تعیین مشخصات مولکولی و تبارزایی ویروئید لکه زردی-1 مو (Grapevine yellow speckle viroid-1) از تاکستان¬های شمال¬غرب کشور
نویسندگان: ثبت نشده
چکیده مقاله:
بهمنظور تعیین مشخصات مولکولی و بررسی ساختارهای ثانویه ویروئید لکه زردی- 1 مو، 137 نمونه از تاکستانهای استانهای اردبیل، آذربایجان شرقی و آذربایجان غربی جمعآوری گردید. اسید نوکلئیک کل از بافت برگ نمونهها استخراج و پس از ساخت دیانای مکمل با استفاده از آغازگر ششنوکلئوتیدی تصادفی، طول کامل این ویروئید با روش پیسیآر و با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ویروئید لکه زردی -1 مو، تکثیر شد. محصول پیسیآر پس از همسانهسازی در حامل pGEMT-easy، تعیینتوالی گردید. نتایج نشان داد که واریانتهای شناساییشده در این تحقیق، دارای 367 یا 368 نوکلئوتید هستند و در مجموع هفت واریانت جدید از این ویروئید تشخیص داده شد. درخت تبارزایی نشان داد که واریانت 6 مشابه اعضای تیپ یک این ویروئید و شش واریانت بعدی در کنار تعدادی جدایه و واریانت دیگر تشکیل یک تیپ جداگانه (بهنام پیشنهادی تیپ 4) را میدهند. در ساختار ثانویه واریانتهای بهدستآمده در این تحقیق، بیشترین تفاوت در منطقه متغیر و قسمت انتهایی چپ قرار داشت. ویروئید لکه زردی-1 مو برای اولین بار از استانهای آذربایجانشرقی و اردبیل گزارش میشود.
منابع مشابه
تعیین مشخصات مولکولی و تبارزایی ویروئید لکه زردی-۱ مو (grapevine yellow speckle viroid-۱) از تاکستان های شمال غرب کشور
بهمنظور تعیین مشخصات مولکولی و بررسی ساختارهای ثانویه ویروئید لکه زردی- 1 مو، 137 نمونه از تاکستانهای استانهای اردبیل، آذربایجان شرقی و آذربایجان غربی جمعآوری گردید. اسید نوکلئیک کل از بافت برگ نمونهها استخراج و پس از ساخت دیانای مکمل با استفاده از آغازگر ششنوکلئوتیدی تصادفی، طول کامل این ویروئید با روش پیسیآر و با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ویروئید لکه زردی -1 مو، تکثیر شد. مح...
متن کاملDe Novo Genome Assembly of Grapevine Yellow Speckle Viroid 1 from a Grapevine Transcriptome
Grapevine yellow speckle viroid 1 (GYSVd1), which is a member of the genus Apscaviroid, causes yellow speckle disease in grapevines. Here, we report the complete de novo genome assembly of GYSVd1 from the grapevine transcriptome and identified 10 single nucleotide polymorphisms of GYSVd1 across the grapevine populations.
متن کاملGrapevine yellow speckle viroid: structural features of a new viroid group.
A single stranded circular RNA was isolated from grapevines infected with yellow speckle disease. The RNA which we have called grapevine yellow speckle viroid (GYSV), contains 367 nucleotide residues and has the potential to form the rod-like secondary structure characteristic of viroids. GYSV has 37% sequence homology with the recently described apple scar skin viroid (ASSV; 330 residues) and ...
متن کاملComplete Genome Sequences of Grapevine Yellow Speckle Viroid 1 and Hop Stunt Viroid Assembled from the Transcriptome of Ixeridium dentatum Plants
Here, we report complete genome sequences of grapevine yellow speckle viroid 1 (GYSVd1) and hop stunt viroid (HSVd), members of the family Pospiviroidae, assembled from the transcriptome data generated from Ixeridium dentatum plants. To our knowledge, this is the first report of GYSVd1 and HSVd in I. dentatum.
متن کاملشناسایی ویروئید های مو در استان خراسان رضوی
به منظور شناسایی ویروئیدهای مو در استان خراسان رضوی نمونه برداری تصادفی از تاکستانهای کاشمر انجام شد. از برگ نمونه ها نوکلئیک اسید کل استخراج و با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ویروئیدهای لکه زرد شماره یک مو (grapevine yellow speckle viroid 1)، لکه زرد شماره دو مو (grapevine yellow speckle viroid 2)، ویروئید استرالیایی مو ( australian grapevine viroid ) و ویروئید کوتولگی رازک (hop stunt viroid) ...
تعیین برخی از ویژگی‌های بیولوژیکی و مولکولی فیتوپلاسماهای همراه با زردی مو در استانهای فارس و لرستان*
زردی فیتوپلاسمایی یکی از بیماری‌های مهم و اقتصادی انگور در بسیاری از نقاط جهان است. در بازدیدهای سال‌های1391 و1392 علائمی شبیه به علائم زردی فیتوپلاسمایی در مناطق موکاری استانهای فارس و لرستان مشاهده و قلمه‌هایی انتخاب و کشت گردید. عامل زردی بااستفاده از سس (Cuscuta campestris Yank.) از موهای حاصل از کشت قلمه‌های تهیه شده از موهای دارای علائم در استانهای فارس و لرستان به پروانش و با ...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
عنوان ژورنال
دوره 2 شماره 1
صفحات 27- 39
تاریخ انتشار 2014-01-21
با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023