تجزیه و تحلیل ژنتیکی و فیلوژنتیکی ناحیه hvr-i از ژنوم میتوکندری در گوسفند نژاد افشاری
چکیده
خلوص ژنتیکی نژادهای گوسفند به علت تلاقی های کنترل نشده دستخوش تغییر شده است، استفاده از نشانگرهای ژنتیکی توالییابی ژنوم میتوکندری، یکی از راه های بررسی این تغییرات است. هدف از این تحقیق بررسی میزان تنوع ناحیه hvr-i از ژنوم میتوکندری گوسفند نژاد افشاری میباشد. برای این منظور از تعداد 20 رأس گوسفندان افشاری غیرخویشاوند نمونه خون جمع آوری و پس از استخراج dna از آنها، ناحیه موردنظر توسط پرایمرهای اختصاصی با تکنیک pcr، تکثیر و قطعات موردنظر توالییابی شدند. با تجزیه دادههای حاصل، تعداد 5 هاپلوتیپ در این جمعیت شناسایی شد. مقایسه توالی hvr-i گوسفند افشاری با توالی ناحیه مشابه از ژنوم گوسفندان سایر نژادها، مشخص کرد این نژاد متعلق به گروه هاپلوتیپی a میباشد، همچنین مقایسه توالی مذکور گوسفند افشاری با منطقه مشابه در گروه هاپلوتیپی a از ژنوم گوسفندان سایر نژادها، نشان داد که گوسفند افشاری داری کمترین فاصله ژنتیکی با نژاد بلوچی و مغانی ایران میباشد. همچنین تجزیه و تحلیل درخت فیلوژنی رسم شده برای گروه هاپلوئیدی a نشان داد که احتمالاً قوچ و میش اوریال به عنوان منشا نژاد افشاری و دو نژاد دیگر گوسفند محسوب می شود.