در هنگام رونویسی، rna پلیمراز شروع به نسخه برداری کرده و رشته ی rna می سازد. در این پایان نامه، رونویسی rnap را در حضور نوکلئوزوم مدل کرده و برهم کنش پلیمراز و نوکلئوزوم را شبیه سازی می کنیم. حضور نوکلئوزوم در مقابل پلیمراز و یا افتادن پلیمراز در پس روی، به شدت سرعت رونویسی را کاهش می دهد و گاهی رونویسی را متوقف می کند. نتایج حاصل از شبیه سازیِ ما نشان می دهد هنگامی که افت و خیز نوکلئوزوم بر رو...

در پستانداران، بخش عمده ای از فراورده های بیان ژن را توالی های ریبونوکلئوتیدی غیر کدکننده ی پروتئین تشکیل می دهند. این توالی ها شامل مولکول های rnaی کوتاه و بلند، با اندازه هایی در بازه ی ده ها تا صدها نوکلئوتید هستند، که به مواردی از آن ها با طول بیش از 200 نوکلئوتید، rnaی بلند غیر کدکننده ی پروتئین یا lncrna گفته می شود. مولکول های lncrna که عملکردشان وابسته به ساختار مولکولی منحصر به فرد آن ...

در این پایان نامه دو نوع کنترل گر ژنتیکی مصنوعی برای کنترل فرآیند بیان ژن ارائه شده است. بدین منظور ابتدا مدل غیرخطی فرآیند بیان ژن و رفتار ترکیبات مختلف ژن ها مورد بررسی قرار گرفته است. با استفاده از این ترکیبات ساده، مقایسه کننده های ژنتیکی برای مقایسه غلظت دو فاکتور رونویسی طراحی شده و با استفاده از این مقایسه کننده ها دو نوع کنترل گر با بازخورد با هدف ردیابی خروجی از ورودی فرآیند بیان ژن، ط...

مقدمه: در یک کروماتین فشرده دسترسی فاکتورهای رونویسی به DNA به سختی صورت می‌ گیرد، بنا بر این بیان ژن به یک نوکلئوزوم باز شده نیاز دارد. در ایجاد فشردگی ساختار کروماتین فاکتور HDAC4 نقش اصلی را بازی می ‌کند. هدف این مطالعه ارزیابی اثر یک جلسه فعالیت مقاومتی بر بیان ژن hdac4 در عضله اسکلتی تند و کند انقباض رت‌ های نر نژاد ویستار بود. مواد و روش‌ ها: در این پژوهش 15 رت از انستیتو پاستور تهیه شد و...

تنش های غیرزیستی از قبیل خشکی و سرما، تأثیرات مضری بر رشد و عملکرد گیاهان دارند و تحمل به آنها از جمله اهداف اصلی اصلاح گیاهان بوده است. افزایش تحمل به چند تنش با استفاده از انتقال یک ژن تنظیمی مانند عوامل رونویسی که در مسیر های تنظیمی متعددی دخالت دارند، ممکن است. تحقیقات انجام گرفته تاکنون حاکی از موفقیت در افزایش تحمل به تنش های غیرزنده با استفاده از عوامل تنظیمی بوده است. این پژوهش با هدف ه...

داروی ضد سرطان تاکسول یا پاکلی­تاکسل از متابولیت­های بیوسنتز شده در سرخدار (Taxus bacatta) است. تاکسول یکی از مهمترین و کاربردی­ترین داروهای ضد سرطان در درمان سرطان ریه است که با جلوگیری از پلیمریزاسیون میکروتوبول­ها مانع از تقسیم سلولی در بافت­های سرطانی می­شود. عامل رونویسی JAMYC از خانواده MYC دارای موتیف متصل­شونده به DNA به‎نام bHLH می­باشد که در سایر گونه­های سرخدار شناسایی شده است. هدف ا...

زمینه مطالعه: هیپوکلسمی، یکی از بیماری های مهم متابولیک می باشد که در گوسفند بیشتر در انتهای دوره آبستنی و همچنین شروع شیرواری رخ می دهد. هدف: هدف از انجام این مطالعه بررسی اثر هیپوکلسمی تجربی برعملکرد فیزیولوژیک بدن در ارتباط با تغییرات بیوشیمیایی، آنزیمی و الکترولیتی است. روش کار: محلول edta6/4% به 5 رأcس گوسفند سالم (گروه آزمایش) به صورت انفیوِژن وریدی تزریق گردید که موجب تظاهر علائم هیپوکلسی...

چکیده زمینه و هدف: اکثر ژن های خانه دار، سرکوبگر تومور، و تقریبا 40% ژن های اختصاصی بافت ها حاوی توالی غنی از g+c در نواحی پروموتری خود می باشند که تکثیر آن با مشکلات زیادی همراه است. ژنastrocyte elevated gene -1(aeg-1) دارای نقش عملکردی در چندین مرحله از پیشرفت تومور از جمله، ترانسفورماسیون، آپوپتوزیس، متاستاز، مقاومت به شیمی درمانی، رگزایی و پیری سلول می باشد. مواد و روش کار: این مطالعه، به ب...

بیماری هموفیلی b، بصورت مغلوب وابسته به جنس به ارث می رسد و فراوانی آن در جمعیت مردان 30000/1 می باشد. فقدان و یا نقص در عملکرد پروتئین فاکتور9 در پلاسما منجر به این بیماری می گردد. سلولهای کبدی به عنوان جایگاه اصلی تولید فاکتور 9 انعقادی، میزبان مناسبی جهت بررسی بیان فاکتور 9 قلمداد می شوند. جهت بیان اختصاصی در سلولهای کبدی، به توالی های تنظیمی اختصاصی کبدی نیاز است. در این ارتباط تلفیقی از تو...

توانایی تمایز سلول های بنیادی جنینی به سمت سلول های شبه کبدی باعث ایجاد فرصت های بسیاری در زمینه مهندسی بافت کبد و کاربردهای درمانی خواهد شد. در این مطالعه، ما توانایی القاء تمایز کبدی در سلول های بنیادی جنینی موشی را به واسطه ترانسدیوس با سه فاکتور hnf4?، foxa2 و mir-122 به صورت منفرد و ترکیبی مورد مطالعه قرار دادیم. علاوه بر این سلول های بنیادی جنینی موشی با بهترین ترکیب ژنی که القاء کبدی را ...