نام پژوهشگر: حمید رضا وزیری

ارتباط پلی مورفیسم ژن gst-t1 (گلوتاتیون s- ترانسفراز t1)با ناباروری ایدیوپاتیک مردان
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه گیلان - دانشکده علوم پایه 1389
  لیدا قلی زاده   حمید رضا وزیری

چکیده ناباروری مردان یک اختلال چند عاملی ((multifactorial است و فاکتورهای ژنتیکی و محیطی مختلفی در بروز آن نقش دارند. بخش اعظم موارد ناباروری مردان با نواقص سیستمیک مانند دیابت، چاقی، واریکوسل، سیستیک فیبروزیز و یا با عدم تعادل مقادیر استروئید های گنادی و هورمون های تروفیک، موتاسیون های ژنی و عفونت های دستگاه تناسلی در ارتباط است. اما تقریباً در 25 درصد موارد ناباروری مردان، علت دقیق ناباروری مشخص نیست که این ها به عنوان موارد ناباروری ایدیوپاتیک معرفی می شوند. پلی مورفیسم های ژنتیکی آنزیم های سم زدا، مانند گلوتاتیون s- ترانسفراز ها (gsts) ممکن است نقش مهمی را در آمادگی برای ابتلا به ناباروری ایدیوپاتیک مردان ایفا کنند. ژن های گلوتاتیون -s ترانسفرازها ( gsts) خانواده ی بزرگی از آنزیم ها را کد می کنند که این آنزیم ها توسط واکنش های کاتالیز شده بین گلوتاتیون و ترکیبات الکتروفیل? در متابولیسم کارسینوژن های محیطی? گونه های واکنش پذیراکسیژن و عوامل شیمی درمانی شرکت می کنند. gstt1در واکنش های فعالسازی و سم زدایی نقش دارد و اتصال مواد شیمیایی صنعتی مانند اتیلن اکسیدها را به گلوتاتیون کاتالیز می کند. ژن gstt1 روی کروموزوم 22q11.2 قرار گرفته است و دارای پلی مورفیسم عملکردی به فرم حذف هموزیگوت ژن است که منجر به از بین رفتن فعالیت فنوتیپی آنزیم اش می شود. اختلافات (تنوعات) نژادی و قومی در فراوانی حذف این ژن در جمعیت های مختلف وجود دارد. هدف تحقیق حاضر? بررسی ارتباط پلی مورفیسم ژن gstt1 با ناباروری ایدیوپاتیک مردان در جمعیتی از شهرستان رشت بود. بدین منظور، از 50 مرد مبتلا به ناباروری ایدیوپاتیک و30 داوطلب سالم نمونه ی خون جمع آوری شد. dna ژنومی از لوکوسیت های خون محیطی استخراج گردید. فراوانی ژنوتیپ ها با استفاده از واکنش زنجیره ای پلی مراز (pcr) در بیماران و کنترل های سالم تعیین شد. اختلاف معنی داری در فراوانی ژنوتیپ نولgstt1 بین بیماران و کنترل ها مشاهده نشد (x²=0.577, p=0.447). فراوانی ژنوتیپ نول gstt1 در گروه بیمار 6%بود? در مقایسه با گروه کنترل که درآن ها % 0 بود. بررسی حاضر پیشنهاد می کند که ژنوتیپ نول gstt1 با خطر بالای ناباروری ایدیوپاتیک مردان در جمعیت مورد مطالعه در ارتباط نیست? اما این مشاهدات به تا?یید بیشتر، در یک تحقیق بزرگ چند قومیتی (چند نژادی) نیاز دارد.

