به دلیل سرعت بالای تکامل ژنوم هسته ای، مطالعات تکاملی بر روی ژنوم میتوکندریایی صورت می گیرد. از سوی دیگر تغییرات نوکلئوتیدی (جهش) در ژنوم میتوکندریایی یکی از مهمترین دلایل در ایجاد بیماری در مهره داران است. هدف از این پژوهش شناسایی، جداسازی و همسانه سازی ژن nd1 از ژنوم مرغ بومی خراسان و مقایسه آن با سایر توالی های ژنومی و پروتئینی این ژن به منظور بررسی جهش های احتمالی است. بدین منظور، از نمونه ...

طی سال های اخیر توجیه جدیدی برای برخی از بیماری های ژنتیکی ارائه شده است. گسترش توالی های سه تایی (سه نوکلئوتیدی) می تواند باعث از هم گسیختگی یک ژن یا پیوستگی توالی های دو ژن به هم شود. حضور این گسترش ها گاهی شامل هزاران تکرار سه نوکلئوتیدی است و نشان می دهد پردازش dna و rna ممکن است باعث برخی بیماری های خاص شود. نحوه اعمال اثر گسترش یک توالی بر ایجاد یا تشدید یک بیماری هنوز کاملاً روشن نشده است...

در این پایان نامه‏، مسأله ی جستجوی گرافی مخفی از یک خانواده از گراف ها روی ‎‎n‎‏ رأس‏‏، بررسی می شود. در مدلی که از آن استفاده می کنیم‏، تنها عمل مجاز عبارت است از این پرسش که: ”آیا یک زیرمجموعه از رئوس‏، دارای یالی از این گراف مخفی است؟“. هدفی که در این راستا مطرح می شود‏، تخمین کم ترین تعداد پرسشی است که ‎‏برای شناسایی گراف مخفی مورد نیاز است‎. برای رسیدن به این هدف عموماً از الگوریتم های غیرا...

ارزیابی و حفاظت از مرغان بومی به عنوان منابع ژنتیکی، برای بهبود آنها در آینده ضروری است. یکی از راههای شناسایی این نژادها استفاده از تکنیکهای مولکولی بخصوص استفاده از ژنوم میتوکندری است. در این تحقیق تنوع ژنتیکی مرغان بومی گردن لخت با استفاده از تجزیه و تحلیل توالی ژنوم میتوکندری بررسی شد. برای انجام این تحقیق یک قطعه 455 ژنوم میتوکندری در 20 مرغ گردن لخت پس از تکثیر توسط پرایمرهای d-loop ناحیه...

در این پژوهش قصد داریم شیوه های مختلف و راهکارهای گوناگون ساخت گراف های رشته را مورد مطالعه و بررسی قرار دهیم. گراف های رشته در حقیقت خود یک شکل بهینه شده از گراف های همپوشان هستند. گراف های رشته و همپوشان توسط رشته هایی موسوم به خوانش موجود در ژنوم موجود زنده، توالی ژنوم را تعیین می کنند. در این زمینه به دلیل حجم داده ای بالا و لزوم ذخیره سازی سریع آنها، روش های متفاوتی با زمان های اجرای مختلف...

مقدمه: با افزایش تعداد باکتری هایی که توالی یابی می شوند، نیاز به بهره برداری از این داده ها نیز بیشتر می شود. استفاده از این اطلاعات ژنومی از طریق به کارگیری هم زمان علوم بیوانفورماتیک و باکتری شناسی امکان پذیر می باشد. مطالعه ی بیوانفورماتیک اندازه ی ژنوم باکتری های بیماری زا، تنوع قابل توجهی را نشان می دهد. فرضیات زیادی در مورد علت این تنوع و همچنین ارتباط اندازه ی ژنوم و فرایندهای اساسی باک...

سابقه و هدف : پروتئین‌های LEA اولین بار در گندم و پنبه به عنوان پروتئین‌های تجمعی در اواخر دوره جنینی شناسایی و مطرح شدند. بیشتر دسته بندی‌های عمومی ژن‌های LEA به وسیله استنباط از ساختار دمین های پروتئینی یا ویژگی های شیمیایی بدست می‌آید. روش‌های بیو انفورماتیکی روش‌های مفیدی برای مطالعه ژنوم در شرایط خارج آزمایشگاهی می‌باشند. مواد و روشها : در این تحقیق جهت مطالعه ژن Wdhn13 پروتئین های LEA درگ...

هدف این پژوهش بررسی و تعیین توالی نوکلئوتیدی 7 ژن tRNA در ژنوم میتوکندری مرغ بومی خراسان و شناسایی جهش‌های احتمالی در آن بود. بدین منظور پس از نمونه‌ گیری و استخراج DNA از خون، این بخش از ژنوم با استفاده از آغازگرهای اختصاصی تکثیر و در پلاسمید pTG19-T در سویه <...

در این مطالعه، به منظور آگاهی از ساختار ژنتیکی اسب های بومی ایران در مقایسه با نمونه های خارجی، نمونه های خون از 95 رأس اسب از جمعیت های متعدد نقاط مختلف کشور و 114 توالی d-loop میتوکندری از بانک اطلاعات ژنوم بدست آمد. dna کلیة نمونه های بومی با استفاده از روش شستشوی نمکی استخراج شده و بعنوان الگو برای تکثیر و تعیین توالی ناحیة d-loop ژنوم میتوکندری بکار برده شدند. با آنالیز توالی قطعة 247 جفت ...

بر خلاف مرغ که اطلاعات ژنومی آن کامل است، اطلاعات ژنتیکی زیادی در رابطه با بلدرچین در دسترس نیست. با توجه به شباهت¬های ژنتیکی بلدرچین ژاپنی با مرغ و تکمیل نقشه ژنومی مرغ، توالی ژنومی تطبیقی آن و همولوژی مرغ با از جمله بلدرچین می تواند مورد مطالعه قرار بگیرند و نقشه ژنومی آن تهیه شود. هدف از این تحقیق بررسی همسانی ژنوم بلدرچین ژاپنی و مرغ بر اساس توالی dna بود. برای این منظور بخشی از توالی dna ژ...