استفاده بی رویه از کودهای شیمیایی موجب کاهش باروری خاک و در نتیجه کاهش کمی و کیفی محصولات تولیدی می شود. استفاده از ریز موجودات خاک به عنوان جایگزین های بیولوژیکی مصرف کودهای شیمیایی را کاهش داده و حاصلخیزی خاک و تولید محصول را افزایش می دهد. قارچ های میکوریز و اندوفیت ریشه (root endophytic) همزیست ریشه گیاهان بوده و بخش عمده عناصر غذایی مورد نیاز آن ها را تامین می نمایند. بررسی حاضر نشان داد که از بین تیمارهای مختلف استفاده شده بعد از تیمار کود شیمیایی، قارچ اندوفیت ریشه به نام sebacina vermifera توانست مقادیر بالاتری از عناصر غذایی گیاه برنج (نیتروژن و فسفر) را تامین و عملکرد دانه را افزایش دهد. این قارچ همزیست ریشه می تواند به عنوان جایگزین مناسبی برای کاهش قسمتی از مصرف کودهای شیمیایی به خصوص نیتروژن و فسفر در زراعت برنج غرقابی مطرح شود.