دینامیک پرتون شرکت کننده در پیوند هیدروژنی در فرآیندهای انتقال فاز فروالکتریکی بلورهای فروالکتریکی دارای نقش اساسی می باشد. بلور ‏‎kh2po4 از جمله بلورهایی است که مولکولهای آن به واسطه وجود پیوندهای هیدروژنی در کنار هم قرار گرفته اند. مطالعات پراش نوترونی به وضوح یک سیستم پیوند هیدروژنی غیر خطی را در این بلور نشان می دهد که پیوندهای هیدروژنی در یک راستا و در یک امتداد قرار گرفته اند. در بررسی ای...

نظریه تابعی چگالی از جمله روش های مطالعه دستگاه های زیستی به شمار می آید. در این پایان نامه برآنیم که به مطالعه قدرت پیوند هیدروژنی در ساختار پلی آلانین آلفاهلیکس با استفاده از کد محاسباتی wien2k بپردازیم. آلانین از جمله آمینواسیدهایی است که تمایل زیادی برای قرارگرفتن در ساختار آلفاهلیکس از خود نشان می دهد. ساختار آلفاهلیکس را به این دلیل انتخاب کرده ایم که می توان اثر برهم کنش پپتید-پپتید را ب...

پیوند بریلیومی نوعی از پیوندهای غیرکوالانسی است که میان بریلیوم و یک گروه الکترون دهنده ایجاد می گردد. پژوهش های پیشین نشان می دهد این پیوندها بسیار شبیه پیوندهای هیدروژنی، بویژه پیوندهای هیدروژنی بسیار قوی (vshb) می باشند. در این پایان نامه، برای اولین بار امکان وجود نوعی خاص از پیوندهای بریلیومی که دارای انرژی برهمکنش زیاد می باشند با دو متد dft و mp2 بررسی شده است. برای این کار، ابتدا سیستم ...

کمپلکس جدید تک هسته ای از نیکل(ii) (1)، سنتز و بوسیله آنالیز عنصری و روش های اسپکتروسکوپی و آنالیز کریستالوگرافی تعیین ساختار گردید. بررسی آنالیز کریستالوگرافی x-ray بیانگر این موضوع است که تک بلور در ساختار تری­کلینیک متبلور شده  است:  (a = 6.859(3) å, b = 12.275(6) å, c = 18.202(9) å, α = 97.615(9)°, β = 98.336(9)°, γ = 105.118(9)° ) قسمت نامتقارن از سلول واحد، شامل دو کمپلکس تک هسته ای از نی...

زانتون ها ترکیبات پلی فنولیکی طبیعی با اسکلت سه حلقه ای ساده می باشند که به طور عمده در گیاهان جنتیاناسا وجود دارند. این دسته از ترکیبات فعالیت های داروئی و زیستی جالبی دارند. از جمله ی این خواص فعالیت های ضد باکتری، ضد ویروسی و ضد سرطان مشاهده شده است. زانتون ها هم چنین می توانند برای تخمین سطح اوره در خون به کار روند. زانتون ها هزاران مشتق دارند که با استخلاف های هیدروکسی، متوکسی، فنیل و غیره...

مهمترین عامل کاهش نفوذپذیری در لیچینگ توده­ای، حضور نرمه­ها است که به دلیل حرکت با عامل لیچینگ در مناطقی تجمع می­کنند و سبب ایجاد زون­های مرده و جریان­های کانالی در توده می­شوند. به همین دلیل در معدن مس چاه­موسی کانسنگ در ابعاد 0-2 میلی­متر با عیار مس 34/1درصد قبل از بارگذاری توده بدوناستفاده جدا می­شود. در این تحقیق به­منظور استفاده از بخش 0-2 میلی­متر از روش آگلومراسیون با استفاده از ترکیب­ها...

پروتئین ها ماکرومولکول های فعال بیولوژی هستند که اعمال مهم در ارگانیسم ها را انجام می دهند. مسئله تاخوردگی پروتئین ها یک فرآیند ضروری در ارگانیسم ها می باشد که می تواند به کمک فتوایزومریزاسیون برگشت پذیر کروموفور (یک سوئیچ مولکولی) متصل به پپتید بررسی گردد. در این تحقیق، زنجیره پپتیدی ala–cys–ala–thr–cys–asp–gly–phe (اسیدهای آمینه 141-134 از پروتئین تیوردوکسین ردوکتاز باکتری اشریشیا کلی) پس ا...

اثر پروتونه شدن موقعیت n3 بر پیوندهای هیدروژنی بین مولکولی در زوج باز 8og:c در هم صورتهای آنتی-آنتی و سین-آنتی در دو فاز گاز و حلال بررسی شده است. انرژی و داده های ساختاری مربوط به این هم-صورتها در سطح نظری b3lyp/6-311++g(d,p) محاسبه شده است. در اثر پروتونه شدن، انرژی های هم-صورتهای آنتی-آنتی و سین-آنتی به ترتیب 73 و 67 درصد افزایش می یابد. در اثر پروتونه شدن، پیوندهای هیدروژنی که به عنوان دهند...

در این پژوهش، مطالعه ای نظری بر روی پیوندهای هیدروژنی در ساختارهای بلوری سه آمینو اسید متیونین هیدروکلراید، آسپارتیک اسید هیدروکلراید، و هیستیدین هیدروکلراید مونوهیدراته با استفاده از نظریه تابعیت چگالی انجام پذیرفته است. روند اثرات محیطی و همچنین هم افزایی بر روی پیوندهای هیدروژنی با استفاده از پارامترهای حاصل از محاسبات nmr و nqr بررسی شده اند. پیوندهای هیدروژنی اصلی در شبکه بلوری آمینو اسیده...

سابقه و هدف: در این مطالعه به اثر اتصال یون فلزی روی بر تغییرات ساختاری و پایداری پروتئین آمیلوئید بتا، موثر در بروز بیماری آلزایمر در سطوح مولکولی پرداختیم. روش بررسی: این بررسی با کمک محاسبات شبیه سازی دینامیکی مولکولی و با استفاده از نرم افزار گرومکس نسخه 4.6.5 و میدان نیروی 03 Amber و مدل حلال آب SPC216 انجام گرفت. یافته‌ها: به کمک انحراف جذر مربع میانگین، صحت انجام شبیه سازی بررسی و ...