نام پژوهشگر: محمد حسین سنگتراش

تاثیر عامل ازدحام بر سرعت تشکیل آمیلوئید در آلفا-لاکتالبومین و اصلاح آن به وسیله مولکول چاپرون آلفا-کازئین
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه سیستان و بلوچستان - دانشکده علوم 1388
  نسیم فریدی   آرزو قهقایی

فیبریل های آمیلوئید از متراکم شدن کند حالت های حد واسط تا حدی تا خورده پروتئین ناشی می شود. در این مطالعه ما کینتیک تشکیل فیبریل آلفا-لاکتالبومین و جلوگیری از تشکیل آن به وسیله s?-کازئین در حضور و غیاب عامل ازدحام دکستران (kda 68( را مقایسه کردیم. نتایج ما نشان می دهد که s?-کازئین یک مولکول چاپرون که در شیر گاو یافت می شود و بعضی از ویژگی های پروتئین های شوک حرارتی کوچک (shsp) را نشان می دهد در محیط in vitro از تولید فیبریل ها ی آمیلوئید در آلفا-لاکتالبومین جلوگیری می کند. s?-کازئین به عنوان یک مولکول چاپرون برای جلوگیری از استرس های تحمیل شده و تشکیل آمیلوئید پروتئین هدف عمل می کند. بنابراین اثر آلفا-کازئین در جلوگیری از تشکیل فیبریل با اهمیت است اگرچه در مقایسه با غیاب دکستران فعالیت چاپرونی آلفا-کازئین در in vitro برای جلوگیری از تشکیل آمیلوئید آلفا-لاکتالبومین در حضور دکستران کاهش می یابد. بر هم کنش بین چاپرون و آلفا-لاکتالبومین و تغییرات ساختاری در پروتئین هدف به وسیله شدت فلورسانس ذاتی، سنجش یا بررسی اتصال ans، اسپکتروسکوپی cd و کروماتوگرافی فیلتراسیون ژلی hplc نشان داده شده است. به طور خلاصه آلفا-کازئین با آلفا-لاکتالبومین بر هم کنش می کند و از تشکیل آمیلوئید جلوگیری می کند اما این عمل را در حضور عانل ازدحام دکستران به خوبی انجام نمی دهد.

بررسی فیتوشیمیایی گیاهteucrium orientale جمع آوری شده از دهبکری جیرفت
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه سیستان و بلوچستان - دانشکده علوم پایه 1391
  روح اله ارجمندی   محمد حسین سنگتراش

جنس teucrium متعلق به تیره ی نعناعlamiaceae است. هدف از این تحقیق استخراج اسانس و نیز اندازه گیری فعالیت آنتی اکسیدانی عصاره های گونه ی teucrium orientale است. گیاه در دوره ی گل دهی از منطقه ی دهبکری واقع در جیرفت استان کرمان جمع آوری گردید. قسمت های هوایی گیاه شامل گل و برگ در سایه خشک و سپس آسیاب شد. مقدار 300 گرم از نمونه به درون کلونجر قرار داده شد و پس از 4 ساعت اسانس گیری انجام شد. آب گیری از اسانس توسط نمک سولفات سدیم صورت پذیرفت. اسانس حاصل تا قبل از آنالیز در دمای 4 تا 5 درجه سانتی گراد قرار داده شد. آنالیز توسط دستگاه gc/ms انجام گردید. در حدود 40 ترکیب شناسایی شد. اصلی ترین اجزا شامل بیس (2- اتیل هگزیل) فتالات (42/15%)، بتا کوببن (91/6%)، ترانس کاریوفیلن (30/6%)، کامفور (90/5%) و کاریوفیلن اکساید (79/5%) می باشد. همچنین بر روی عصاره های اتانولی، اتیل استاتی و کلروفرمی این گیاه، خواص آنتی اکسیدانی به روش dpph بررسی گردید، که در مقایسه با آنتی اکسیدان سنتزی bht، عصاره ی اتانولی نسبت به دیگر عصاره ها فعالیت بیشتری از خود نشان داد.