بررسی تغییرات بیان ژن هیستون داستیلاز1 در بیماران مبتلا به سرطان مثانه
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه گیلان - دانشکده علوم پایه 1392
  مجتبی علی وند   فرزام عجمیان

سرطان مثانه چهارمین سرطان شایع در مردان و نهمین در زنان است. بیش از 90% از تومورهای مثانه از نظر پاتولوژی سلول های پوششی دستگاه ادراری هستند و در 75% موارد در زمان تشخیص در مرحله سطحی قرار دارند. شایع ترین علامت بیماران وجود خون در ادرار است و روش استاندارد برای تشخیص سرطان مثانه سیستوسکوپی می باشد. در تومور مثانه تغییرات ژنتیکی شامل تغییر در ژن سرکوب گر تومور p53 ، p21 و ژن رتینوبلاستوما رخ می دهد، که منجر به پیشرفت تومور به مراحل بالاتر می شود. در پیدایش سرطان مثانه، تغییرات اپی ژنتیکی نیز موثر هستند. این تغییرات شامل متیلاسیون dna و مدیفیکاسیون هیستون ها می باشند که در فرآیند تومورزایی دخیل هستند. تغییرات اپی ژنتیک بر خلاف تغییرات ژنتیک، تغییرات ارثی و برگشت پذیر هستند که بدون ایجاد تغییر در توالی نوکلئوتیدی ژن ها بر روی عملکرد و بیان آن ها تاثیر می گذارند. بخشی از این اثرگذاری توسط آنزیم های هیستون داستیلاز(hdac) انجام می گیرد. داستیلاسیون هیستون ها با برداشتن گروه استیل از آمینواسید لیزین در انتهای هیستون ها منجر به فشرده شدن ساختار کروماتین و خاموشی ژن می گردند. hdac1 جزء کلاس 1 هیستون داستیلازها می باشد که افزایش بیان آن در سلول های سرطانی باعث تحریک تکثیر، رگ زایی، ممانعت از آپوپتوزیس و از دست رفتن تمایز می شود. ما در این تحقیق، پس از استخراج rna از نمونه ها بیان هیستون هیستون داستیلاز 1 را در سرطان مثانه انسان و گروه کنترل با استفاده ازrt-pcr مطالعه کردیم. برای این منظور 32 بیمار مبتلا به سرطان مثانه و 29 فرد سالم با یکدیگر مقایسه شدند. در یافته های این مطالعه در روش rt-pcr بین افراد سالم و بیمار از نظر میزان بیان ژن هیستون داستیلاز1 تفاوت معنی داری مشاهده گردید

بررسی تاثیر درج اینترون در وکتور اپی زومال یوکاریوتیک روی میزان ترشح il-2
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه گیلان - دانشکده علوم پایه 1392
  زهرا صفری   صادق حسن نیا

ایمونوتراپی سلولی انتخابی (t سل تراپی) یکی از روشهایی است که اخیرا توجه زیادی را در درمان سرطان به خود معطوف کرده است. سلول های t بیان کننده رسپتور کایمریک قادر به تمایز بین سلول های بیان کننده آنتی ژن و سلول های نرمال هستند و به راحتی به درون تومورهای جامد نفوذ کرده و آنها را نابود می سازند. در این مطالعه ما از رسپتور کایمریک سلول tاستفاده نمودیم که شامل چهار پروتئین می باشد که در سطح dna به یکدیگر متصل شده اند، به طوری که بیان آنها موجب تولید یک پلی پپتید تک زنجیره tcr (t cell receptor) شامل چهار قطعه: زنجیره سنگین آنتی بادی شتری (vhh)، یک فاصله انداز (fcgriia)، یک قطعه ترانس ممبراین یا سیگنالینگ (cd3zeta) و قطعه کمک تحریک کننده (cd28) می شود. روش های مختلفی برای افزایش بیان ترانس ژن ها در وکتور های یوکاریوتی از جمله استفاده از پروموتر های مختلف، القا کننده مناسب و یا استفاده از اینترون را بکار برد. هدف از انجام این مطالعه مشاهده تاثیر درج اینترون در ابتدای ژن رسپتور کایمریک سلول t و در پایین دست پروموتر بر روی پروفایل بیان آن و میزان ترشح اینترلوکین2 متعاقب توسط سلول های jurkat می باشد. اینترون در پایین دست پروموتر درج شد. وکتور اخیر سپس در میزبان یوکاریوتی t-cell بنام رده سلولی jurkat منتقل و صحت پردازش mrna و میزان بیان بوسیله rt-pcr و real-time pcrبررسی شد. همچنین سنجش میزان il-2 ترشح شده توسط سلول های jurkat در مجاورت سلول های mcf7 توسط تکنیک الایزا انجام گرفت. نتایج real time-pcr بیان حدود 6,4 برابری آن نسبت به ژن فاقد اینترون را نشان داد. همچنین داده های به دست آمده از آزمایش الایزا افزایش معنی دار ترشح il2 القا شده توسط jurkat (با اتصال رسپتور کایمریک با آنتی ژن muc1 سطح سلول mcf7 ) را در محیط کشت حاصل از هم جواری این دو رده سلولی در نمونه های واجد اینترون نسبت به وکتور های فاقد آن نشان داد. طبق نتایج به دست آمده، می توان از توالی اینترون برای افزایش بیان در وکتور های یوکاریوتی در ایمونوتراپی استفاده کرد.

