درجه‌‌بندی‌ اسیدهای‌ آمینه‌ از نقطه‌ نظر میزان‌ آب‌گریزی‌ آنها

نویسنده

  • فروحی, عنایت
چکیده مقاله:

چکیده‌ مقدمه‌: آب‌گریزی‌ ملکول‌ها عامل‌ محرّک‌‌ بسیاری‌ از آثار و پدیده‌ها در سیستم‌های‌ بیولوژیکی‌ است. تاکنون تعداد زیادی درجه‌بندی آب‌گریزی برای اسیدهای آمینه پیشنهاد شده‌است. از این درجه‌بندی‌ها برای پیش‌بینی توپولژی پروتئین‌‌ها استفاده می‌شود. هدف‌: در کار حاضر با توجه به بعضی ملاحظات نظری درجه‌بندی‌ جدیدی برای‌ آب‌گریزی‌ اسیدهای‌ آمینه‌ ساخته‌ می‌شود مواد و روش‌ها: با‌ این فرض‌که‌ آب‌گریزی‌ اسیدهای‌ آمینه‌ به عنوان جزئی‌ از یک‌ زنجیره‌ی‌ پلی‌پپتیدی‌ بستگی‌ به‌ سطح‌ جانبی‌ ملکول‌ و محتوای‌ الکترونگاتیویته‌ی‌ آن‌ دارد، رابطه‌ای‌ که‌ آب‌گریزی‌ را به‌ سطح‌ جانبی‌ ملکول‌ اسید آمینه‌ و تعداد اتم‌های‌ اکسیژن‌ و نیتروژن‌ والکترونگاتیویته‌ی‌ اکسیژن‌ و نیتروژن‌در ملکول‌ اسید آمینه‌ مربوط‌ می‌سازد پیشنهاد شد و از روی آن اسیدهای‌ آمینه‌ از نقطه‌ نظر آب‌گریزی‌درجه‌ بندی‌ شدند. به‌وسیله این‌ درجه‌بندی‌ با استفاده‌ از روش‌ متوسط‌گیری‌ با پنجره‌ی‌ لغزنده،‌ منحنی‌ آب‌گریزی‌ گیرنده‌‌ Mel1a ملاتونین‌ انسان‌ و پروتئین‌ پرایون‌ (عامل‌ جنون‌ گاوی‌) رسم‌ شد. به‌ کمک‌ این‌منحنی‌ها ساختمان‌ داخل‌ غشایی‌ گیرنده‌‌ Mel1a ملاتونین‌ و هسته‌ی‌ آب‌گریز پروتئین‌ پرایون‌ معلوم‌ و با نتایج‌ موجود در مراجع‌ مقایسه‌ شد. نتایج‌: درجه‌‌بندی‌ پیشنهاد شده‌ در این‌ کار با درجه‌بندی‌ پیشنهاد شده‌ توسط‌ Engelman و همکارانش‌ مطابقت‌ دارد. ساختمان‌ پیش‌بینی‌ شده‌ در این‌ مقاله‌ برای‌ قسمت‌ داخل‌ غشایی‌گیرنده‌‌ Mel1a ملاتونین‌ انسان‌ و هسته‌ی‌ آب‌ گریز پروتئین‌ پرایون‌ با آنچه‌ در منابع‌ مربوط‌ است‌ مطابقت‌ بسیار دارد. نتیجه‌گیری‌: از درجه‌بندی پیشنهاد شده می‌توان برای پیش بینی توپوگرافی پروتئین‌های غشایی و پروتئین‌های توده‌ای شکل استفاده کرد.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

درجه بندی اسیدهای آمینه از نقطه نظر میزان آب گریزی آنها

چکیده مقدمه : آب گریزی ملکول ها عامل محرّک بسیاری از آثار و پدیده ها در سیستم های بیولوژیکی است. تاکنون تعداد زیادی درجه بندی آب گریزی برای اسیدهای آمینه پیشنهاد شده است. از این درجه بندی ها برای پیش بینی توپولژی پروتئین ها استفاده می شود. هدف : در کار حاضر با توجه به بعضی ملاحظات نظری درجه بندی جدیدی برای آب گریزی اسیدهای آمینه ساخته می شود مواد و روش ها: با این فرض که آب گریزی اسیدهای آمینه به...

متن کامل

مطالعات تئوری استفاده از اسیدهای آمینه به عنوان دسته جدیدی از داروهای پادزهر و بررسی کمپلکسهای آنها با Zn2+

این مقاله دسته جدیدی از لیگاندهای دودندانه را به عنوان داروهای پادزهر معرفی می کند. در این مقاله به کمک کمحاسبات تئوری در سطح AM1 اثبات می شود که برخی اسیدهای آمینه طبیعی کمپلکسهای بسیار پایداری با Zn2+ می دهند. محاسبات نشان می دهند که اسیدهای آمینه تریونین و سرین کاندیداهای بهتری هستند.

متن کامل

بررسی میزان پروتئین و اسیدهای آمینه گندم بزوستا یا در ایران

در این آزمایش میزان پروتیین و اسید های آمینه موجود در دانه و آرد گندم بزوستا یا که در چهار ناحیه مختلف کشت شده شود مورد بررسی قرا رگرفت . اختلاف نواحی مورد مطالعه از نظرمیزان پروتیین دانه و آرد این گندم معنی دار نبود. متوسط مقدار پروتئین تمامی دانه و آرد حاصله به ترتیب معادل 26/13 و 68/12 درصد بود. اثر محل در میزان تمامی اسیدهای آمینه وهمچنین مجموع آنها در دانه کامل و آرد از نظر آماری معنی دار ...

متن کامل

افزایش عملکرد و بهبود ترکیب اسیدهای آمینه و میزان پروتئین دانه گندم با استفاده از اسید فولیک

سابقه و هدف: سوء تغذیه یکی از مشکلات کنونی کشورهای در حال توسعه مانند ایران می‌باشد که کاهش تنوع غذایی از دلایل آن است. با توجه به اینکه گندم در تغذیه مردم این قبیل کشورها از جایگاه خاصی برخوردار است، محققین تلاش می‌کنند با افزایش میزان پروتئین و ترکیب اسیدهای آمینه آن به‌همراه میزان آهن انباشته شده در دانه، با تامین مواد مورد نیاز بدن به کاهش سوء تغذیه کمک نمایند. با توجه به نقش اسید فولیک در ...

متن کامل

مطالعات تئوری استفاده از اسیدهای آمینه به عنوان دسته جدیدی از داروهای پادزهر و بررسی کمپلکسهای آنها با zn۲+

این مقاله دسته جدیدی از لیگاندهای دودندانه را به عنوان داروهای پادزهر معرفی می کند. در این مقاله به کمک کمحاسبات تئوری در سطح am1 اثبات می شود که برخی اسیدهای آمینه طبیعی کمپلکسهای بسیار پایداری با zn2+ می دهند. محاسبات نشان می دهند که اسیدهای آمینه تریونین و سرین کاندیداهای بهتری هستند.

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


عنوان ژورنال

دوره 17  شماره 65

صفحات  117- 127

تاریخ انتشار 2008-04

با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.

کلمات کلیدی

کلمات کلیدی برای این مقاله ارائه نشده است

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023