بررسی متیلاسیون و بیان ژن های سرکوب کننده تومور p14 ,p15 در بیماری ناخنک چشمpterygium
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه سیستان و بلوچستان - دانشکده علوم پایه 1391
  رباب پوینده پور   محمد حسین سنگتراش

معرفی: بیماری ناخنک چشم ، یک بافت پارانشیمی رگدار، در سطح چشم است ، که به صورت پیش رونده رشد کرده و گاهی بینایی را تهدید می نماید.دلایل بوجود آورنده این ضایعه هنوز به صورت واضح روشن نشده است.شواهد اخیر حاکی از آن است که ، این ضایعه بیشتر میتواند نوعی ایجاد بافت جدید باشد تا آسیب بافتی ، که در اثر اشعه uvموجود در نور خورشید بوجود می آید.مطالعه حاضر ، رابطه متیلاسیون پروموتور ژنهای p14 arf و p15ink4b را با ناخنک چشم بررسی نموده است. مواد و روشها : متیلاسیون پروموتور ژنهای p14arf و p15ink4b توسط تکنیک msp بر روی 81 بافت ناخنک چشم و 75بافت سالم چشمی ،انجام گرفت .بیان این ژنها نیز با تکنیک real-time pcrبرروی 23 نمونه بیمار و 18 نمونه سالم انجام شد. نتایج : بر اساس یافته های این تحقیق ، درصد متیلاسیون برای p14arf 5/35% و 66/18% به صورت کاملا متیله و7/56% و 66/78% به صورت متیله /غیر متیله به ترتیب در نمونه های بیمار و سالم به دست آمد.بررسی متیلاسیون p15ink4b نیز 16/27% و 66/2%متیلاسیون کامل و 37/70% و 33/69% متیلاسیون ناکامل را برای نمونه های ناخنک چشم و ملتحمه سالم ، نشان داد .وضعیت متیلاسیون پروموتور ژنهای p14arf و p15ink4b بین نمونه های سالم و بیمار به صورت معنی داری متفاوت است.(05/0p<) .اما دربررسی بیان p14arf و p15ink4b بین دو گروه بیمار و شاهد ، رابطه معنا دار آماری شناسایی نشد. بحث : با بررسی نتایج مشاهده شده می توان بیان نمود که وضعیت متیلاسیون ژنهای p14arf و p15ink4b نقش مهمی در بوجود آمدن ناخنک چشم ، ایفا می نماید ، از این رو ، لزوم مطالعه های آتی بر روی تعداد بیشتر نمونه را، به ذهن متبادر می سازد.

بررسی فراوانی پلی مورفیسم c100t در ژن cyp2d6 در اقوام مختلف ایران
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه سیستان و بلوچستان - پژوهشکده علوم پایه کاربردی 1392
  علی باقری   مسعود هوشمند

مقدمه: ژن cyp2d6 عضوی از خانواده ژن های سیتوکروم p450 است که حدود 7 واریانت دارد. در بین این واریانت ها آلل cyp2d6*10 در بین آسیایی ها شایع است که فراوانی این آلل حدود 33% - 69% می باشد . وجود این آلل با کاهش متابولیسم سوبستراهای مختلف cyp2d6 در ارتباط است. دو واریانت شناخته شده از آلل cyp2d6*10 وجود دارد که شامل cyp2d6*10a و cyp2d6*10b میباشد. جهش در آلل cyp2d6*10a شامل ) c100t,g1749c,g4268c ( و جهش در آلل cyp2d6*10b شامل ) c1127t ( می باشد که این تغییرات در اگزون 1 از ژن cyp2d6 وجود دارد. بطور کلی موتاسیون c100t اصلی ترین جهش در هر دو واریانت cyp2d6*10 محسوب می شود. هدف: در این تحقیق ما بدنبال تخمین درصد حضور پلی مورفیسم c100t در آلل cyp2d6*10 در بین اقوام مختلف ایرانی می باشیم. از آنجایی که این آلل، دارای اثرات متفاوت بر متابولیسم دارو است لذا این آلل جهت بررسی ژنوتیپی انتخاب شده است. روش آزمایش:به منظور شناسایی پلی مورفیسم c100t و بررسی اثرات دارویی آن از 77 نفر فرد سالم که از اقوام مختلف بودند نمونه خون تام گرفته شد و برای بررسی وجود این پلی مورفیسم در افراد در این مرحله از تکنیک rflp و sscp استفاده شد. نتایج: بعد از بررسی نمونه ها و تجزیه و تحلیل داده ها مشخص شد که حدود 24.3% از ایرانیان دارای آلل هموزیگوت موتانت cyp2d6*10 ، 15 % هتروزیگوت و 7700 % دارای آلل وحشی از ژن cyp2d6*10 می باشند.که از این تعداد، حدود 30 % از زنان و 52 % از مردان برای این آلل هموزیگوتند. بحث: از آنجائی که فراوانی آلل cyp2d6 * 10 در ایران حدود 3.42 % است و وجود این آلل هم باعث کاهش متابولیسم و هم باعث واکنش های مضر داروئی میشود پس باید افراد دارای این آلل شناسائی شوند تا هم اثر بخشی دارو در این افراد با تجویز دز داروئی خاص بیشتر شود و هم از اثرات مضر داروئی کاسته شود. از طرفی هم با این کار می توان از خروج بیش از اندازه ارز از ایران جلوگیری کرد.

