الگوی rep-pcr استرین¬های pectobacterium جدا شده از سیب¬زمینی دارای علایم بیماری-های پوسیدگی نرم و ساق سیاه در استان همدان
چکیده
استرینهای وابسته به باکتری جنس pectobacterium از مهمترین عوامل بیماریزای گیاهی بهویژه سیبزمینی هستند. در استان همدان همه ساله گونههای مختلف این باکتری زیانهای فراوانی را به بار میآورند. از مناطق مختلف کشت سیب زمینی در استان همدان نمونههای مشکوک و دارای علایم بیماریهای پوسیدگی نرم و ساق سیاه گردآوری و استرینهای باکتریایی مشابه pectobacterium رو ی محیط کشت emb جدا و خالص سازی شدند. پس از اثبات بیماریزایی استرینهای باکتری روی سیبزمینی، تعداد 27 استرین برای بررسی ویژگیهای فنوتیپی بهمنظور شناسایی، انتخاب شدند. استرینهای باکتریایی مورد بررسی بر اساس ویژگیهای بیماریزایی و فنوتیپی از همدیگر متمایز بودند. بر مبنای ویژگیهای فنوتیپی بیشتر استرینهای عامل بیماری سیبزمینی بهعنوان pectobacterium carotovorum و تعدادی نیزpectobacterium atrosepticum شناسایی شدند. انگشت نگاری ﮊنومی استرینهای انتخاب شده بهروش rep-pcr با استفاده از دو آغازگرeric وbox انجام شد. دادههای به دست آمده با استفاده از نرمافزار ntsys v 2.2 و روش تجزیه خوشهای upgma آنالیز شد. نتایج حاصل نشان داد که استرینهای مورد آزمایش p. carotovorumو تعدادی نیز p. atrosepticum هستند. بررسی الگوی rep-pcrروشی سریع برای تشخیص و ردیابی استرینهای pectobacterium بیماریزای سیبزمینی است.