نام پژوهشگر: محسن طاهری

بررسی ژنهای موجد مقاومت به شیمی درمانی (mrp1,mdr1) در مبتلایان به سرطان پستان
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک وزیست فناوری 1388
  محسن طاهری   فروزنده محجوبی

یکی از مشکلات دردرمان بیماران مبتلا به سرطان مقاومت دارویی است ،به طوری که این بیماران نسبت به داروهای مختلف که مکانیسم های اثرمتفاوتی دارند مقاوم می شوند. مقاومت دارویی پدیده پیچیده ای است که در آن ژن های متعددی که تنظیم کننده انتقال دارو، ترمیم سلولی، خنثی کردن سموم ومتابولیسم داروها می باشند نقش دارند.با این وجود در اغلب رده های سلولی و بیماران سرطانی افزایش فعالیت ژن های abc transporter می تواند اساس فنوتیپ مقاومت باشد.افزایش فعالیت ژن های فوق در بسیاری از سیستم های in vitro دیده شده است. با این حال اهمیت کلینیکی آن در بیماران سرطانی مشخص نیست. هدف از این تحقیق بررسی بیان ژن های mdr1،mrp1 ،bcrp ،lrp در بافت تومورال و مجاور تومور بیماران مبتلا به سرطان پستان و یافتن ارتباط احتمالی میان سطح بیان این ژن ها و پیامدهای کلینیکی وپاسخ به درمان است. علاوه بر آن اثر پلی مرفیسم c3435t بر بیان ژن mdr1 و پاسخگویی به درمان وعلائم کلینیکی وپاراکلینیکی مورد بررسی قرارگرفت. در این تحقیق بیان ژنهای فوق در54 بیمار مبتلا به سرطان پستان مراجعه کننده به بیمارستان امام خمینی تهران با استفاده از real time rt-pcr و فلوسایتومتری ارزیابی شد و با نوع پاسخ بیماران به داروهای شیمی درمانی مقایسه گردید. همچنین پلی مرفیسم c3435t ژن mdr1 توسط تکنیک pcr-rflp موردارزیابی قرارگرفت. بیان ژن lrp, mrp1, mdr1 در بافت تومورال بیماران نسبت به بافت سالم مجاور تومور به طور معنی دار افزایش پیداکرده بود. در حالیکه بیان ژن bcrp در بافت سالم نسبت به بافت تومورال افزایش نشان می دهد. همچنین در ارتباط با اثر بیان این ژنها بر پاسخ به درمان دیده شد که بیان ژنهای lrp, mrp1 در بیمارانی که به درمان پاسخ داده اند به طور معنی داری نسبت به بیمارانی که به درمان پاسخ نداده اند پائین تر می باشد در حالی که در مورد ژنهای bcrp, mdr1 دیده شد هر چند که بیان آن در بیمارانی که به درمان پاسخ داده اند پائین تر است اما این اختلاف معنی دار نمی باشد. نتایج فلوسایتومتری نیز نشان داد که بیان ژن های mrp1,mdr1 در بافت سالم مجاور تومور به طور معنی داری نسبت به بافت تومورال کاهش نشان می دهد. همچنین آنالیز همبستگی نشان داد که بیان mrp1,mdr1 در سطح mrna و پروتئین با همدیگر همبستگی دارد. بین بیان ژنهای فوق وعلائم کلینیکی وپاراکلینیکی مانند اندازه تومور، گرید بافتی ،در گیر غدد لنفاوی و... ارتیاطی دیده نشد. 18% بیماران ژنوتیپ cc، 56% ژنوتیپ ct و26% هم ژنوتیپ tt داشتند درحالیکه درگروه کنترل ژنوتیپ cc در 23%، ژنوتیپ ct در50% وژنوتیپ tt در27% افراددیده شد.گروه کنترل وبیماران ازنظرفراوانی آللها و ژنوتیپ باهم تفاوت معنی داری نداشتند. نتایج حاصل از اندازه گیری بیان ژن mdr1 نشان داد که بیان این ژن در مبتلایان به سرطان پستان با ژنوتیپ های متفاوت، اختلاف آماری معنی داری دیده می شود در گروه بیماران افراد دارای ژنوتیپ tt بیان کمتری نسبت به ژنوتیپ cc وct داشتند. همچنین بین کسانی که به درمان پاسخ داده بودند و آنهایی که به درمان پاسخ نداده بودند از نظر فراوانی ژنوتیپ تفاوت معنی داری دیده نشد. علائم ویافته های کلینیکی و پاتولوژی نیز با ژنوتیپ ارتباطی نشان نداد. در مجموع با توجه به نتایج ما ودیگر محققین به نظر می رسد که mrp1 و lrp به عنوان یک فاکتور پیش آگهی و معیاری برای ارزیابی پاسخ به درمان می توانند بسیار مفید باشند در حالی که در مورد mdr1 و bcrpنیاز به کار بیشتر و انجام مطالعات بشتری احساس می شود.