بررسی پلی مورفیسم ژن cyp2c19*3 در اقوام ایرانی
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه سیستان و بلوچستان - دانشکده علوم پایه 1392
  مهشید ده بزرگی   مسعود هوشمند

فارماکوژنتیک علم مطالعه دارو ها و بررسی اثر متقابل دارو ها و ژنوتیپ افراد است ، دارو های واحد اثرات متفاوتی در افراد مختلف دارند، برخی افراد برای دستیابی به اثر درمانی مشابه با دیگران به دوز کمتر یا بیشتری از دارو نیاز دارند. گاهی یک دارو هیچ اثر درمانی در برخی ندارد، گاهی دارویی که بیشتر مردم بدون مشکل مصرف می کنند برای اندکی از بیماران سبب واکنش های مضر می شود، گروهی از این واکنش های مضر دارویی و عدم پاسخ به یک دارو در نتیجه سرعت های متفاوت متابولیسم دارو هایی است که وارد بدن می شوند. گروهی از دارو ها به صورت پیش دارو مصرف می شوند که باید در کبد متابولیزه شده و به فرم فعال دارو تبدیل شوندتا اثرات درمانی خود را بگذارند و بعضی دارو ها به صورت فعال وارد بدن می شوند که باید به سرعت در کبد متابولیزه و از بدن دفع شوند. وجود snp ها و آللهای متفاوت در افراد مختلف سرعت این واکنش های متابولیسم را تغییر می دهد و باعث عدم تاثیر دارو یا اثرات جانبی مضر مثل over dose می گردد. snp ها از نسلی به نسل دیگر قابل به ارث رسیدن هستند بنابراین قومیت های مختلف می توانند الگوی وراثتی مشابهی از نظر آللی یا snpبرای یک ژن داشته باشند. snpها علاوه بر تعیین پاسخ ویژه به دارو به عنوان مارکرها بیولوژیکی عمل می کنند که به دانشمندان در پیدا کردن مکان ژنهای عامل بیماری، تعیین ریسک بیماری هایی مثل بیماری های قلبی، دیابت و سرطان، بررسی الگوی توارث از نسلی به نسل دیگر، و در امور جنایی و قضایی مثل رابطه پدر و فرزندی کمک می کند. در این پژوهش ما 300 نفر از قومیت های مختلف ایرانی را جهت یافتن آلل cyp2c19*3 مورد بررسی قرار دادیم. در این پژوهش برای یافتن پلی مورفیسم) 636 g>a ( ، dna را از خون استخراج کردیم ، سپس اگزون 4 از ژن cyp2c19 را تکثیر و سپس با دو تکنیک rflp و sscp این پلی مورفیسم را جستجو کردیم و در نهایت برای تائید نتایج دو تکنیک قبل از روش sequencing استفاده کردیم، که همه این روش ها یک نتیجه را تائید کردند که در هیچ یک از این افراد و قومیت های ایرانی snp یافت نشد و تمام نمونه ها نرمال گزارش شدند. مشابه این نتایج در شمال هندوستان، عربستان، و در نژاد قفقازی مثل امریکا، کانادا، دانمارک، آلمان ، پرتغال، استرالیا و زیمبابوه گزارش شده است .

