جداسازی، همسانه‌سازی و تحلیل بیوانفورماتیکی ژن کد کننده‌ هیستامیناز نخود (Cicer arietinum) توده بومی گریت

Authors

  • احمد اسماعیلی دانشیار گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی دانشگاه لرستان، خرم‌آباد، ایران
  • صابر گلکاری استادیار موسسه تحقیقات کشاورزی دیم کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، مراغه، ایران
  • هادی کریم بیگی کارشناسی‌ارشد، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی دانشگاه لرستان، خرم‌آباد.
Abstract:

هیستامین، یک آمین بیوژنیک مهم، توسط بسیاری از ارگانیسم‌ها تولید می‌شود و نقش‌‌های متنوعی در حیات و زندگی جانداران دارد. ذخیره هیستامین در غذا به خصوص در محصولات غذایی کنسرو شده مانند تن ماهی، سلامتی انسان‌ها را تهدید و به بدن فرد آسیب می‌رساند. دی آمین اکسیداز یا هیستامیناز، هیستامین موجود در بدن انسان را تجزیه و از اثرات مضر آن می‌کاهد. در این مطالعه cDNA کدکننده کامل یک آنزیم آمینواکسیداز، از نخود توده بومی گریت جداسازی شد و در پایگاه GenBank به شماره دسترسی Ku058599 ثبت گردید. به‌علاوه این توالی در یک پلاسمید بیانی همسانه سازی شد. cDNA جداسازی شده دارای یک ORF با طول bp2013، پروتئینی با 670 اسید آمینه و وزن مولکولی KDa 7/75 را تولید می‌کند. نتایج آنالیزهای هم ردیفی توالی چندگانه این پروتئین نشان داد که جایگاه‌های فعال و اسید آمینه‌های مهم در هیستامیناز باکتری ای‌کولای، نخود زراعی و نخود بومی گریت بسیار حفاظت شده‌ هستند. بررسی‌های بیوانفورماتیکی نشان داد که هیستامیناز توده بومی گریت با هیستامیناز نخود موجود در پایگاه Genbank (CAA08855) در 4 اسید آمینه با هم اختلاف داشتند. نتایج حاصل از آنالیز فیلوژنتیکی هیستامینازهای موجودات مختلف نشان داد که هیستامیناز نخود توده بومی گریت با هیستامیناز‌های گیاهان و مخصوصا خانواده لگومینوزها با بوت استرپ 99% در یک گروه قرار گرفتند.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

Chickpea (Cicer arietinum) | Feedipedia

Chickpea, chick pea, Egyptian bean, gram pea, Bengal gram [English]; garbanzo [Spanish]; pois chiche [French]; grão-de-bico, ervilha-de-bengala [Portuguese]; kikkererwt [Dutch]; Kichererbse [German]; kacang arab [Indonesian]; cece [Italian]; nohut [Turkish]; Đậu gà [Vietnamese]; [Amharic]; صمّـحِلا [Arabic]; [Bengali]; 鹰嘴豆 [Chinese]; دوخن [Farsi]; Ρεβιθιά [Greek]; [Gujarati]; הצמח [Hebrew]; [Hind...

full text

بررسی انحراف کدونی و تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی توالی کد کننده ژن کالپاستاتین در پستانداران

چکیده سابقه و هدف: کالپاستاتین از آنزیم‌های تشکیل‌‌دهنده سیستم پروتئولیتیک کالپاین است که این مجموعه پروتئینی پروتئولیتیک شامل پروتئازهای طبیعی وابسته به 2+Ca است و در شکل‌گیری، تجزیه بافت‌های عضلانی و تردی گوشت پس از کشتار موثر بوده و به عنوان یک ژن‌ شاخص در ارتباط با راندمان رشد و کیفیت گوشت به حساب می‌آید. هدف از این مطالعه ارزیابی ساختار ژنی و پروتئینی کالپاستاتین با استفاده از ابزارهای بیو...

full text

GENETIC DIVERGENCE IN CHICKPEA (Cicer arietinum L.)

Genetic diversity of 27 chickpea genotypes was studied through Mahalanobis D and Principal Component analysis. The genotypes under study fall into five clusters. The cluster II contained the highest number of genotypes (11) and Cluster I contained the lowest. Cluster I produced the highest mean value for number of pods per plant. The inter cluster distances were much higher than the intra clust...

full text

تشخیص سرولوژیکی و مولکولی برخی از عوامل ویروسی آلوده کننده گیاه نخود (Cicer arietinum)در استان های لرستان و همدان

کاشت و افزایش تولید حبوبات از جمله نخود (Cicer arietinum)  یکی از اولویت های محصولی در کشور محسوب می شود. نخود به عنوان یکی از منابع پروتئینی برای تغذیه انسان ها و نیز در تثبیت نیتروژن خاک از اهمیت ویژه ای  در اقتصاد مقاومتی در کشاورزی کشور برخوردار است. مزارع دیم استان های  لرستان و همدان  یکی از قطب های مهم کاشت این محصول  است. عوامل ویروسی متعددی با عث بروز بیماری و خسارت به این گیا...

full text

مطالعه خصوصیات رشد،عملکردواجزاءعملکرددانه ارقام نخود(cicer arietinum)تحت تأثیرشوری

شوری یکی ازانواع تنش های محیطی واز فاکتورهای اصلی کاهش رشدوعملکردگیاهان میباشد. مطالعات نشان داده که گزینش ارقام متحمل به شوری در خزانه ژنتیکی گیاهان باموفقیت خوبی همراه بوده است. درکنار وجود تنوع درخزانه ژنتیکی،درک درست فرایندهای فیزیولوژیک ومورفولوژیک در پاسخ به تنش درطراحی شیوههای اصلاحی برای دستیابی به ارقام متحمل به شوری ازاهمیت ویژه ای برخورداراست وگزینش برای ارقام مقاوم به شوری میتواند ب...

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 8  issue 24

pages  15- 27

publication date 2018-12-22

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023