Both Configuration and QM Region Size Matter: Zinc Stability in QM/MM Models of DNA Methyltransferase
نویسندگان
چکیده
منابع مشابه
How Large Should the QM Region Be in QM/MM Calculations? The Case of Catechol O-Methyltransferase
Hybrid quantum mechanical-molecular mechanical (QM/MM) simulations are widely used in studies of enzymatic catalysis. Until recently, it has been cost prohibitive to determine the asymptotic limit of key energetic and structural properties with respect to increasingly large QM regions. Leveraging recent advances in electronic structure efficiency and accuracy, we investigate catalytic propertie...
متن کاملstability and attraction domains of traffic equilibria in day-to-day dynamical system formulation
در این پژوهش مسئله واگذاری ترافیک را از دید سیستم های دینامیکی فرمول بندی می کنیم.فرض کرده ایم که همه فاکتورهای وابسته در طول زمان ثابت باشند و تعادل کاربر را از طریق فرایند منظم روزبه روز پیگیری کنیم.دینامیک ترافیک توسط یک نگاشت بازگشتی نشان داده می شود که تکامل سیستم در طول زمان را نشان می دهد.پایداری تعادل و دامنه جذب را توسط مطالعه ویژگی های توپولوژیکی تکامل سیستم تجزیه و تحلیل می کنیم.پاید...
language learning strategies and vocabulary size of iranian efl learners
learning a second or foreign language requires the manipulation of four main skills, namely, listening, reading, speaking, and writing which lead to effective communication. it is obvious that vocabulary is an indispensible part of any communication, so without a vocabulary, no meaningful communication can take place and meaningful communication relies heavily on vocabulary. one fundamental fac...
the study of aaag repeat polymorphism in promoter of errg gene and its association with the risk of breast cancer in isfahan region
چکیده: سرطان پستان دومین عامل مرگ مرتبط با سرطان در خانم ها است. از آنجا که سرطان پستان یک تومور وابسته به هورمون است، می تواند توسط وضعیت هورمون های استروئیدی شامل استروژن و پروژسترون تنظیم شود. استروژن نقش مهمی در توسعه و پیشرفت سرطان پستان ایفا می کند و تاثیر خود را روی بیان ژن های هدف از طریق گیرنده های استروژن اعمال می کند. اما گروه دیگری از گیرنده های هسته ای به نام گیرنده های مرتبط به ا...
15 صفحه اولInterphase chromosomes and the Rabl configuration: does genome size matter?
Summary It is now well established that the cereals share a common gene order or gene synteny. However, the cereal species encompass an enormous range of genome size, with wheat being one of the largest and rice one of the smallest. Here we describe the current state of knowledge of interphase chromosome structure within the cereal species. In wheat and its close relatives, the interphase chrom...
متن کاملذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: Journal of Chemical Theory and Computation
سال: 2020
ISSN: 1549-9618,1549-9626
DOI: 10.1021/acs.jctc.0c00153