بررسی همراهی پلی مورفسیم های شایع ژن های مسیر متیونین- فولات با بیماری رتینوبلاستوما
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه گیلان - دانشکده علوم پایه 1392
  الهه سلیمانی   علی آهنی^cَ[email protected]%

چکیده همراهی پلی مورفسیم های شایع ژن های مسیر متیونین- فولات با بیماری رتینوبلاستوما الهه سلیمانی رتینوبلاستوما شایع ترین تومور جامد درون چشمی در کودکان زیر شش سال با شیوع حدود 1 در 15 هزار الی 20 هزار تولد می باشد که از تکثیر و رشد بی رویه سلول های نابالغ شبکیه چشم منشا می گیرد. جهش در هر دو نسخه ی ژن rb1 در سلول های جنسی یا سلول های رتینال مسئول وقوع این بیماری می باشد. از آنجایی که ژن های کد کننده آنزیم های مسیر متابولیکی فولات درگیر در متیلاسیون، ترمیم و سنتز dna می باشند، لذا در مطالعه حاضر که برای اولین بار در آسیا و ایران انجام گشته است، پلی مورفیسم های نوکلئوتیدهای منفرد در ژن های کدکننده آنزیم های مهم مسیر متابولیکی فولات همانند متیلن تترا هیدرو فولات ردوکتاز و پلی مورفیسم tyms به عنوان یکی از فاکتورهای مطرح در ایجاد یا تأثیر بیماری رتینوبلاستوما مورد مطالعه قرار گرفته است. به منظور بررسی ارتباط میان پلی مورفیسم های mthfr c677t و mthfr a1298c و tyms با بیماری رتینوبلاستوما، مطالعه کنترل- موردی بر روی 96 بیمار مبتلا به رتینوبلاستوما و 204 نمونه به عنوان شاهد فاقد هر گونه پیشینه سرطانی انجام شده است. لذا به منظور بررسی این ارتباط برای پلی مورفیسم mthfr c677t با بیماری رتینوبلاستوما، روش pcr- rflpاتخاذ گشته است. همچنین برای بررسی همراهی پلی مورفیسم mthfr a1298c با رتینوبلاستوما دو روش arms-pcr و hrm طراحی شده است و نیز قابل ذکر است که به موجب بررسی ارتباط پلی-مورفیسم tyms با بیماری رتینوبلاستوما روش pcr انجام گشته است. در مطالعه حاضر بررسی همراهی پلی مورفیسم mthfr c677t با بیماری رتینوبلاستوما بیانگر اثر حفاظتی آلل t در جمعیت مطالعه شده می باشد. همچنین بررسی پلی مورفیسم mthfr a1298c با هر دو روش مذکور حاکی از عدم ارتباط این پلی مورفیسم با بیماری رتینوبلاستوما می باشد. نتایج حاصل از بررسی پلی مورفیسم tyms و ارتباط آن با بیماری رتینوبلاستوما نیز گویای عدم تأثیر این پلی مورفیسم با بیماری رتینوبلاستوما می باشد. کلمات کلیدی: رتینوبلاستوما، rb1،mthfr ، tyms و hrm.

