امروزه سوخت های پاک از جمله بیودیزل (استرهای مونوآلکیل اسیدهای چرب بلند زنجیر) بطور وسیعی مورد توجه قرار گرفته اند. در این پایان نامه ?- لینولئات متیل استر که یکی از اولین بیودیزل های بکار رفته در صنعت می باشد، مورد مطالعه قرار گرفته است. این مطالعات شامل محاسبات نظریه تابعیت چگالی، شبیه سازی های مونت کارلو و دینامیک مولکولی می باشد. مطالعات نظریه تابعی چگالی شامل بهینه سازی ساختاری و محاسبه ان...

فعالیت برخی مشتقات دارویی تتراهیدروکربازول به عنوان مهار کننده های گیرنده 5-ht6 با استفاده از روش qsar مبتنی بر ساختار پروتئین و qsar مبتنی بر لیگاند پیش بینی شد. به این منظور ساختار سه بعدی پروتئین هدف (5-ht6) از روش مدل سازی همسانی بدست آمد. سپس از داکینگ مولکولی برای بررسی برهم-کنش های موثر بین پروتئین و مشتقات تتراهیدروکربازول استفاده شد. مطالعات داکینگ مولکولی نشان داد که برهم کنش های آب گ...

در این مطالعه برهمکنش تیوتپا، عاملی آلکیله کننده که در رژیم های درمانی سرطان در غلظت بالا به کار می رود، با آلبومین انسانی بررسی می گردد. به کار گرفتن طیف سنجی های جذبی در ناحیه مرئی-فرابنفش و فلوئورسانس مرسوم، همزمانی و سه بعدی به همراه شبیه سازی های اتصال و دینامیک مولکولی، و همچنین معادلات وانت هوف و استرن-ولمر طبیعت برهمکنش بین تیوتپا و آلبومین را آشکار می سازند. عامل ترمودینامیکی ‍‍پیش برن...

مقدمه: در این تحقیق عملکرد 3 نانوموتور بر روی 15 پپتید ترانس ممبرن پروتئین پیش ساز آمیلوئید بتا از طریق شبیه سازی دینامیک مولکولی انجام گرفت. روش: در این مطالعه 14 نوع موتانت و 1 نوع نرمال پپتید ترانس ممبرن پروتئین پیش ساز آمیلوئید بتا از پایگاه داده ncbi به دست آمده و سپس شبیه سازی با استفاده از نرم افزارdesigner ascalaph  انجام شد. 15 پپتید با ساختار های 3 بعدی پایدار سنتز شده، برای ورود به م...

در این مقاله ، فرآیند صنعتی بالک برای تولید پیوسته پلی استایرن مقاوم در برابر ضربه (hips) شامل هفت راکتور همزده سری بصورت پایا و دینامیکی مدل و شبیه سازی شده است. نتایج مدل پایا با داده های واقعی بدست آمده از واحدهای صنعتی تطبیق داده شده است. نتایج شبیه سازی به اندازه کافی با داده های صنعتی تطبیق دارد.با شبیه سازی دینامیکی تغییرات زمانی میزان تبدیل ، توزیع وزن مولکولی پلیمرهای حاصل، غلظت استایر...

گرافن به علت داشتن خواص فوق¬العاده در رسانندگی الکتریکی و گرمایی، چگالی بالا و تحرک¬‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍پذیری حامل¬های بار، رسانندگی بالاو خواص مکانیکی به ماده ای منحصربفرد تبدیل شده است. در اینکارتحقیقاتی به بررسی خواص اتصال نانولوله و گرافن می¬پردازیم.برای ساختن مدارهای منطقی که برمبنای نانولوله های کربنی و گرافن¬ها هستند لازم است که آن¬ها را به روش¬های مختلف بهم وصل کنیم. عمده¬ترین هدف این پروژه بررس...

survivin پروتئینی است که مرگ برنامه‏ریزی شده سلول (آپاپتوز) را مهار نموده و چرخه تقسیم سلولی را نیز تنظیم می‏نماید. این پروتئین به شدت در اغلب تومورهای انسانی بیان می‏شود، اما در اکثر بافت‏های طبیعی تمایز‏یافته قابل شناسایی نیست. از میان مطالعات مرتبط با تاثیر جهش‏های مهارکننده survivin در سلول‏های سرطانی، فرم جهش‏یافته t34a مورد توجه بیشتری قرار گرفته است. نتایج به دست آمده از مدل‏سازی و شبیه‏...

پروتئین های متصل شونده به فلز نقش مهمی در پایداری ساختمان، سیگنالینگ، انتقال، کنترل متابولیسم و هموستازی فلزات ایفا می کنند. پپتیدها و قطعات پروتئینی با اندازه های مختلف، در زنجیره های جانبی خود دارای چندین گروه عملکردی هستند که برای اتصال به فلز مناسب هستند .از سوی دیگر برخی فلزات سنگین مانند روی و مس ریز مغذی های ضروری برای یکسری از فرایندهای فیزیولوژیکی هستند. مقادیر زیاد این فلزات و دیگر یو...

مطالعات آزمایشگاهی نشان می دهد که نانولوله های کربنی می توانند با حمل مواد مختلف از درون غشاهای سلولی به عنوان ناقلان مولکولی عمل کنند. این کاربردها مربوط به توانایی نانولوله در انتقال یک سیال و بخصوص محلول های آبی در مقیاس نانو می باشد. به همین دلیل, مطالعه سامانه های آب-نانولوله در علوم و فناوری نانو همواره از اهمیت زیادی برخوردار بوده است. در نانوچنبره ها، علاوه بر انحنای موجود در نانولوله ه...

مطابق نظریه ی آمیلویید، علّت آسیب دیدن سلول های عصبی سیستم اعصاب مرکزی در بیماران آلزایمری، تجمّع و تشکیل توده های پروتیین آمیلوییدبتا است. بدین منوال، تجزیه ی صفحه های بتا در مرحله ی ابتدایی این فرایند به عنوان یک روش درمان مناسب برای این بیماری پیشنهاد می شود. دارویی که درین تحقیق مطابق همین هدف استفاده شده، پنج پپتید جداشده از پایانه ی کربوکسیل آمیلوییدبتا با توالی گلیسین، لوسین، متیونین، والی...