چکیده درک جزئیات تاخوردگی پروتئین اساس و پایه طراحی موفقیت آمیز مهار کننده های پروتئینی و سایر پروتئین های دارویی است. پروتئین ها فقط در صورتی عملکرد درستی دارند که شکل مطلوب را به خود بگیرند . علی رغم انجام چند دهه تحقیق و مطاالعه این سوال هنوز وجود دارد که ساختارهای عملکردی پروتئین چگونه از ساختمان اوّل پروتئین ایجاد می شوند. پاسخ به این مسأله می تواند به درک علت تعدادی از بیماری ها که حاصل...

مسیر بیوسنتز اسید چرب یکی از مسیرهای مهم در بدن اکثر موجودات (پروکاریوت‌ها و یوکاریوت‌ها) است که آنزیم Acyl carrier protein (ACP) نقش مهمی در مسیر بیوسنتز اسید چرب دارد. هدف از این مطالعه آنالیز in silico و فیلوژنتیکی ژن ACP است. با آنالیز های بیشتر مشخص شد که ژنACP در پروکاریوت‌ها دارای 4 اگزون و 3 اینترون و 2mRNA و در یوکاریوت‌ها دارای 13 اگزون، 12 اینترون و 9 mRNA است. این پروتئین در یوکا...

آلفا-لاکتالبومین از نظر مقدار دومین پروتئین آب پنیر مهم موجود در شیر گاو است. وع انسانی این پروتئین عملکردهای فیزیولوژیکی زیادی در دوران نوزادی دارد.در غده های پستانی این پروتئین به عنوان یک کوآنزیم در بیوسنتز لاکتوز شرکت می کند. و تولید و ترشح شیر را تسهیل می بخشد. آلفا-لاکتالبومین پروتئینی کوچک و اسیدی با وزن مولکولی 14 کیلودالتون و متشکل از 123 آمینو اسید است که با هم یک ساختار کروی تشکیل می...

مسیر بیوسنتز اسید چرب یکی از مسیرهای مهم در بدن اکثر موجودات (پروکاریوت‌ها و یوکاریوت‌ها) است که آنزیم Acyl carrier protein (ACP) نقش مهمی در مسیر بیوسنتز اسید چرب دارد. هدف از این مطالعه آنالیز in silico و فیلوژنتیکی ژن ACP است. با آنالیز های بیشتر مشخص شد که ژنACP در پروکاریوت‌ها دارای 4 اگزون و 3 اینترون و 2mRNA و در یوکاریوت‌ها دارای 13 اگزون، 12 اینترون و 9 mRNA است. این پروتئین در یوکا...

امروزه بررسی پارامترهای شیمی فیزیکی برهم کنش ماکرومولکول های زیستی با برخی از مولکول های کوچک در بدن، مانند عوامل دارویی و عوامل تشخیصی، می تواند نقش بسیار مهمی در طراحی و سنتز داروهای جدید داشته باشد.سرم آلبومین ها یکی از فراوانترین پروتئین ها در سیستم گردش خون در بدن می باشند که تاکنون مطالعات بسیار زیادی در مورد برهم کنش این پروتئین ها با مواد مختلف صورت گرفته است. در این رساله سعی بر آن ش...

در بخش اول این رساله برهمکنش های بین بازشیف های چهار دندانه ای [n2s2] و آلبومین سرم انسانی با بهره گیری از روش های محاسباتی و طیف سنجی مورد مطالعه قرار گرفته است. نتایج حاصل از داکینگ مولکولی نشان می دهد که هر سه بازشیف در جایگاه 3 آلبومین سرم انسانی (زیر واحد ib) قرار می گیرند و تمایل زیادی برای اتصال به این پروتئین از خود نشان می دهند. از تجزیه و تحلیل داده های شبیه سازی می توان نتیجه گرفت که...

سابقه و هدف: اسهال یک بیماری رایج میان گوساله ها بوده که سبب زیان اقتصادی چشمگیر در صنعت گاوهای شیری و گوشتی به علت افزایش میزان مرگ و میر، هزینه‌های درمان و کاهش نرخ رشد و افزایش سن اولین زایمان می‌گردد. روتاویروس گاوی یکی از عوامل اصلی ابتلا به اسهال در گوساله ها در سن یک تا دوهفتگی است. دو پروتئین vp4 و vp7 کپسید خارجی ویروس را ساخته و سبب تولید آنتی بادی و تحریک سیستم ایمنی می‌شوند. لاکتوفر...

ویروس پاپیلومای انسانی (hpv)، یک عامل بیماری زای مهم است که می تواند باعث ایجاد مشکلاتی در سلامتی گردد. hpv به خانواده پاپیلوماویریده تعلق دارد. این ویروس دارای ژنوم dna دو رشته ای می باشد که این ژنوم توسط پروتئین های کپسیدی حفاظت می شود. تا به حال، بیش از 200 تایپ hpv مختلف شناسایی شده است. hpvها به دو گروه جداگانه ی پرخطر و کم خطر دسته بندی می شوند. تایپ های کم خطر مانند hpv6 و hpv11 باعث ایج...

سابقه و هدف: به‌طورکلی عوامل ایجادکننده‌ی ورم پستان به دو دسته‌ی عوامل واگیردار (نظیر: استافیلوکوکوس اورئوس) و عوامل محیطی نظیر (اشرشیاکلای) تقسیم‌بندی می‌‌شود. راه رایج درمان این بیماری استفاده از آنتی بیوتیک هاست که می‌تواند موجب بروز مشکلاتی مرتبط با سلامت انسان شود. پپتیدهایی که در محیط آزمایشگاهی یا در موجودات زنده از هضم ناقص پروتئین ها ایجاد و دارای عملکرد زیستی خاص باشند را اصطلاحا پپتی...

در حال حاضر روش های in silico یکی از کم هزینه ترین و سریعترین روش های موجود جهت طراحی و کشف دارو در زمینه درمان محسوب می گردد. در این مطالعه ما علاقه مند شدیم تا با انجام طراحی محاسباتی دارو به روش داکینگ مولکولی ترکیباتی را معرفی کنیم که نقش موثری در مهار پلی مریزاسیون توبولین ها به عنوان عوامل اصلی تقسیم سلولی در تومورهای سرطانی دارند. بدین منظور ترکیبات کرومنی که توسط محققین مختلف خواص ضد سر...