بررسی ارتباط پلی مورفیسم در کدون 148 و حذف قطعه 155bp در ژن گیرنده kiss1r)kiss1)با ناباروری زنان
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه گیلان - دانشکده علوم پایه 1392
  اعظم فلاحتی   حمید رضا وزیری

ناباروری زنان یک سندروم چندعاملی با دلایل ژنتیکی و غیر ژنتیکی متنوع می باشد، که اثرات روانی، اجتماعی و اقتصادی شدیدی را بر زنان مبتلا و خانواده هایشان وارد می کند. برخی از دلایل عمده ناباروری شامل ناهنجاری های ژنتیکی، عدم تعادل هورمونی، عوامل عفونی، علل مادرزادی و بدریختی های اندام تناسلی می باشد. سایر عوامل نظیر چاقی، تغذیه، استعمال دخانیات، مصرف الکل و قرار گرفتن در معرض برخی مواد شیمیایی به عنوان فاکتور های تغییر دهنده باروری در نظر گرفته می شوند. ژن های متعددی در ناباروری زنان دخیل می باشند. یکی از این ژن ها، ژن گیرنده kiss1r)kiss1)بوده که روی بازوی کوتاه کروموزوم شماره 19 واقع شده است. لیگاند این گیرنده کیس پپتین می باشد. پیام رسانی kp/kiss1r جهت افزایش در ترشح ضربانی gnrh که مشخصه آغاز بلوغ در انسان و برخی حیوانات می باشد، ضروری است. جهش های از دست رفتن عملکرد در kiss1r با هیپوگنادوترفیک هیپوگنادیسم با علل نا شناخته مرتبط می باشد. هم چنین در ژن kiss1r، جهش های کسب عملکرد که ارتباط آن ها با بلوغ زودرس با دلایل ناشناخته تایید گردیده، شناسایی شده است. در این مطالعه، دو جهش مهم از دست دادن عملکرد در این ژن بررسی گردید یک حذف 155 جفت بازی و یک جایگزینی در کدون 148 که منجر به جایگزینی اسیدآمینه لوسین به اسید آمینه سرین می شود. نتیجه هر دوی این موارد فقدان فعالیت آنزیم می باشد. در این تحقیق 50 زن نابارور و 50 زن بارور (گروه کنترل) مورد بررسی قرار گرفتند. dna ژنومی از نمونه های خون محیطی استخراج گردید. تعیین ژنوتیپ به وسیله ی واکنش زنجیره ای پلی مراز (pcr) و rflp صورت گرفت. آنالیز داده ها با استفاده از نرم افزار medcalac (ویرایش دوازدهم) انجام شد. در هیچ یک از افراد مورد مطالعه پلی مورفیسم های l148s و حذف bp 155 مشاهده نگردید. در خاتمه، نتایج این مطالعه پیشنهاد می کند که ممکن است ارتباطی بین این پلی مورفیسم ها و ناباروری وجود نداشته باشد. با این حال، مطالعاتی برپایه ی جمعیت های بزرگ تر و نژاد های متفاوت برای دست یابی به یک نتیجه ی قطعی و نهایی مورد نیاز است.

