مطالعه ی ارتباط نشانگرهای snp با صفات وزن بدن در بلدرچین ژاپنی

شناسایی جایگاه های ژنی مرتبط با صفات کمی و برآورد پارامترهای مربوطه، فصل مشترک اصلاح نژاد سنتی و به کارگرفتن زیست فناوری های جدید در علم اصلاح نژاد است. صفات وزن بدن در حیوانات اهلی به دلیل ارتباط با سود اقتصادی از اهمیت بالایی برخوردار هستند. بلدرچین ژاپنی یکی از گونه های طیور است که به دلیل خصوصیات ژنتیکی و فاصله نسلی کوتاه مورد توجه محققین بسیاری است. پژوهش های ژنومی اندکی برای یافتن جایگاههای موثر بر صفات کمی (quantitative trait loci (qtl)) در این گونه صورت گرفته است. هدف از انجام این پژوهش، پویش ژنوم بلدرچین به منظور یافتن ارتباط نشانگرهای (single nucleotide polymorphism(snp)) با صفات وزن بدن بود. بدین منظور از داده های فنوتیپی 66 قطعه بلدرچین ژاپنی برای وزن بدن هنگام تولد، 64 قطعه برای وزن یک هفتگی و 105 قطعه برای اوزان دو هفتگی، سه هفتگی و چهار هفتگی با داده های ژنوتیپی 12798 نشانگر snp استفاده گردید. ابتدا با روش تک نشانگری نشانگرهای موثر شناسایی شدند. سپس همبستگی بین صفات مورد بررسی برآورد گردید که بالاترین همبستگی بین وزن سه هفتگی و چهار هفتگی و به مقدار 96 درصد بود. پس از آن نشانگرهای مشترک بین آن ها شناسایی گردید. که بالاترین تعداد نشانگر موثر معنی دار نیز بین وزن های سه هفتگی و چهار هفتگی بود. در مرحله ی بعد براساس آزمون معنی داری (از 0/5 تا 5 درصد) واریانس خطا در سطح 5 درصد با دیگر سطوح مورد مقایسه قرار گرفت و سطح معنی داری% 0/8 برای وزن بدن در هنگام تولد7/0% برای وزن یک هفتگی 2% برای وزن های دو هفتگی، سه هفتگی و چهار هفتگی به عنوان سطح بهینه انتخاب شد و با استفاده از روش bayesc? داده ها به صورت توأم تجزیه و تحلیل شدند. در مرحله سوم برای معنی دار بودن اثر snp ها از آزمون bootstrap با 10000 تکرار برای برآورد فاصله باوراستفاده شد. نتایج نشان داد در فواصل باور 95% و 99% برای وزن های بدن در هنگام تولد و یک هفتگی هیچ snpی معنی دار شناخته نشد. برای وزن بدن در دو هفتگی به ترتیب 9و 3 برای وزن سه هفتگی 13 و 22 و برای وزن چهارهفتگی 36 و 57 عدد نشانگر معنی دار شناسایی شد. واریانس فنوتیپی برای پنج صفت ذکر شده برآورد گردید. سپس میزان واریانس توجیه شده توسط هر نشانگر از واریانس فنوتیپی محاسبه گردید که این مقدار به ترتیب برای وزن دو هفتگی 3/958 درصد، برای وزن سه هفتگی 502/4 و برای وزن چهار هفتگی 12/05بود. با توجه به نتایج به دست آمده می توان نتیجه گرفت که صفات وزن بدن توسط ژن هایی کنترل می شود که اثر متوسطی تا بزرگی بر روی این صفات دارند.