نام پژوهشگر: فریبا خلیلی

کلونینگ و تخلیص پروتئین s100a9 از نوتروفیل های پلاسمای انسان و تولید این پروتئین بصورت نوترکیب
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه کردستان 1390
  فریبا خلیلی   مطصفی قانعی

چکیده پروتئین های s100، گروهی از پروتئین های سیتوپلاسمی چندژنی می باشند که به یون کلسیم ca2+ متصل می شوند. این پروتئین ها جزء پروتئین های اسیدی کوچک (10-12 کیلودالتونی) هستند که منحصرا در مهره-داران یافت می شوند. بیش از 40 سال پیش نخستین اعضای خانواده پروتئینی کشف و از مغز گاو تخلیص شد. علت نامگذاری این پروتئین به s100 حلالیت100% آنها در محلول سولفات آمونیوم می باشد. اغلب ژنـهای s100 دریک مجموعه ژنی در ناحیــه ای واقع در قطعه 21 بازوی بلند کروموزوم شماره یک ( 1q21 ) انسان قرار دارند. این ناحیه مسئول بسیاری از ناهنجاری های کروموزومی محسوب می شود. یکی از پروتین های خانواده s100 ، پروتئین s100a9 است که یک پروتیئن متصل شونده به یون کلسیم و دارای 113 اسید امینه با وزن مولکولی 13 کیلو دالتون می باشد. این پروتئین از فاگوسیت های فعال شده آزاد می شود و به طور مستقیم سلول های اندوتلیال و فاگوسیت های تک هسته ای و لنفوسیت ها را از طریق بر هم کنش با گیرنده rage و tlr- 4 فعال می کند. پروتئین s100a9 از جمله واسطه های مولکولی مهم در بسیاری از بیماریها از جمله آرتریت التهابی، تصلب شرایین و عفونتهای میکروبی می باشد. s100a8 و s100a9 چون دارای نقش دو گانه ای در خارج و داخل سلول دارند فعالیت خود را به صورت هترو دایمر s100a8/a9 انجام می دهند. هترو دایمر s100a8/a9 دارای عملکرد های ایمونولوژیکی متفاوتی است از جمله : در فعالیتهای وابسته به کلسیم در طی التهاب نقش مهمی دارد. این نقش شامل فعالسازی mac-1 و اینتگرین ?2 می باشد که در اتصال نوتروفیل به سلولهای پوششی شرکت می نماید. دراین تحقیق ، بعد از طراحی پرایمر برای ژن s100a9 ، واکنش pcr برای تکثیر این ژن انجام گرفت. بعد از آن محصول pcr در ناقل بیانی pet-28a+ کلون شد. ناقل نوترکیب به سویه باکتری e.coli bl21de3 انتقال یافته و به وسیله iptg القاء شد. بیان پروتیئن مذکور در سویه باکتری e.coli bl21de3 مورد ارزیابی قرار گرفت و به وسیله واکنش ایمونوبلاتینگ تایید شد. فرآیند بیان با تغییر 3 پارامتر اصلی ( زمان- دما- غلظت iptg) بهینه شد. بهینه سازی نشان داد که میزان بالایی از پروتیئن نوترکیب s100a9 بر روی ژل مشاهده می شود. بهترین شرایط بیان دردمای 37 درجه سانتی گراد ، مدت زمان 12ساعت بعد از غلظت mm /5 از iptg ایجاد می شود درنهایت پروتیئن نوترکیبs100a9 به وسیله ستون نیکل تخلیص شد. واژگان کلیدی : پروتئین s100a9 ، کلون کردن، بیان، تخلیص پروتئین

کلونینگ و تخلیص پروتئین s100a9 از نوتروفیل های پلاسمای انسان و تولید این پروتئین بصورت نوترکیب
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه کردستان - دانشکده علوم پایه 1390
  فریبا خلیلی   مصطفی قانعی