بررسی اولیه ی مقایسه ای اثرات ضد قارچی چند گیاه در جلوگیری از رشد گونه های کاندیدای جدا شده از بیماران مبتلا به کاندیدیازیس به روش دیسک دیفیوژن
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه گیلان - دانشکده علوم پایه 1392
  مجید باقری   مهناز محمودی راد

کاندیدیازیس یک بیماری قارچی است که توسط قارچ مخمری کاندیدا ایجاد می شود. ولوواژینیت کاندیدایی که از شیوع بالایی برخوردار است با خارش فرج و مهبل، تحریک خارجی و سوزش ادرار مشخص می شود. درمان آن با داروهای ضد قارچی نظیر کلوتریمازول، فلوکونازول و آمفوتریسین b صورت می گیرد. عصاره برخی گیاهان مانند سرخارگل(echinacea anguistifolia)، برای درمان و جلوگیری از بیماری های شایع عفونی استفاده می شوند. این گیاه موجب افزایش تعداد گلبول های سفید خون و فعال شدن فاگوسیتوز توسط گرانولوسیت های انسانی و افزایش درجه حرارت بدن می گردد. آلکالوئیدهای ایزوکوئینولینی جدا شده از گونه های شاه تره (fumaria officinalis) فعالیت ضد قارچی و ضد ویروسی مهمی نشان داده اند. مطالعات بسیاری وجود دارد که از اثرات ضد میکروبی سرکه حمایت می کند و نشان داده شده است که در پیشگیری و کنترل آلودگی های میکروبی موثر است. جهت انجام این آزمایش از ترشحات واژن بیماران مبتلا به ولوواژینیت کاندیدایی (13 فرد مبتلا به گونه candida albicans و 13 فرد مبتلا به گونه candida glabrata) استفاده شد. شناسایی گونه های کاندیدا با روش multiplex pcr و محیط افتراقی کاندیدا آگار صورت گرفت. در این مطالعه از دو عصاره ی متانولی سرخارگل و شاه تره و سه نوع سرکه، شامل سیب، انگور و خرما جهت بررسی خواص ضد قارچی آن ها به روش دیسک دیفیوژن بر روی دو گونه مذکور استفاده شد. همچنین از داروی شیمیایی فلوکونازول به عنوان کنترل استفاده گردید. با توجه به یافته ها، تفاوت آماری معناداری بین میزان اثر ضد قارچی فلوکونازول و سایر داروهای مورد بررسی وجود دارد. همچنین اثر ضد قارچی سرکه سیب و انگور در مقایسه با سرکه خرما و عصاره متانولی شاه تره به طور معناداری بیشتر بوده است. با توجه به نتایج این مطالعه، سرکه انگور و سیب ترکیبات طبیعی ضد کاندیدایی هستند که اثرات نسبتاً قابل مقایسه ای با ضد قارچ های شیمیایی مثل فلوکونازول نشان دادند. مطالعه بیشتر مکانیسم عمل و ترکیبات موثر گیاه شاه تره می تواند در بررسی دقیق تر اثرات ضد کاندیدایی آن مفید باشد.

بررسی ارتباط ژن oipa هلیکوباکتر پیلوری با سرطان معده
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه گیلان - دانشکده علوم 1392
  زینب سرداری   فرزام عجمیان

