شناسایی جدایه‌های اشرشیا کلی جدا شده از آب سواحل بوشهر با روش PCR

Authors

  • بهادر , عباس گروه میکروب‌شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی تهران، تهران، ایران
  • حقیقی , محمدعلی مرکز تحقیقات زیست فناوری دریایی خلیج‌فارس، پژوهشکده علوم زیست پزشکی خلیج‌فارس، دانشگاه علوم پزشکی بوشهر، بوشهر، ایران
  • رحیمی , زهرا گروه میکروب‌شناسی و انگل‌شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی بوشهر، بوشهر، ایران
  • عظیم‌زاده , مسعود گروه میکروب‌شناسی و انگل‌شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی بوشهر، بوشهر، ایران
Abstract:

زمینه: تشخیص با روش‌های استاندارد نتوانسته است تمام مشکلات تشخیصی اشرشیا کلی را حل نماید. اما با گسترش مطالعات ژنومیک، به نظر می‌رسد واکنش زنجیره‌ای پلیمراز (PCR) توان کافی برای حل این مشکل را داشته باشد. هدف از این مطالعه تشخیص جدایه‌های محیطی اشرشیا کلی با کاربرد روش PCR و استفاده از پرایمرهای اختصاصی برای قطعات ژن‌های lacZ، uidA، cyd و lacY بود. مواد و روش‌ها: شناسایی ملکولی اشرشیا کلی با آزمایش‌های PCR و پرایمرهای چهارگانه فوق بر روی DNA ژنومی تخلیص شده از 120 جدایه محیطی اشرشیا کلی به همراه سویه‌های استاندارد شیگلا و سویه‌های انتروهموراژیک اشرشیا کلی به عنوان کنترل انجام شد. کلیه جدایه‌های محیطی مورد استفاده در یک مطالعه قبلی از آب سواحل بوشهر جداسازی و با روش‌های استاندارد باکتری‌شناسی شناسایی شده و سپس جهت مطالعات بعدی در دمای منفی 70 نگهداری شده‌اند. یافته‌ها: پرایمرها قدرت شناسایی اهداف خود را در جدایه‌های محیطی و سویه‌های استاندارد داشتند. مشخص گردید به‌طور هم‌زمان چهار قطعه مربوط به ژن‌های lacZ، uidA، cyd و lacY فقط در جدایه‌ها و سویه‌های اشرشیا کلی وجود دارند. این روش PCR قدرت جداسازی اشرشیا کلی را از شیگلا، به‌عنوان نزدیک‌ترین جنس فیلوژنیک، داشته و برخلاف روش‌های کلاسیک، ‌توانست سویه انتروهموراژیک را به عنوان اشرشیا کلی تشخیص دهد. نتیجه‌گیری: روش PCR طراحی ‌شده برای قطعات ژن‌های lacZ، uidA، cyd و lacY دقت لازم برای شناسایی و جداسازی اشرشیا کلی از گونه‌های بسیار مشابه را داشته بنابراین به‌عنوان یک روش ملکولی قابل ‌اطمینان در تشخیص اشرشیا کلی معرفی می‌گردد.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

شناسایی ژن های بتالاکتاماز در اشرشیا کلی جداشده از زخم پای دیابتی به روش Multiplex PCR در شهرستان جهرم

زخم پای دیابتی، که از عوارض دیابت شیرین است، با همراه شدن عفونت در زخم می تواند خطر قطع عضو و یا حتی مرگ را افزایش دهد. باکتری E coli ، که حضور آن در زخم پای دیابتی گزارش شده است، می تواند به وخامت وضعیت زخم منجر شود. مطالعه حاضر با هدف شناسایی ژن های بتالاکتاماز در اشرشیا کلی جداشده از زخم پای دیابتی به روش Multiplex PCR در شهرستان جهرم انجام گرفت. روش کار: تعیین حساسیت آنتی بیوتیکی اشرشیا کل...

full text

بررسی حذف باکتری اشرشیا کلی از آب آلوده به روش الکترولیز

Background and objective: The conventional chemical and physical methods for water disinfection include the application of ultraviolet (UV), chlorination, and ozonation. Water disinfection by electrochemical methods has been increasingly carried out recently. The goal of this applied - analytical research is to investigate the removal of E. coli bacteria, as the index of water microbial contami...

full text

شناسایی گونه‌های کاندیدای جدا شده از موارد ولوواژینیت کاندیدایی به روش Multiplex PCR

Normal 0 false false false EN-US X-NONE AR-SA MicrosoftInternetExplorer4 /* Style Definitions */ table.MsoNormalTable {mso-style-name:"Table Normal" mso-tsty...

full text

شناسایی گونه‌های کاندیدا جدا شده از نمونه خون بیماران مبتلا به کاندیدمی به روش Seminested PCR

زمینه و هدف: شاهد شیوع عفونت‌های قارچی از جمله کاندیدا و شیوع بیشتر بیماری ایدز، بدخیمی ها و افزایش اختلالات سیستم ایمنی هستیم. این امر زمینه را برای افزایش شیوع کاندیدیازیس سیستمیک و سپتی سمی کاندیدایی خصوصا با گونه‌های غیر آلبیکنس کاندیدا فراهم کرده است. هدف از این مطالعه تعیین هویت گونه‌های کاندیدا جدا شده از نمونه های کشت خون با استفاده از روش Seminested PCR بود. روش بررسی: 2516 نمونه‌ ک...

full text

در سویه های بالینی اشرشیا CTX-M- شیوع ژن بتالاکتاماز 15 PCR کلی توسط روش

Background and purpose: Presence of extended spectrum β -lactamase (ESBL) genes plays an important role in spreading β -lactam antibiotic resistance in the producing strains of these enzymes. The resistance of gram-negative bacteria, such as Escherichia coli, to different antimicrobial agents, has increasingly been reported. This study was conducted to determine the prevalence of ESBL in Esc...

full text

اثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین

Background: Diabetes mellitus increases the risk of central nervous system (CNS) disorders such as stroke, seizures, dementia, and cognitive impairment. Berberine, a natural isoquinolne alkaloid, is reported to exhibit beneficial effect in various neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. Moreover astrocytes are proving critical for normal CNS function, and alterations in their activity...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 21  issue 5

pages  383- 392

publication date 2018-11

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Keywords

No Keywords

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023