همولیزین یک پروتئین خارج سلولی است که توسط بسیاری از باکتری های بیماری زا و غیر بیماری زا ترشح می شود. سطح فعالیت آنها غشای پلاسمایی گلبول های قرمز خون می باشد. همولیزین جزء سموم وابسته به کلسترول می باشد یعنی کلسترول را به عنوان گیرنده بر روی سطح سلول های خونی شناسایی کرده و از طریق آن به سلول هدف متصل می شود. در این تحقیق ما بر روی همولیزین گونه ایی از باسیلوس به نام باسیلوس پامیلوس safr0032 ...

نحوه استقرار و نفوذ مولکول های بنزن در حفرات زئولیت nay توسط شبیه سازی دینامیک مولکولی مورد بررسی قرار گرفت. شبیه سازی ها در هنگرد nvt با گام زمانی 1 فمتوثانیه طی دو مرحله انجام گرفتند. در مرحله اول پیکربندی هایی شامل 16، 32، 64 و 96 مولکول بنزن به همراه یک سلول واحد زئولیت جهت بررسی استقرار مولکول های بنزن در حفرات زئولیت، شبیه سازی شدند. در مرحله دوم چندین شبیه سازی برای یک پیکربندی ثابت محتو...

مطالعه شبیه سازی کامپیوتری همه جانبه و گسترده ای برای ضریب خود پخشی ? گرانروی برشی و رسانایی گرمایی سیالات انجام شده است. علاوه بر شبیه سازی های مولکولی? در محاسبه ضریب خود پخشی از نظریه حجم آزاد استفاده شده است. نظریه افت و خیز چگالی گرانروی برشی در محاسبه گرانروی برشی به کار گرفته شده است و نتایج با مقادیر شبیه سازی مقایسه شده اند. این روشها قابل گسترش برای سامانه های چند اتمی است . بیان تحل...

چکیده ترکیب یک فلز و یا یک شبه فلز با کربن، کاربید نامیده می شود. مطالعه کاربیدهای فلزهای قلیایی و قلیایی خاکی، به علت واکنش پذیری بالا و ناپایداری گرمایی این ترکیب ها در شرایط محیطی، از نظر آزمایشگاهی با مشکل هایی همراه است. از طرف دیگر, اخیراً سنتز نانوساختارهای کربنی و ترکیب های گوناگون آلی با استفاده از بنیان c22- مورد توجه قرار گرفته است. نتیجه های آزمایشگاهی نشان می دهند که از واکنش کاربی...

در این پایان نامه، با استفاده از تکنیک شبیه سازی دینامیک مولکولی، خواص گرمایی(رسانندگی گرمایی) آلومینیم در مقیاس ماکرو و نانوسیم آلومینیم مطالعه شده است. در شبیه سازی ها زبان برنامه نویسی فرترن استفاده شد و شبیه سازی ها در هر دو هنگرد npt و nvt انجام شده است. از پتانسیل بس ذره ای ساتن-چن برای محاسبه ی انرژی و نیرو استفاده شده است. برای کنترل دما و فشار، به ترتیب از ترموستات نوز-هوور و باروستات ...

امروزه داروهای ضد صرع از جمله داروهایی هستندکه مورد توجه زیادی واقع شده اند. در این پایان نامه به مطالعه ی داروی لاموتریژن که نوعی داروی ضد صرع می باشد، توسط نظریه تابعیت چگالی و شبیه سازی دینامیک مولکولی پرداخته شده است. پارامترهای میدان نیروی متعلق به این دارو برای اولین بار محاسبه شده است. برای رسیدن به پارامترهای میدان نیروی مورد نظر از طریق نظریه تابعیت چگالی از نر م افزارg09 استفاده شده ا...

خوداجتماعی مولکولی فرآیندی است که در آن مولکولها توسط برهمکنشهای غیرکوالانسی، مانند برهمکنشهای الکترواستاتیک، آبگریزی و پیوند هیدروژنی، گردهم می آیند و اجتماعات اَبَرمولکولی تشکیل می دهند. تشکیل مایسل، وزیکول و ساختارهای دولایه به وسیله ی مولکولهای دوگانه دوست و همچنین تشکیل دسته های پلی الکترولیتی که عامل آن برهمکنشهای الکترواستاتیک است، مثالهایی از این پدیده هستند. در این میان خوداجتماعی پپتیده...

چکیده: گاز طبیعی یکی از اعضای خانواده سوخت های فسیلی است که استفاده از آن ها برای تامین انرژی اخیرا افزایش یافته است. ارزش گاز طبیعی با کاهش مقداردی اکسید کربن افزایش می یابد. بناابراین جدا سازی کربن دی اکسید از متان یک عملیات رایج درصنعت گاز طبیعی است. از زمان کشف نانولوله های کربنی تعداد زیادی ااز مطالعات آزمایشگاهی به جذب گاز روی نانو لوله کربنی اختصاص یافت. در این مطالعه ما از یک نانولول...

در مقاله حاضر، شبیه سازی دینامیک مولکولی جریان پوآزی حاوی آرگون مایع درون یک نانوکانال با اعمال نیروی خارجی روی ذرات سیال، با استفاده از تابع پتانسیل های مختلف انجام شده است. برای محاسبه برهم کنش های بین اتم ها از سه مدل تابع پتانسیل لنارد-جونز مختلف، استفاده شده است. مدل های پتانسیل های بین مولکولی مدل شده عبارتند از: پتانسیل لنارد-جونز 6-12، پتانسیل لنارد-جونز 6-9، پتانسیل لنارد-جونز هموار. ا...

رفتار جریان داخل نانوکانال­ها با توجه به گسترده شدن کاربردهای آنها در سیستم­های نوین از اهمیت زیادی برخوردار است. با توجه به نتایج بدست آمده در این تحقیق شرط عدم لغزش روی دیواره نانوکانال، شرط قابل قبولی نیست زیرا لغزش در این ابعاد به پارامترهای متفاوتی از جمله زبری سطح دارد. در این تحقیق با ثابت نگه داشتن مساحت جانبی زبری ، اثر تغییر شکل آن بر روی رفتار جریان سیال بررسی شده است. مدلسازی به کمک...