پس از کشف هلیکوباکتر پیلوری (h. pylori) در سال 1982، توسط وارن و مارشال، مطالعات اپیدمیولوژیکی زیادی، ارتباط قوی بین عفونت هلیکوباکتر پیلوری با پیشرفت سرطان معده را آشکار کردند. اخیرا اثبات شده است که ریسک ابتلا به سرطان معده در افراد آلوده به عفونت هلیکوباکتر پیلوری، بیشتر از افراد غیر آلوده است. بعلاوه، اخیرا یک فاکتور بالقوه بیماریزا به نام ژن(outer inflammatory protein) oipa شناخته شده است. این ژن یک پروتئین خارج غشایی هلیکوباکتر پیلوری را کد میکند و یک ژن مرتبط با التهاب است چرا که باعث افزایش ترشح اینترلوکین-8 (il-8) از سلولهای اپیتلیال معده می شود. در این مطالعه، نمونه های بیوپسی از بیمارانی که برای اندوسکوپی به دو مرکز گوارش در تبریز مراجعه کرده بودند گرفته شد. 86 بیمار در این مطالعه حضور داشتند که بر طبق بررسی های میکروسکوپی مخاط و مطالعات هیستولوژیک در دو دسته ی بیماران مبتلا به سرطان معده (37) و التهاب (49) قرار گرفتند. پس از استخراج dna، با استفاده از دو جفت پرایمر، یکی جهت تکثیر ژن 16s rrna برای شناسایی هلیکوباکتر پیلوری و دیگری جهت تکثیر ژن oipa، واکنش pcr انجام شد.در این مطالعه، 80% از افرد مبتلا به سرطان معده، و 71% از افرد مبتلا به گاستریت آلوده به هلیکوباکتر پیلوری بودند. 6/56% از افراد مبتلا به سرطان معده و 57% از افراد مبتلا به التهاب معده دارای دارای ژن oipa بودند، میزان p value بدست آمده، ( p value>05/0)، برای این دو گروه نشان می دهد که تفاوتی بین فراوانی این ژن در افراد سرطانی و التهابی وجود ندارد. مطالعه ی ما نشان دهنده ی آن است که علیرغم اینکه آلودگی با هلیکوباکتر پیلوری به طور واضح در ارتباط با سرطان معده است، اما oipa فاکتور بیماریزای غالب در القاء سرطان معده نیست. کلید واژه ها: هلیکوباکتر پیلوری، سرطان معده، oipa

بررسی پلی مورفیسم ژن ha03 در کنه هیالوما آناتولیکوم آناتولیکوم ایران
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه گیلان - دانشکده علوم پایه 1392
  لینا معلمی راد   خسرو آقائی پور

کنه ها فراوان ترین انگل دام در مناطق گرم و به طور کلی بیوتیب های پست و ارتفاعات متوسط زندگی می کنند. خونخواری مستقیم کنه ممکن است موجب کم خونی و وزن کم و انتقال بیماری های خطرناک شود. بدون کنترل کنه ها افزایش محصولات دامی در کشور های در حال توسعه امکان پذیر نیست. کنه هیالوما به طور گسترده ای در مناطق مختلف ایران پراکنده است. که منجر به هزینه های زیاد به منظور واردات سموم دفع آفات به داخل کشور شده است. با وجود استفاده گسترده از این آفت کش ها میزان مرگ و میر قابل توجه است.مطالعات اخیر نشان داده اند استفاده گسترده از آنتی ژن های پنهان در تهیه واکسن علیه کنه یک راهبرد مناسب است. واکسنtick gard در کوبا و gavac در استرالیا از آنتی ژن نوترکیب bm86 ساخته شده است. گزارشات علمی نشان داده است واکسن tick gard تا حدی نقش محافظتی علیه کنه هیالوما آناتولیکوم آناتولیکوم داشته است.ha03ژن مشابه ژن bm86که از کنه boophilus جدا شده است می باشد. این ژن حدود bp2200 می باشد. با توجه به اینکه ha03 برای تولید واکسننوترکیب مهم بود، بنابراین مطالعه پلی مورفیسم آن ضروری بود.در این مطالعه ژن ha03 از نقاط مختلف ایران: لرستان، بوئین زهرا، قم و کردانتوالی یابی و بررسی شد. dna کنه جدا شد. سپس با انجام واکنش pcr با پرایمرهایfbm86c/l2007 تکثیر یافت، که حدود bp2200 بود. محصول pcr با دو روش تخلیص و سپس در ptz57r/t کلون گردید.ha03ژن به وسیله شرکت macrogenتوالی یابی گردید. نمونه ها از نقاط مختلف ایران: لرستان، قم، بوئین زهرا و کردان بود. این سکانس ها با یکدیگر مقایسه شدند. نتایج نشان دادند که در 6 منطقه، نوکلئونید ها تغییر پیدا کرده اند. این تنوع بر روی کدون های اسید آمینه تاثیرات متقاوتی نشان داد.