بررسی ارتباط بین پلی مورفیسم برخی ژن های خانوادهgst (p1,t1,m1) و خطرابتلا به وزیکویورترال ریفلاکس (vur)
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه سیستان و بلوچستان - دانشکده علوم پایه 1391
  سیما شاهرخ زاده   درمحمد کردی تمندانی

پیش زمینه: vur (وزیکویورترال ریفلاکس) یا بازگشت جریان ادرار، به حالب ها وعموما به کلیه ها، یک اختلال عملکردی یا آناتومیکی است. vur نوع اولیه، رایج ترین ناهنجاری مادرزادی مجاری ادراری در کودکان است؛ که اغلب بعد از عفونت مجاری ادراری تشخیص داده می شود. نوع دوم vur از فشار بالای مثانه بوجود می آید (عوامل عصبی/انسداد خروجی مثانه) یا نگه داشتن ادرار. vur با استفاده از تکنیک های رادیولوژی و رادیوایزوتوپی که مداخلات تهاجمی هستند، تشخیص داده می شود. درجه ی شیوع vur در کودکان سالم %1 تخمین زده شده است و در دختران رایج تر از پسران است. به دلیل شیوع بالا، شدت بیماری، مشکلات درمان و تاثیر فاکتورهای ژنتیکی در این بیماری، بررسی ژن های درگیر امری ضروری بنظر می رسد؛ بر این اساس ما به مطالعه ی پلی مورفیسم ژن های gst ، که چند شکلی های آن مستقیما بر میزان بیان آن موثر است پرداختیم. گلوتاتیون – s – ترنسفرازها خانواده ای از پروتئین های دایمر و آنزیم های فاز ii سمیت زدایی هستند. آنها گلوتاتیون احیا شده را با سوبستراهای الکتروفیل، به منظور حلال کردن آنها ترکیب می کنند. با این کار ترکیبات درونی، داروها و کارسینوژن ها سمیت زدایی می شوند. در پروسه ی التهاب که در عفونت های در تعامل با vur صورت می گیرد، سمیت زدایی نیز رخ می دهد. روش : در این مطالعه ی موردی-شاهدی dnaی 72 بیمار و 104 فرد سالم استخراج شد. از روش tetra primers arms-pcr برای کشف پلی مورفیسم ژن gstp1 و روش pcr معمولی با پرایمرهای forward و reverseبرای کشف پلی مورفیسم های ژن های gstt1 و gstm1استفاده شد. یافته ها : یافته ها نشان می دهد که در بین پلی مورفیسم های بررسی شده، از لحاظ آماری تنها ژنوتیپ نول ژن gstt1 ، ریسک ابتلا به بیماری را افزایش می دهد(13/3 or=، 0046/0 p value=). نتایج : پلی مورفیسم در ژن gstt1 ، می تواند به عنوان عامل خطری برای vur در نظر گرفته شود. برای تایید بیشتر این یافته ها مطالعه در جمعیت های بزرگ دیگر لازم است. کلمات کلیدی : vur ، snp (پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی) ، gstp1 ، gstt1 ، gstm1