بررسی شیوع موتاسیون trp187arg در ژن fxiiia در بیماران مبتلا به هموفیلی
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه سیستان و بلوچستان - دانشکده علوم پایه 1392
  یاسمن گرمه ای   ابراهیم میری مقدم

فاکتور 13، آنزیم ضروری آخرین مرحله آبشار انعقادی است. اکثر اختلالات ارثی آن نتیجه جهش در ژن زیر واحد aمی باشد. شیوع این بیماری در جهان 1 در 2 میلیون نفر است. علیرغم نادر بودن، آمار بالای مراجعین با علائم کمبود فاکتور 13 در قومیت بلوچ در جنوب شرقی ایران، ما را بر آن داشت تا به مطالعه ای هدفمند برای بررسی علت مولکولی این اختلال بپردازیم. لذا این تحقیق به منظور بررسی جهش شایع trp187arg در ژن fxiiia که در پژوهش های قبلی به عنوان یکی از فاکتور های اصلی ابتلا به این بیماری مطرح شده بود، انجام شد. هدف: تعیین موتاسیون شایع در بیماران دچار کمبود فاکتور xiii در جنوب شرقی ایران روش کار: ابتدا نمونه خون 180بیمار تهیه و dnaآنها با روش salting out استخراج گردید. سپس جهش trp187arg در اگزون 4 زنجیره aبا روش tetra arms-pcrتوسط پرایمرهای اختصاصی غربالگری گردید. بیماران فاقد این جهش نیز از نظر وجود سایر جهش ها در اگزون 4 توسط سکانس ارزیابی شدند. نتایج: 174 بیمار، موتاسیون جایگزینی c به جایtو تغییر در رمز تریپتوفان به آرژینین را بصورت هموزیگوت داشتند. بحث: این جهش می تواند سبب افت شدید فعالیت آنزیم گردد. تاکنون پژوهشی درخصوص کمبود فاکتور xiii در این ابعاد وسیع در کشور انجام نشده بود و این بررسی جامع نشان داد جهشtrp187arg شایع ترین جهش و از عوامل اصلی ابتلا به نقص فاکتورxiii در جنوب شرقی ایران است. از طرفی همه بیماران ازقوم بلوچ بودند و رواج ازدواج های فامیلی بین افراد این قوم علت اصلی انتقال جهش است. لذا با توجه به نتایج این مطالعه شناسایی جهش اکثر جمعیت مورد نظر، مشاوره ژنتیک هدفمند و انجام روش های pnd بهترین روش پیشگیری از تولد فرزندان با اختلالات ارثی نقص فاکتور 13 در این جمعیت می باشد.

کشت درون شیشه ای موز رقم دوارف کاوندیش و مطالعه بیان ژن maasr1 تحت تیمار شوری
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه سیستان و بلوچستان - دانشکده علوم پایه 1393
  عبدالواحد قربانی دادکانی   حسین پیری

