ارزیابی تنوع ژنتیکی برخی از توده های آویشن کوهی (thymus kotschyanus) ایران با نشانگرهای نیمه تصادفی
چکیده
آگاهی از میزان تنوع ژنتیکی در مراحل مختلف انجام یک پروژه اصلاحی بهویژه جهت بهرهبرداری از منابع ژرمپلاسمی امری ضروری است. در این مطالعه 18 توده آویشن کوهی (thymus kotschyanus) با استفاده از 30 آغازگر نیمه تصادفی مورد بررسی قرار گرفت. از برگهای جوان آویشن dna ژنومی استخراج شد و محصولات تکثیر شده واکنش زنجیرهای پلیمراز، بر روی ژل آگارز 5/1 درصد الکتروفورز گردید.نتایج حاصل از باندهای تکثیر یافته این آغازگرها نشان داد که متوسط تعداد باند چندشکل به ازای هر آغازگر و هر توده به ترتیب 8/19 و 33 عدد بود. بیشترین میزان اطلاعات چندشکلی و شاخص نشانگر را آغازگر it18-1تشکیل داد. نتایج تجزیه خوشهای به روش میانگین فواصل با نرمافزار darwin5بیانگر بیشترین شباهت ژنتیکی بین دو توده آویشن کوهی از استان قزوین بود. نتایج تجزیه به مؤلفههای اصلی نشان داد که سه مؤلفه اول در مجموع 50/17 درصد از کل واریانس را توجیه نمودند که بیانگر پراکنش مناسب آغازگرهای مورد استفاده در تمام سطح ژنوم می باشد.نحوه گروهبندی تجزیه خوشهایبا گروهبندی تجزیه مؤلفههای اصلی هماهنگی داشت. نتایج بیانگر تنوع ژنتیکی بالای درون گونهای آویشن کوهی از مناطق مختلف ایران بود.