بررسی متیلاسیون و بیان ژن fadd در مبتلایان به سرطان سلول های مخاطی دهان(oscc)
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه سیستان و بلوچستان - دانشکده علوم پایه 1391
  سارا جمالی   ارسلان اوژند

سرطان سلول های مخاطی دهان (oscc) در سراسر جهان شیوع قابل توجهی دارد . تشخیص نسبتا دشوار آن باعث می شود تا به تحقیق بیشتر بر روی عوامل ایجاد کننده بیماری بپردازیم . امروزه ثابت شده فاکتورهای اپی ژنتیکی می توانند بدون تغییر در توالی dna بیان ژن را تغییر دهند که متیلاسیون dna در جزایر cpg یکی از این عوامل است . اعتقاد بر این است که متیلاسیون چندین ژن ممکن است در oscc دخیل باشد . اپوپتوزیس نقش مهمی را در بسیاری از فرایندهای فیزیولوژیکی بازی می کند و نقص آن منجر به بیماری های زیادی از جمله سرطان می شود . ژن fadd یکی از عوامل موثر بر اپوپتوزیس در شرایط مختلف زیستی است و عدم تنظیم بیان آن در کارسینوماهای مختلف نقش دارد.در مطالعه حاضر،هدف، بررسی تغییرات متیلاسیون dna در ژن fadd در مبتلایان به oscc و افراد سالم است . مواد و روش ها: نمونه ها شامل 85 بلوک پارافینی بیمار و 68 بیوپسی مربوط به افراد سالم است. آنالیز هیپرمتیلاسیون پروموتر ژن fadd با تکنیک واکنش زنجیره ای پلی مراز ویژه متیلاسیون (msp) انجام شد.سطح بیان ژن fadd نیز در cdna مربوط به 19 بیمار oscc و 20 نمونه سالم با استفاده از rael time pcr مورد بررسی قرار گرفت. نتایج : متیلاسیون پروموتر ژن fadd به لحاظ آماری در بیماران oscc در مقایسه با افراد سالم متفاوت بود . %12.4 بیماران در مقایسه با %0 افراد سالم هتروزیگوت بودند و %88 بیماران در مقایسه با %100 افراد سالم غیر متیل بودند )001/0> p). میزان بیان این ژن در بیماران تفاوت قابل توجهی با نمونه های کنترل داشت. نتیجه گیری: نتایج نشان می دهد که وضعیت متیلاسیون ژن fadd عملکرد قابل توجهی در روند oscc دارد و مطالعه بیشتر با حجم نمونه بزرگ را می طلبد . در این پژوهش به بررسی نقش متیلاسیون ژن fadd و رابطه آن با oscc در نمونه های پارافینه از ناحیه دهان افراد بیمار و نمونه های بیوپسی دهان افراد سالم پرداخته شده است . تکنیک انجام شده در این پژوهش تکنیک msp می باشد. برای این کار dna نمونه های گفته شده استخراج و بوسیله ی بی سولفید تیمار شدند. سپس وضعیت پروموتر آنها با پرایمرهای متیله و غیر متیله بررسی گردید. همچنین میزان بیان این ژن با استفاده از real time pcr مورد بررسی قرار گرفت. در این تکنیک پس از استخراج rna از نمونه ای افراد سالم و بیمار و تبدیل آن به cdna، real time pcr با استفاده از sybr green انجام شد. امروزه بررسی هایپرمتیلاسیون پروموتر ژنها ، افق هایی را در جهت دستیابی به مارکرهای مولکولی در بیماری های مختلف گشوده است. بررسی مولکولی تغییرات اپی ژنتیک در بیماری ها می تواند نقش مهمی در تشخیص اولیه بیماری و پیش آگهی از بیماری و در نتیجه درمان ایفا کند

