هدف اصلی از این پژوهش بررسی پارامترهای موثر بر پخش نانو قطره نقره بر روی سطح مس با روش شبیه سازی دینامیک مولکولی است. ا ین شبیه سازی در هنگرد کانونیک (npt) انجام شده است. در این شبیه سازی از پتانسیل مورس و پتانسیل ساتن-چن کوانتومی استفاده شده است و برای حل معادلات دیفرانسیل جفت شده بین ذرات و محاسبه مسیرهای فاز از روش سرعت ورله استفاده کرده ایم. با تغییر تعداد اتم های نانو قطره نقره، اثر شعاع د...

زئولیت ها جامداتی بلوری با حفره های بسیار ریز هستند که از آن ها به عنوان جاذب و کاتالیزور در صنعت پتروشیمی و سایر صنایع شیمیایی می توان استفاده کرد. لذا بررسی نفوذ و مهاجرت مولکول های مهمان در زئولیت ها حائز اهمیت می باشد. زئولیت- بتا به دلیل دارا بودن مقدار سیلسیم فراوان و همچنین حلقه های 12 عضوی یک زئولیت بسیار مناسب برای استفاده در صنعت پتروشیمی محسوب می شود. یکی از بهترین روش ها برای محاسبه...

در قسمت دوم تحقیق، شبیه سازی دینامیک مولکولی با هدف بررسی ویژگی های مولکولی کپسوله کردن داروی ضد سرطان مکلورتامین درون نانو لوله های تک جداره ی کربن و بور نیترید به کار گرفته شد. نمودارهای انرژی رسم و با استفاده از این نموارها پایداری سیستم ها تخمین زده شد. همچنین زاویه ی قرار گیری دارو درون نانو لوله ی بور نیترید محاسبه شد. علاوه بر این، بوسیله ی نمودارهای تابع توزیع شعاعی اتم- اتم حلال پوشی د...

تصحیحات کوانتومی با استفاده از روش فیمن- هیبس برای نئون جامد در نظر گرفته شده است. یک عبارت ساده و جدید با پتانسیل hfd-like بدون نیاز به محاسبات وقت گیر سه ذره ای به کار برده ایم. نتایج به دست آمده نشان می دهد که پتانسیل چند ذره ای و تصحیح یافته کوانتومی hfd-like پیش بینی نتایج دوذره ای کلاسیکی را بهبود می بخشد.

این سوال مطرح است که آیا حضور پیوندهای دی سولفید، نقشی در سازش آنزیم ها برای حفظ فعالیت در دماهای مختلف دارد؟ برای این منظور مطالعات مقایسه ای خواص دینامیکی این آنزیمها انجام شد. نتایج ما در هر دو مقایسه (ahaباbaa وaha با (ppaنشان داد نوسانات ساختار، فواصل باقیمانده های عملکردی و همبستگی حرکتی بین اسیدآمینه های مهم در عملکرد، الگوی پیوند هیدروژنی و توزیع نیرو های وان دروالس و الکترواستاتیک در م...

کربن دی اکسید به عنوان یک ناخالصی در گاز طبیعی شناخته شده است. این گاز سبب کاهش مطلوبیت گاز طبیعی گردیده و حذف آن امری ضروری است. یکی از روش های حذف این ترکیب استفاده از حلال های آلکانول آمینی می باشدکه حلال هایی پرکاربرد در صنعت می باشند. پژوهش حاضر تمرکز خود را بر بررسی ساختاری و ترمودینامیکی حذف کربن دی اکسید با استفاده از این حلال ها با بکارگیری شبیه سازی دینامیک مولکولی قرار داده است. هدف ...

در این تحقیق، ذخیره سازی گازهای نجیب روی نانولوله های کربنی با استفاده از روش دینامیک مولکولی بررسی شده است. مقدار جذب گازهای زنون، آرگون، نئون و هلیم روی نانولوله های کربنی در دمای ثابت و فشارهای مختلف محاسبه شده است. مجموعه نانولوله های کربنی شامل نانولوله های (8،8)، (9،9)، (10،10)، (11،11) و (12،12) در نظر گرفته شده است. اثر قطر نانولوله های کربنی بر میزان جذب در شرایط اشباع نیز مطالعه شده ا...

کاتالیز آنزیمی در یک ساختار ثابت انجام نمی شود و واکنش شیمیایی در مجموعه ای از حالت های ساختاری به هم پیوسته از مولکول آنزیم رخ می دهد. دینامیک درونی آنزیم برای تبدیل این ساختارها و در نتیجه عملکرد زیستی آنزیم لازم و ضروری می باشد. با استفاده از شبیه سازی دینامیک مولکولی، اطلاعات ارزشمندی از حرکت ها و ساختارهای لحظه ای مولکول آنزیم بدست می آید که برای درک ارتباط بین ساختار و عملکرد آنزیم کاربرد...