تنش های محیطی و از جمله شوری از مهم ترین عوامل محدود کننده در تولید محصولات کشاورزی به شمار میروند. بهبود ژنتیکی موز برای تولید هیبرید های بهتر حائز اهمیت است. روش های جدید ، مبتنی بر کشت بافت می باشند. پروتئین asr در هسته و سیتوپلاسم واقع شده است و عملکرد آن در تنظیم رونویسی است . خانواده ژنی asr تحت شریط مختلف تنش محیطی ، و در طی رسیدگی میوه دچار فراتنظیمی می شوند . asr1 یک پروتئین با وزن مولکولی کم و بار الکتریکی بالا است که بروز آن ناشی از تنش نمک ، تنش آب ، و پرداخت با اسید آبسزیک است . در این مطالعه ما ژن کامل القا کننده aba به نام maasr1 از برگ موز را که بر اساس cdna و با روش rt-pcr از یک تک کلون dwarf cavendish که در محیط ms کشت و تکثیر داده شده و با غلظت 250 میلی مولار nacl در زمان های 0 ، 6 ، 12 ، 24 و 48 ساعت تیمار داده شده بود به دست آوردیم و با الکتروفورز ژل آگارز مورد بررسی قرار گرفت . این مطالعه نشان داد که بیان maasr1 در برگ موز تحت استرس نمک القا شده و بیان بالای maasr1 سبب بهبود تحمل گیاه نسبت به تنش شوری می شود . با انجام مطالعات بیشتر برای شناسایی ژن های هدف مستقیم maasr1 با استفاده از روش chip و مکانیسم های سلولی maasr1 در هسته و غشای پلاسمایی همچنین مطالعات بیشتر بر روی بیان ژن های aba/stress-respnsive و تاثیر آن ها بر شوری و بررسی ساختار و عملکرد رسپتورهای آبسزیک اسید در تنش های شوری بهتر می توان به نقش و اهمیت ژن maasr1 در تحمل به تنش شوری پی برد .

بررسی تنوع ژنتیکی عملکرد ، اجزا عملکرد و چند صفت کمی مهم و روابط آنها در گندم دوروم با استفاده از روشهای آماری چند متغیره
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه سیستان و بلوچستان 1381
  علیرضا ابوالحسنی زراعتکار   محمد حسین سنگتراش

به منظور مطالعه تنوع ژنتیکی خصوصیات مورفولوژیک بررسی روابط صفات مختلف با یکدیگر و با عملکرد دانه ، شناخت مبانی مورفولوژیکی اختلاف عملکرد و عوامل پنهانی موثر بر آن درگندم دوروم ، آزمایش در سال 1379 در مزرعه تحقیقاتی آموزشکده کشاورزی رضوان کرمان اجر گردید. تفاوتهای بسیار معنی داری بین ژنوتیپ ها برای کلیه صفات مورد بررسی مشاهده شد . بیشترین ضریب تنوع فنوتیپی مربوط به صفات عملکرد دانه ، عملکرد بیولوژیک ، طول اکستراژن ، عملکرد کاه و کلشن و تعداد بوته در متر مربع بود.طبق نتایج تجزیه همبستگی ساده فنوتیپی ، عملکرد بیولوژیک ، شاخص برداشت ، تعداد بوته در متر مربع و تعداد دانه در سنبله همبستگی مثبت و بسیار معنی داری با عملکرد دانه داشتند . نتایج حاصل از رگرسیون چند گانه مرحله ای نشان داد که حداکثر اختلاف عملکرد دانه لاین ها را می توان به عملکرد بیولوژیک ، شاخص برداشت ، تعداد بوته در مترمربع و تعداد دانه در سنبله نسبت داد. نتایج تجزیه علیت نیز تاکید بر نقش مهم این چهار صفت در تغییر پذیری عملکرد دانه داشت. صفات ارتفاع ، طول اکستراژن ، طول سنبله و عملکرد کاه و کلشن از طریق تاثیر بر اجزای مزبور نقش قابل ملاحظه ای در تغییر عملکرد دانه ایفا نمودند.تجزیه به عامل ها علاوه بر تاکید بر نقش اجزا عملکرد پنج عامل پنهانی موثر در عملکرد را که63/77 درصد تغییرات عملکرد را توجیه می کرد ، استخراج نمود که با توجه به الگوی متغیرها تحت عنوان عوامل عملکرد ، معماری گیاه ، خصوصیات سنبله ، توان انتقال مواد فتوسنتزی به دانه گیاه و خصوصیات برگ پرچم نامگذاری شدند. و مشخص شد که این عوامل تعیین کننده مبدا و مقصد های فیزیولوژیک هستند. در مجموع استنباط شد که برای اصلاح ارقام گندم دوروم با عملکرد بالا باید گیاهانی با رشد سبزینه ای بالا در یک مدت کوتاه ، سرعت و توان بالا برای انتقال مواد فتوسنتزی به دانه و تعداد بوته در واحد سطح بالا انتخاب کرد.