بررسی رابطه ی بین پلی مورفیسم های ژن pik3ca و خطر ابتلا به بیماری اسکیزوفرنی
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه سیستان و بلوچستان - دانشکده علوم پایه 1392
  عاطفه میر   آدم ترکمن زهی

چکیده پیش زمینه: فسفاتیدیل اینوزیتید تری کیناز (pi3k)، خانواده ای از آنزیم هایی است که در عملکردهای سلولی متعددی مثل رشد سلولی، تکثیر، تمایز، حرکت، عبور و مرورهای بین سلولی و بقا شرکت می کند. این آنزیم در مسیر سیگنالینگ pi3k/akt نقش مهمی بر عهده دارد. اسکیزوفرنی یکی از اختلالات روانی بسیار شایع (1% در جمعیت جهانی) می باشد که ژن های زیادی در بیماریزایی آن دخیل می باشند. هدف مطالعه ی حاضر، آنالیز نقش سه جایگاه snpژن pik3ca(rs6443624(a/c)، rs7640662(c/g) و rs7621329(c/t)) با بیماریزایی اسکیزوفرنی می باشد. روش ها : در این پژوهش مورد-شاهدی، dna از نمونه ی خون تام 108 نفر از بیماران مبتلا به اسکیزوفرنی و 108نفر از افراد سالم استخراج شد و برای بررسی تنوع های ژنتیکی در سه جایگاه rs6443624(a/c)، rs7640662(c/g) و rs7621329(c/t) ژن pik3ca از تکنیک tetra-primer arms-pcr استفاده شد و سپس آنالیز آماری داده ها توسط نرم افزار spss صورت گرفت. نتایج: در این بررسی اختلاف معناداری بین ژنوتیپ ct و ژنوتیپ ترکیبی ct+tt در جایگاه rs7621329(c/t) ژن pik3ca نسبت به ژنوتیپ cc در مقایسه ی افراد بیمار با کنترل مشاهده شد(00001/0 p-value<، 4/6 or= و 14.23-3.023ci= ). اما در دو جایگاه دیگر رابطه ای معنادار با این بیماری مشاهده نشد. نتیجه گیری: طبق نتایج به دست آمده در این پژوهش، بین پلی مورفیسم rs7621329(c/t) ژن pik3ca و بیماری اسکیزوفرنی ارتباط وجود دارد. برای تایید بیشتر این نتیجه نیاز به بررسی در جمعیت های متفاوت و جامعه آماری بیشتر است.

بررسی پلی مورفیسم رسپتور x کبدی در بیماران مسمومیت بارداری
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه سیستان و بلوچستان - دانشکده علوم پایه 1392
  نسیم دوست محمد زهی زارع   محمد هاشمی