چکیده پروتئین های s100، گروهی از پروتئین های سیتوپلاسمی چندژنی می باشند که به یون کلسیم ca2+ متصل می شوند. این پروتئین ها جزء پروتئین های اسیدی کوچک (10-12 کیلودالتونی) هستند که منحصرا در مهره-داران یافت می شوند. بیش از 40 سال پیش نخستین اعضای خانواده پروتئینی کشف و از مغز گاو تخلیص شد. علت نامگذاری این پروتئین به s100 حلالیت100% آنها در محلول سولفات آمونیوم می باشد. اغلب ژنـهای s100 دریک مجموعه ژنی در ناحیــه ای واقع در قطعه 21 بازوی بلند کروموزوم شماره یک ( 1q21 ) انسان قرار دارند. این ناحیه مسئول بسیاری از ناهنجاری های کروموزومی محسوب می شود. یکی از پروتین های خانواده s100 ، پروتئین s100a9 است که یک پروتیئن متصل شونده به یون کلسیم و دارای 113 اسید امینه با وزن مولکولی 13 کیلو دالتون می باشد. این پروتئین از فاگوسیت های فعال شده آزاد می شود و به طور مستقیم سلول های اندوتلیال و فاگوسیت های تک هسته ای و لنفوسیت ها را از طریق بر هم کنش با گیرنده rage و tlr- 4 فعال می کند. پروتئین s100a9 از جمله واسطه های مولکولی مهم در بسیاری از بیماریها از جمله آرتریت التهابی، تصلب شرایین و عفونتهای میکروبی می باشد. s100a8 و s100a9 چون دارای نقش دو گانه ای در خارج و داخل سلول دارند فعالیت خود را به صورت هترو دایمر s100a8/a9 انجام می دهند. هترو دایمر s100a8/a9 دارای عملکرد های ایمونولوژیکی متفاوتی است از جمله : در فعالیتهای وابسته به کلسیم در طی التهاب نقش مهمی دارد. این نقش شامل فعالسازی mac-1 و اینتگرین ?2 می باشد که در اتصال نوتروفیل به سلولهای پوششی شرکت می نماید. دراین تحقیق ، بعد از طراحی پرایمر برای ژن s100a9 ، واکنش pcr برای تکثیر این ژن انجام گرفت. بعد از آن محصول pcr در ناقل بیانی pet-28a+ کلون شد. ناقل نوترکیب به سویه باکتری e.coli bl21de3 انتقال یافته و به وسیله iptg القاء شد. بیان پروتیئن مذکور در سویه باکتری e.coli bl21de3 مورد ارزیابی قرار گرفت و به وسیله واکنش ایمونوبلاتینگ تایید شد. فرآیند بیان با تغییر 3 پارامتر اصلی ( زمان- دما- غلظت iptg) بهینه شد. بهینه سازی نشان داد که میزان بالایی از پروتیئن نوترکیب s100a9 بر روی ژل مشاهده می شود. بهترین شرایط بیان دردمای 37 درجه سانتی گراد ، مدت زمان 12ساعت بعد از غلظت mm /5 از iptg ایجاد می شود درنهایت پروتیئن نوترکیبs100a9 به وسیله ستون نیکل تخلیص شد. واژگان کلیدی : پروتئین s100a9 ، کلون کردن، بیان، تخلیص پروتئین

بازیابی آهن از منابع اکسیدی آن
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز 1379
  فریبا خلیلی   محسن موسوی

در این تحقیق بازیافت پس ماند یک کارخانه ذوب فلز که حاوی درصد بالایی از آهن اکسیدی می باشد به روش استخراج با اسیدکلریدریک مورد بررسی قرار گرفته است . محصول بدست آمده کلروفریک می باشد که کاربرد زیادی در صنعت تصفیه آب و لخته سازی دارد. در این تحقیق هدف اصلی تعیین سینتیک واکنش اسید با پس ماند می باشد. برای رسیدن به این هدف ، پس از تعیین ویژگیهای ماده پس ماند و بررسی و شناخت فرآیند، چند گروه آزمایش طراحی گردیده است که بر اساس آنها اثر پارامترهای مهم از جمله غلظت حلال، سایز ذرات پس ماند، دما و دور همزن بر روی سرعت استخراج پس ماند بوسیله اسید، مورد بررسی قرار گرفته است . این آزمایشها در راکتورهای ناپیوسته همزن دار که دارای قابلیت کنترل دما و درو همزن هستند انجام گرفته است . نتایج حاصله حاکی از آنستکه واکنش شیمیایی مرحله کنترل کننده سرعت واکنش بین اسید و پس ماند می باشد. بعلاوه ملاحظه می شود که برای ذرات جامد اندازه قطر ذرات تاثیری بر روی سینتیک انحلال ندارد. همچنین نتایج حاصل از بررسی اثر غلظت حلال نشان می دهد که سرعت واکنش نسبت به این پارامتر از درجه 2/5 می باشد. چنانچه به جای غلظت اسید از اکتیوتیه یون ئیدروژن در محلول برای تعیین سینتیک واکنش انحلال استفاده گردد نتایج حاصل نشان می دهد که سرعت واکنش نسبت به این پارامتر از درجه 1 می باشد. برای بیان اثر دما انرژی اکتیواسیون واکنش انحلال معین شده است که مقدار آن 43/22 kj/mol بدست آمده است . با استفاده از مدل هسته ترکیب نشده رابطه ایی جهت تعیین میزان انحلال آهن در هر زمان بدست آمده است .