نتایج جستجو برای: لاگ ngs

تعداد نتایج: 5426  

2015
Jeffrey H. Kim Maritza Duarte Howard Lee John Lesnick

Radiant Genomics and Labcyte have developed a low-volume, multiplexed next-generation sequencing (NGS) library preparation method using the Echo® 525 Liquid Handler. In addition to cost savings, we demonstrate an increase in sample-processing throughput with the Echo system due to efficient multiplexing, which would otherwise remain impractical using standard liquid handling automation. In addi...

2017
Irina Kuznetsova Aleksandra Filipovska Oliver Rackham Artur Lugmayr Andreas Holzinger

Next Generation Sequencing (NGS) has been a powerful tool to investigate gene networks in biological sciences [1]. Visualisation of data produced by NGS is essential for the interpretation of the findings by biological scientists. Here we describe a workflow to image findings from a NGS sequencing methodology to investigate gene expression that can be visualised with Circus software [2]. Visual...

2015
Kok-Gan Chan Zahidah Ismail

2 In this work, we characterized the metagenome of a Malaysian mangrove soil sample via next 3 generation sequencing (NGS). Shotgun NGS data analysis revealed high diversity of microbes 4 from Bacteria and Archaea domains. The metabolic potential of the metagenome was 5 reconstructed using the NGS data and the SEED classification in MEGAN shows abundance of 6 virulence factor genes, implying th...

2018
Romain Rouet Katherine J. L. Jackson David B. Langley Daniel Christ

In vitro selection technology has transformed the development of therapeutic monoclonal antibodies. Using methods such as phage, ribosome, and yeast display, high affinity binders can be selected from diverse repertoires. Here, we review strategies for the next-generation sequencing (NGS) of phage- and other antibody-display libraries, as well as NGS platforms and analysis tools. Moreover, we d...

ژورنال: پژوهش نفت 2013
حمیدرضا زاهدی‌فر کاوه آهنگری,

ر تنش‏های اصلی درجا در یک چاه، بدون شک از اصلی‌ترین عواملی است که بر پایداری آن مؤثر است. عموماً در مناطقی که از لحاظ تکتونیکی وضعیت عادی دارند، تنش‏های اصلی غالباً شامل دو مؤلفه افقی و یک مؤلفه قائم هستند. در این تحقیق، تنش‏های درجا با استفاده از فرضیات و روابط موجود در چهار حلقه از چاه‏های میدان نفتی منصوری در جنوب غربی ایران محاسبه گردید. از آنجاکه مؤثر‏ترین پارامتر در این فرآیند، چگالی سازند ...

Journal: :Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research 2016
Cloud P Paweletz Adrian G Sacher Chris K Raymond Ryan S Alden Allison O'Connell Stacy L Mach Yanan Kuang Leena Gandhi Paul Kirschmeier Jessie M English Lee P Lim Pasi A Jänne Geoffrey R Oxnard

PURPOSE Tumor genotyping is a powerful tool for guiding non-small cell lung cancer (NSCLC) care; however, comprehensive tumor genotyping can be logistically cumbersome. To facilitate genotyping, we developed a next-generation sequencing (NGS) assay using a desktop sequencer to detect actionable mutations and rearrangements in cell-free plasma DNA (cfDNA). EXPERIMENTAL DESIGN An NGS panel was ...

2012
Antonio Marchetti Maela Del Grammastro Giampaolo Filice Lara Felicioni Giulio Rossi Paolo Graziano Giuliana Sartori Alvaro Leone Sara Malatesta Michele Iacono Luigi Guetti Patrizia Viola Felice Mucilli Franco Cuccurullo Fiamma Buttitta

Microdeletions at exon 19 are the most frequent genetic alterations affecting the Epidermal Growth Factor Receptor (EGFR) gene in non-small cell lung cancer (NSCLC) and they are strongly associated with response to treatment with tyrosine kinase inhibitors. A series of 116 NSCLC DNA samples investigated by Sanger Sequencing (SS), including 106 samples carrying exon 19 EGFR deletions and 10 with...

2017
Roy Moscona Daniela Ram Marina Wax Efrat Bucris Itzchak Levy Ella Mendelson Orna Mor

INTRODUCTION Transmitted drug-resistance mutations (TDRM) may hamper successful anti-HIV-1 therapy and impact future control of the HIV-1 epidemic. Recently infected, therapy-naïve individuals are best suited for surveillance of such TDRM. In this study, TDRM, detected by next-generation sequencing (NGS) were compared to those identified by Sanger-based population sequencing (SBS) in recently i...

ژورنال: پژوهش نفت 2013

میدان بی‌بی‌حکیمه، یکی از بزرگ‌ترین میدان‌های نفتی فروافتادگی دزفول است. در این مطالعه، سنگ‌های منشأ کژدمی، گدوان و زبانه سازند کژدمی در سازند داریان در چاه بی‌بی‌حکیمه 120 مورد بررسی قرار گرفت. برای این کار از روش‌های مطالعه لاگ گاما، پیرولیز راک‌اول و مدل‌سازی حرارتی استفاده شده است. در این بررسی، زون‌های احتمالی سنگ منشأ،‌ با مطالعه لاگ گاما تفکیک و با استفاده از پیرولیز راک‌اول و مدل‌سازی ح...

ژورنال: :گام های توسعه در آموزش پزشکی 0
زینب جوادی zeinab javadi m.sc. in educational planning, school of medicine, mashhad university of medical sciences, mashhad, iranکارشناسی ارشد برنامه ریزی آموزشی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی مشهد، مشهد، ایران علی اکبر حیدری aliakbar heidari m.sc. in educational management, school of medicine, mashhad university of medical sciences, mashhad, iranکارشناسی ارشد مدیریت آموزشی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی مشهد، مشهد، ایران علی شعیبی ali shoeibia neurologist, assistant professor, department of neurology, school of medicine, mashhad university of medical sciences, mashhad, iranمتخصص بیماری های مغز و اعصاب، استادیار، گروه بیماری های مغز و اعصاب، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی مشهد، مشهد، ایران ملیحه دادگر مقدم maliheh dadgar-moghadam specialist in community medicine, assistant professor, department of community medicine, school of medicine, mashhad university of medical sciences, mashhad, iranمتخصص پزشکی اجتماعی، استادیار، گروه پزشکی اجتماعی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی مشهد، مشهد، ایران

زمینه و هدف: با توجه به آیین نامه های آزمون ارتقای دستیاری، 50 درصد از نمره آزمون ارتقای دستیاری مربوط به ارزیابی درون دانشگاهی می باشد که 30 نمره از 150 نمره آن از طریق روش ارزیابی لاگ بوک (logbook) محاسبه می شود. با توجه به اهمیت این روش در ارزیابی دستیاران، پژوهش حاضر به بررسی ارتباط فعالیت های آموزشی و عملی دستیاران در طول سال تحصیلی با موفقیت آن ها در آزمون ارتقای دستیاری پرداخت که توسط رو...

نمودار تعداد نتایج جستجو در هر سال

با کلیک روی نمودار نتایج را به سال انتشار فیلتر کنید