Effect of Lowering PCR Reaction Volumes and Increasing the Speed of DNA Amplification on the Sensitivity of PCR

نویسنده

  • . Hajia, M
چکیده مقاله:

ABSTRACT Recently, PCR is being reported more frequently with satisfactory results on the diagnosis of clinical infections. Widespread availability of PCR promises a sensitive and specific alternative, to traditional methods, but these benefits must be balanced against cost. Protocols using small volumes have described where the reaction taken place in capillary tubes, and small volumes work when specialized thermocycler used. Despite its benefits on increasing the speed and decreasing the cost, this technique needs special equipment and thermocycler to perform which may not be possible for most molecular diagnostic laboratories. In this study, we wanted to evaluate effects of reducing time and volumes of reagents and therefore increasing speed and lowering reagent costs by routine equipment and ordinary thermocycler. In this study, M. pneumoniae DNA was extracted by phenol Chloroform method after treating with proteinase K. PCR was performed in different volumes and various amplification, and PCR products were analyzed by gel agarose electrophoresis. Experiments performed with extracted M. pneumoniae DNA confirmed that volume of reaction mixture can be decreased from 100 to 10 ul. Obtained results also proved. amplification time can be decreased from 6.5 to 3.5 minute for each cycle without losing of the sensitivity. These finding indicate dropping of the cost up to one tenth and necessary amplification time to the half in comparison with conditions. In the next step 34 throat swabs were tested with both conditions. All specimens had same sensitivity for optimized and main conditions. Performing PCR in small volumes not only reduce the cost of the test, but also can remarkably increase speed of the DNA amplification.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

the effect of taftan pozzolan on the compressive strength of concrete in the environmental conditions of oman sea (chabahar port)

cement is an essential ingredient in the concrete buildings. for production of cement considerable amount of fossil fuel and electrical energy is consumed. on the other hand for generating one tone of portland cement, nearly one ton of carbon dioxide is released. it shows that 7 percent of the total released carbon dioxide in the world relates to the cement industry. considering ecological issu...

the washback effect of discretepoint vs. integrative tests on the retention of content in knowledge tests

در این پایان نامه تاثیر دو نوع تست جزیی نگر و کلی نگر بر به یادسپاری محتوا ارزیابی شده که نتایج نشان دهندهکارایی تستهای کلی نگر بیشتر از سایر آزمونها است

15 صفحه اول

the effect of task complexity on lexical complexity and grammatical accuracy of efl learners’ argumentative writing

بر اساس فرضیه شناخت رابینسون (2001 و 2003 و 2005) و مدل ظرفیت توجه محدود اسکهان (1998)، این تحقیق تاثیر پیچیدگی تکلیف را بر پیچیدگی واژگان و صحت گرامری نوشتار مباحثه ای 60 نفر از دانشجویان زبان انگلیسی بررسی کرد. میزان پیچیدگی تکلیف از طریق فاکتورهای پراکندگی-منابع تعیین شد. همه ی شرکت کنندگان به صورت نیمه تصادفی به یکی از سه گروه: (1) گروه موضوع، (2) گروه موضوع + اندیشه و (3) گروه موضوع + اندی...

15 صفحه اول

the effect of traffic density on the accident externality from driving the case study of tehran

در این پژوهش به بررسی اثر افزایش ترافیک بر روی تعداد تصادفات پرداخته شده است. به این منظور 30 تقاطع در شهر تهران بطور تصادفی انتخاب گردید و تعداد تصادفات ماهیانه در این تقاطعات در طول سالهای 89-90 از سازمان کنترل ترافیک شهر تهران استخراج گردید و با استفاده از مدل داده های تابلویی و نرم افزار eviews مدل خطی و درجه دوم تخمین زده شد و در نهایت این نتیجه حاصل شد که تقاطعات پر ترافیک تر تعداد تصادفا...

15 صفحه اول

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


عنوان ژورنال

دوره 8  شماره 31

صفحات  14- 19

تاریخ انتشار 1999-09

با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.

کلمات کلیدی

کلمات کلیدی برای این مقاله ارائه نشده است

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023