چکیده: پیش زمینه: مسمومیت بارداری (pe)یکی از بیماری های پرمخاطره در دوران بارداری میباشد که با عوارضی مثل پرفشاری خون همراه با دفع پروتئین از ادرار همراه است. نوع اولیهpe، در اثر جهش ها و پلی مورفیسم های ژن هایی که در طی نمو در جفت بیان میشوند.نوع دوم peدر اثر تاثیرات محیطی که بر رشد جفت اثر گذار است.peرا با استفاده از علائمی از جمله افزایش فشار خون مادر،افزایش پروتئین در ادرار،افزایش ناگهانی وزن بیش از 900گرم در هفته شناسایی میکنند.درجه شیوع آن در بین زنانی که سن بالا و سابقهpeدارند بیشتر است.به دلیل شیوع این بیماری، مشکلات درمان و تاثیر فاکتورهای زنتیکی در این بیماری و بررسی ژن های درگیر امری ضروری به نظر میرسد. بر این اساس ما به مطالعه پلی مورفیسم ژن lxrs،که چند شکلی های آن مستقیما بر میزان بیان آن موثر است پرداختیم. lxrها خانواده ایی از فاکتورهای رونویسی هستند که در متابولیسم کربوهیدرات ها، وبخصوص متابولیسم لیپدها دخالت دارند. این ژن با رونویسی از پروتئین های درگیر در نقل و انتقال کلسترول از تجمع آن و در ادامه از تاثیری که بر تهاجمات تروفوبلاستیک که از کلیدهای اصلی در ایجاد پاتوژنز این بیماری است ایفای نقش میکند. مواد و روش: در این مطالعه ی موردی_شاهدی dnaی 103بیمار و 101فرد سالم استخراج شد.از روش arms_pcrمعمولی با پرایمرهای forwardوreverse برای کشف پلی مورفیسم ژن lxrs استفاده شد. یافته ها:یافته ها نشان می دهد که پلی مورفیسم بررسی شده،از لحاظ آماری تنها ژنوتیپ gg به عنوان ریسک فاکتور برای بیماری مشخص شده است. نتایج: حاکی از ارتباط پلی مورفیسم lxrs با بیماریpe است. و از لحاظ آماری ارتباط معنی داری بین گروه بیمار و سالم وجود دارد.و این snp با یماری ارتباط دلرد و متغییر سن نیز به عنوان یک ریسک فاکتور برای این بیماری در نظر گرفته شده است. کلمات کلیدی: pe، snp(پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی)، lxrs، lxr?

طراحی و پیاده سازی سیستم حفاظت جامع میکروپروسسوری ادوات فشار قوی با قابلیت تحت web و با استفاده از الگوریتم پیش بینی خطی
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه صنعتی امیرکبیر(پلی تکنیک تهران) - دانشکده مهندسی برق 1386
  محسن طاهری   حسن غفوری فرد

هر روز بر گستردگی و پیچیدگی سیستمهای قدرت افزوده می شود در نتیجه حفاظت از آنها امری مهم به شمار می آید و وظیفه حفاظت بر عهده رله های حفاظتی است. رله های مختلفی برای این منظور به کار گرفته شدند اما با ظهور کامپیوترها و میکروپروسسورها، استفاده از رله های میکروپروسسوری با دقت و اطمینان بالا برای تشخیص خطا مرسوم شده است. وظیفه اصلی رله دیجیتالی بر عهده الگوریتم نرم ا فزار است، لذا با به کار بردن الگوریتمهای با دقت و سرعت بالا می توان خطا را به خوبی تشخیص داد. هدف از این پروژه طراحی و پیاده سازی حفاظت جامع دیجیتالی ادوات فشار قوی با استفاده از الگوریتم ریاضی پیش بینی خطی است که قابلیت کنترل از راه دور دارد. الگوریتم پیش بینی خطی به این صورت عمل می کند که در شرایط عادی با داشتن چند نمونه از سیگنال ولتاژ یا جریان, نمونه بعدی را پیشگویی کرده و با نمونه واقعی مقایسه می نماید در صورت بروز خطا, بین نمونه پیش بینی شده و اصلی اختلاف وجود خواهد داشت. با استفاده از روش پیش بینی خطی می توان وقوع خطا را تشخیص داد. همچنین به کمک این روش می توان جهت خطا را تعیین کرد و نیز می توان اطلاعات سیکل خطا را پیش بینی کرد. روش گفته شده به کمک دو بخش سخت افزار و نرم افزار پیاده سازی شد. سخت افزار شامل یک دستگاه کامپیوتر شخصی و سه عدد کارت صدا به عنوان کارتهای دریافت داده است و بخش نرم افزاری بااستفاده از نرم افزارهای lab view و microsoft visual c++ پیاده سازی شد. سیستم پیاده سازی شده در آزمایشگاه مورد آزمایش قرار گرفت و نتایج آزمایشات نشان داد که روش پیش بینی خطی در تعیین خطا دقیق بوده همچنین به طور ذاتی دارای خاصیتی است که اثر نوسان توان در عملکرد رله را مسدود می کند.

