گروه بندی و بررسی الگوی بیان ژن های خانواده bzip در ریشه گیاه گوجه فرنگی تحت تنش دمای پایین
چکیده
bzip یکی از مهمترین عوامل رونویسی هستند که در اکثر تنشها فعال هستند و باعث بیان و تنظیم تعدادی زیادی ژن در طی تنشهای محیطی میشوند. گیاه گوجه فرنگی دارای 73 ژن bzip است که تاکنون این ژنها گروهبندی نشدهاند. در این تحقیق با استفاده از مطالعه نواحی فعالیت و اتصال به dna، این خانواده بزرگ از عوامل رونویسی گروهبندی گردید. نتایج گروهبندی نشان داد که bzips گوجهفرنگی طبق عملکرد و میزان همولوژی با ژنهای bzip آرابیدوپسیس در یازده گروه قرار میگیرند. سه ژن solyc06g074320، solyc01g109880 و solyc10g085210 به ترتیب از گروههای d، i و b برای مطالعه بیان ژن تحت تنش دمای پایین انتخاب شدند. دو ژنوتیپ حساس به سرما (moneymaker) و مقاوم به سرما (la1777) گیاه گوجه فرنگی در مرحله گیاهچهای تحت شرایط دمای نرمال (23 درجه سانتیگراد) و دمای پایین (15 درجه سانتیگراد) برای مطالعه بیان ژن در ریشه کشت گردیدند. نتایج نشان داد که ژن solyc06g074320 کمتر از solyc01g109880 و solyc10g085210 تحت تنش دمای پایین در ریشه گیاه گوجهفرنگی القاء میشود. نتایج این بررسی میتواند نقطه شروعی برای مطالعه عملکردی ژنهای خانواده bzip در آینده باشد.