مقدمه : تعیین ساختار سوم پروتئین ها با استفاده از روش کریستالوگرافی اشعۀ x ، روشی زمان بر بوده که نیازمند تسهیلات خاص و اپراتور های متخصص می باشد. تعیین ساختار سوم با استفاده از روش ‎ های بیوانفورماتیک برای مطالعات آزمایشگاهی و به ویژه اکتشاف داروها و ارتباطات تکاملی ارزشمند است. در مطالعۀ حاضر با استفاده از نرم افزارهای بیوانفورماتیکی و پایگاه های اطلاع رسانی، ساختارهای سوم انواع کانال های سدی...

چکیده زیست شناسی نظام پرداز روشی است که در آن با عجین کردن تجربه و مدل سازی محاسبه ای و نظریه در یک چرخه «خود تقویت کننده» به پرسش های زیست-شناسی پاسخ داده می شود. زیست شناسی نظام پرداز را به این صورت می توان توصیف کرد: موضوعی است که در آن با بررسی کمّی و تعبیر پیچیدگی ها در سیستم های زیست شناختی مدُل هایی ساخته شود که به کمک آن ها بتوان نتایج را از داده ها پیش بینی کرد. زیست پزشکی نظام پرداز عبا...

پروتئین ها‎ مولکول های زیستی پراهمیتی هستند که فعالیت های مختلفی را در بدن موجودات زنده انجام می دهند. آن ها معمولا برای انجام فعالیت های خود به یکدیگر متصل می شوند یا به اصطلاح با یکدیگر برهمکنش‏‎ دارند. یک شبکه ی برهمکنش پروتئین‎، در یک گونه ی خاص از جانداران پروتئین های آن گونه و برهمکنش بین آن ها را نشان می دهد. یک کمپلکس پروتئینی‎، اجتماعی از پروتئین ها است که باهم برهمکنش داشته و عمل زیس...

زمینه و هدف: بیماری قلبی - عروقی یکی از مهم ترین علل مرگ و میر در کشورهای پیشرفته و جهان سوم است. طبق اعلام سازمان بهداشت جهانی پیش بینی می شود مرگ و میر ناشی از بیماری های قلبی تا سال 2030 به 23 میلیون نفر افزایش می یابد. در جدیدترین آمار وزیر بهداشت ایران، ۳/۳۹% کل مرگ و میرها ناشی از بیماری های قلبی - عروقی و 5/19% مربوط به سکته های قلبی گزارش شده است. این پژوهش با هدف پیش بینی بیماری عروق ک...

درک چگونگی کدگذاری ‏از اطلاعات مشخص کننده زمان و مکان رونویسی یک ژن به محصول پروتئینی، ‏هدف اصلی در زیست شناسی مولکولی است. پروتئین های واسطه معروف به فاکتورهای رونویسی این فرآیند را به وسیله ی تعامل با ‎dna‎‎‏های سلول و ماشین های رونویسی تسهیل ‏می بخشند. این از اهمیت بسزایی در شناسایی همه توالی های محل های اتصال فاکتور رونویسی در dna ‎‎ مشخص برخوردار است.‎‎ ‎‎در این پایان نامه مسأله محاسباتی م...

چکیده زیست‌شناسی نظام‌پرداز روشی است که در آن با عجین‌کردن تجربه و مدل‌سازی محاسبه‌ای و نظریه در یک چرخه «خود تقویت کننده» به پرسش‌های زیست-شناسی پاسخ داده می‌شود. زیست‌شناسی نظام‌پرداز را به این صورت می‌توان توصیف کرد: موضوعی است که در آن با بررسی کمّی و تعبیر پیچیدگی‌ها در سیستم‌های زیست شناختی مدُل‌هایی ساخته شود که به کمک آن‌ها بتوان نتایج را از داده‌ها پیش‌بینی کرد. زیست پزشکی نظام‌پرداز عبا...

صنعت گردشگری در سال های آغازین قرن 21 به یک فعالیت عظیم اقتصادی تبدیل گشته و یکی از پر درآمد و اشتغال زاترین صنایع جهانی قلمداد می گردد. یکی از مهم ترین گام ها در این صنعت، مکان یابی سایت های مناسب برای ارائه خدمات مورد نیاز گردشگران در قالب دهکده های گردشگری است. مکان یابی دهکده های گردشگری اغلب تابعی از تقاضای گردشگری، دسترسی مناسب به نواحی خدماتی و وجود یک یا چند جاذبه گردشگری در آن منطقه می...

در سال های اخیر زیست واکنش گاه های کوچک مقیاس موازی با تجهیزات برخط برای کاهش زمان و هزینه های مورد نیاز توسعه فرایندهای زیستی، مورد توجه هستند. با وجود توسعه انواع زیست واکنش گاه های کوچک مقیاس، تا کنون گزارش های اندکی از نتایج مطالعه بر روی زیست واکنش گاه های مینیاتوری حبابی منتشر شده است. در این پژوهش، سامانه متشکل از سه زیست واکنش گاه مینیاتوری حبابی با حداقل حجم کاری 20 میلی لیتر با توجه س...

افعال مرکب، زیرمجموعه ای بسیار متداول از واژگان مرکب هستند که به دلیل خصوصیات ساختاری و معنایی ویژه ای که دارند، چالش هایی در برخورد با آنها در سیستم های محاسباتی وجود دارد. اخیرا، کارهایی در تشخیص خودکار افعال مرکب، در زبان هایی که از نظر محاسباتی غنی هستند، مثل زبان انگلیسی انجام شده است. هدف ما توسعه ی چنین تکنیک هایی برای برخورد خودکار با افعال مرکب در یک زبان مثل زبان فارسی است که منابع مح...

همردیفی توالی ها روشی برای در اختیار گرفتن اطلاعات اساسی در بیوانفورماتیک است. با این حال، حل مساله ی همردیفی توالی های چندگانه دشوار است. در این پایان نامه ، بهینه سازی تجمع ذرات و الگوریتم ژنتیک برای حل این مساله استفاده شده است. درالگوریتم تجمع ذرات، هر ذره نشان دهنده ی یک همردیفی است و ذرات برای رسیدن به جواب با استفاده از برخی قوانین حرکت می کنند. همچنین در الگوریتم ژنتیک هر کروموزوم به عن...