استفاده از پایگاه داده های ژنومی موجود از جمله hap map و مطالعات مجازی ارتباطی کل ژنوم، امکان تعیین مارکرهای ژنتیکی شناخته شده مرتبط با بیماری های پیچیده1 را فراهم می کند. مطالعات ارتباطی کل ژنوم شامل بررسی مستقیم پلی مورفیسم ژنتیکی در گروه های بزرگی از افراد سالم و بیمار می باشد که ابزار قوی برای شناسایی آللهای با پنترانس2 پایین ایجاد می کند که قبلاً با مطالعات پیوستگی قابل شناسایی نبود. همچنین...

زمینه: لپتوسپیروز بیماری مهم مشترک انسان و دام است که انتشار جهانی دارد و توسط اسپیروکت های پاتوژن متعلق به جنس لپتوسپیرا ایجاد می شود. تشخیص بر پایه یافته های سرولوژی نیاز به آزمون سرم های حاد و دوران نقاهت دارد و تکنیک مولکولی PCR دارای اختصاصیت و حساسیت بالایی برای تشخیص زود هنگام این بیماری می باشد. مواد و روش‌ها: پس از 7 الی 10 روز از گسترده رخداد تب خونریزی دهنده دامی منطقه تالاب رود حله ...

زمینه: تبدیل اپی‌ژنتیکی سلول‌های سوماتیک مختص بیمار به سلول‌های رویانی به‌دلیل اهمیت آن در پیوند سلول‌های بنیادی و سازگاری با گیرنده ازارزش بسیاری برخوردار است. با این‌حال، به‌کارگیری درمانی سلول‌های به‌دست آمده به‌دلیل مشکلات فنی و موضوعات اخلاقی امکان‌پذیر نیست. اخیرا روش‌های جدیدی مطرح شده که با بیان اکتوپیک فاکتورهای رونویسی دوره رویانی سلول سوماتیک را به سلول شبه رویانی تبدیل کرده‌اند. محد...

چکیده در چند دهه اخیر، تلاش برای شناسایی نقش تغییرات ژنتیکی و اثر آنان بر پیشگیری و بروز بیماری ها یکی از اساسی ترین اهداف علم پزشکی شده است. از آنجا که راهنمایی و دستورات پزشکی بر اساس خصوصیات میانگین تنظیم می شود که نمی تواند برای تعداد زیادی از انسانها مصداق داشته باشد، لذا پزشکی فرادقیق یا پزشکی شخص محور (precision medicine or personal medicin) جهت استفاده از یکسری خصوصیات ژنتیکی، ژنومیکی، ...

اختلالات شنوایی فراوانترین نقص حس در انسان است، از هر 1000 تولد یک مورد دارای نقص شنوایی است . طبق مطالعات انجام شده ، حدود نیمی از ناشنوایی ها منشا ژنتیکی دارند که حدود 70 تا 80 درصد این نوع ناشنوایی به صورت اتوزومال مغلوب ، 15 تا 20 درصد به صورت اتومازول غالب و 2 تا 3 درصد آن از طریق وابسته به کروموزوم ‏‎x‎‏ و یا بصورت میتوکندریایی به ارث می رسد. همچنین حدود 30 درصد از اختلالات شنوایی ژنتیکی ...

هدف از این پژوهش بررسی میزان متیلاسیون شماری از ژنهای مهم مرغ بود. بدین منظور 32 ژن از genbank انتخاب شد. پروموتورهای این ژنها با نرم افزار promoter prediction پیدا شدند. جزایر احتمالی موجود در هر توالی با نرم افزار cpg island searcher مشخص شدند. احتمال متیله شدن هر رشته dna یک ژن، با نرم افزار methylator و آنالیز متیلاسیون با نرم افزار epigraph انجام شد. در نهایت با استفاده از مدل مارکف پنهان،...

جمعیت شترهای تک کوهانه و دوکوهانه ایرانی به ترتیب در حدود 150000 و 100 نفر می باشد. شتر دوکوهانه ایران جزء گونه های در معرض خطر محسوب شده و زیستگاه آن در شمال غربی ایران است. از این بابت توجه بیشتر به این نژاد از دیدگاه ژنتیک حفاظتی با توجه به کاهش شدید جمعیت آن، بسیار حائز اهمیت است. این پروژه با هدف تعیین توالی ژنوم میتوکندری و بررسی های بیوانفورماتیکی در دو گونه شتر تک کوهانه و دو کوهانه ایر...

مدل های مارکوف پنهان دسته ای از فرایندهای تصادفی هستند که در مسائل کاربردی بسیار متنوعی با موفقیت به کار رفته اند. در این پایان نامه، مباحث مربوط به مدل احتمالی مارکوف پنهان در رابطه با مسأله ژن یابی در توالی های dna ارائه گردیده است. ژن ها قسمت هایی از dna می باشند که توانایی سنتز پروتئین ها را دارند. بنابراین ژن یابی مرحله بسیار حساسی در تحلیل داده های توالی dna است.

با گسترش علم کامپیوتر، زمینه های پژوهشی آن نیز بسیار گسترش یافته و به علوم دیگر راه یافته است. یکی از این زمینه ها علم ژنتیک است. رشته ی بیوانفورماتیک در واقع حاصل ورود این علم به حوزه کامپیوتر است. با شناسایی ژنوم انسان در سال 2003 و همچنین پایان یافتن پروژه hapmap در سال 2007، زیست شناسان به این نتیجه رسیدند که، بیشتر از 99% رشته dna همه انسان ها یکسان و تنها کمتر از 1% آن متفاوت از یکدیگر اس...