بررسی رابطه بین پلی مورفیسم های ژن hnf1a (rs1169288 و(rs17847497 وبیماران مبتلا به اسکیزوفرنی در استان کهگیلویه وبویراحمد
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه سیستان و بلوچستان - دانشکده علوم پایه 1393
  فاطمه کیخا   آدم ترکمن زهی

اسکیزوفرنی ،(scz) ، یک بیماری روانی با علائم متغیر می باشد که یک درصد از جمعیت جهان را تحت تاثیر قرار می دهد.روانپزشکان ، اسکیزوفرنی را نوعی بیماری ذهنی می شناسند که، فرد مبتلا قابلیت تمیز دادن بین افکار و تصورات خودش و واقعیت را ندارد و تحت تاثیر فاکتورهای ژنتیکی و محیطی مختلفی قرار میگیرد.نشان داده شده است که ژن hnf1a نقش مهمی در اختلالات کبدی ایفا می کندو ارتباطی که اختلالات کبدی با اسکیزوفرنی دارد در این مطالعه مورد توجه قرار گرفته است..هدف مطالعه حاضر ارزیابی ارتباط احتمالی بین پلی مورفیسم های ژن hnf1a وبیماری اسکیزوفرنی می باشد . روش ها: در این مطالعه ی مورد-شاهدی، dna از نمونه های خون بیماران مبتلا به اسکیزوفرن شهرستان یاسوج و افراد کنترل نیز از این شهر جمع آوری شد، در مجموع 100بیمار که شامل 59 مرد و 41 زن و100نفر سالم که شامل 53 زن و 47 مرد بودند. پلی مورفیسم های ژن hnf1a (rs1169288و(rs17847497 با استفاده از تکنیک tetra primer arms-pcr بررسی شدند. نتایچ: نتایج این مطالعه نشان می دهد که ژنوتیپ tt در snp (rs1169288) خطر بیماری را افزایش می-دهد ،که از لحاظ آماری معنی دار است [or=5,ci(95%)=1.4-18,p=0.02]. بحث: در نهایت، نتایج این مطالعه نشان می دهد که پلی مورفیسم ( rs1169288 g/t) hnf1a می تواند به عنوان یک فاکتور خطر برای اسکیزوفرنی در نظر گرفته شود. تایید این نتایج نیازمندبررسی در سایر جمعیت ها وهمچنین نمونه هایی با اندازه های بزرگ تر خواهد بود. کلمات کلیدی: اسکیزوفرنی،اختلالات کبدی ، پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی(snp)، ژن hnf1a

بررسی و امکان استخراج کانسار طلای چاه خاتون (منطقه موته) باروش روباز
پایان نامه 0 1368
  محسن طاهری   مرتضی اصانلو

باتوجه به مطالعات اکتشافی انجام شده ذخیره کانسار طلای چاه خاتون باتوجه به عیار متوسط 2 گرم درتن به این شرح است : ذخیره قطعی 700000 تن، ذخیره احتمالی 1200000 تن و ذخیره ممکن 2500000 تن، ذخیره قطعی 2800 کیلو طلای خالص - ذخیره احتمالی 4800 و ذخیره ممکن 10000 کیلو طلای خالص است .لذا شرکت سهامی کل معادن ایران در نظردارد باتوجه به ذخائر موجود این آنومالی را به مرحله استخراج در آورد وبه این منظور نیاز به طراحی آن دارد.هدف از اجرای این طرح تعیین پارامترهای اقتصادی لازم برای استخراج این کانسار به روش روباز و درنهایت بررس امکان استخراج به این روش است .دراین مطالعه سعی خواهد شد باتعیین نسبت اقتصا w/5،عیار حد و حدنهایی معدن امکان استخراج را مطالعه و درصورت مناسب بودن از نظر فنی و اقتصادی طرح بهینه را ارائه نمائیم .