شده بلافاصله در فرمالین بافر ده درصد جهت تثبیت غوطه ور شدند. بعد از تثبیت نمونه ها، با روش متداول تهیه مقاطع بافتی، برش های میکروسکوپی تهیه و با استفاده از رنگ های هماتوکسیلین- ائوزین، پریودیک اسید شیف و آلسیان آبی رنگ آمیزی شدند. برای مطالعه با میکروسکوپ الکترونی (tem) قطعات کوچکی از مری و روده بکار برده شد. و نمونه ها برای تثبیت در یک محلول گلوترالدهید (25 درصد) و پارافورمالدهید (4 درصد) و بافر فسفاته قرار داده شد. و در مرحله دوم تثبیت در اسمیوم تتراکسید(2درصد) قرار گرفت. و سپس قطعات مورد مطالعه در یک سری درجات مشخص اتانول مورد شسته شو قرار گرفت. در نهایت قطعات آماده شده از قسمت روده(قدامی، میانی و خلفی) و مری توسط میکروسکوپ نوری و میکروسکوپ الکترونی(tem) مورد مطالعه قرار گرفتند.