بررسی میزان مهارکنندگی ترکیبات آمینوکاپرولاکتام و 1و3و4- تیادیازول 2-تیون به روش qsar با استفاده از تکنیک های mlr ،ann gnn
پایان نامه
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهید باهنر کرمان - دانشکده علوم پایه
- نویسنده سولماز احمدغلامی
- استاد راهنما مهدی موسوی
- تعداد صفحات: ۱۵ صفحه ی اول
- سال انتشار 1390
چکیده
چکیده: در این پروژه به منظور بررسی مهارکنندگی آنزیم گاما سکرتاز توسط مشتقات آمینوکاپرولاکتام، log ic50 آنها به روش ارتباط کمی ساختار- فعالیت (qsar) مدل سازی شد. در مرحله اول یک سری داده شامل52 مولکول انتخاب و به دوسری مرجع و پیش بینی شونده تقسیم شدند. در مرحله بعد 1497 توصیف کننده برای هر مولکول محاسبه شد. در آنالیز توصیف کننده ها 969 توصیف کننده که دارای مقادیر ثابت یا همبستگی بالا بودند حذف شدند. در مرحله سوم رگرسیون خطی چندگانه برای انتخاب توصیف کننده ها و مدل سازی مورد استفاده قرار گرفت. بر طبق محاسبات mlr، از مجموع 528 توصیف کننده، ده توصیف کننده به عنوان مناسب ترین انتخاب شدند. به منظور در نظر گرفتن روابط خطی و غیرخطی، شبکه های عصبی مصنوعی به کار گرفته شدند. ساختار بهینه شبکه عصبی پس انتشار 1-3-10 بود. نهایتاً مقایسه log ic50 محاسباتی و تجربی ترکیبات آمینوکاپرولاکتام برای سری های مرجع و پیش بینی شونده همبستگی خوب و توانایی بالای مدل ann را نشان می دهد. در قسمت دوم این تز، به منظور بررسی مهارکنندگی آنزیم کربنیک انیدراز توسط 1 و 3 و 4- تیادیازول 2- تیون،log ic50 آنها به روش ارتباط کمی ساختار- فعالیت مدل سازی شد. در مرحله اول یک سری داده شامل 25 مولکول انتخاب و به دو سری مرجع و پیش بینی شونده تقسیم گردید. در مرحله بعد 1501 توصیف کننده برای هر مولکول محاسبه شد. در آنالیز توصیف کننده ها 1025 توصیف کننده که دارای مقادیر ثابت یا همبستگی بالا بودند حذف شدند. در مرحله سوم از الگوریتم ژنتیک برای انتخاب توصیف کننده ها استفاده شد. براساس محاسبات ژنتیک الگوریتم، 3 توصیف کننده از 476 توصیف کننده انتخاب گردید. در مرحله چهارم برای مدل سازی میزان مهارکنندگی تیادیازول تیون ها از شبکه عصبی پس انتشار استفاده شد. ساختار بهینه شبکه عصبی پس انتشار 1-3-3 بود. در نهایت مقایسه log ic50 محاسباتی و تجربی ترکیبات تیادیازول تیون برای سری های مرجع و پیش بینی شونده همبستگی خوب و توانایی بالای مدل gnn را نشان می دهد.
منابع مشابه
مقایسه تأثیر وضعیت طاق باز و دمر بر وضعیت تنفسی نوزادان نارس مبتلا به سندرم دیسترس تنفسی حاد تحت درمان با پروتکل Insure
کچ ی هد پ ی ش مز ی هن ه و فد : ساسا د مردنس رد نامرد ي سفنت سرتس ي ظنت نادازون داح ي سکا لدابت م ي و نژ د ي سکا ي د هدوب نبرک تسا طسوت هک کبس اـه ي ناـمرد ي فلتخم ي هلمجزا لکتورپ INSURE ماجنا م ي دوش ا اذل . ي هعلاطم ن فدهاب اقم ي هس عضو ي ت اه ي ندب ي عضو رب رمد و زاب قاط ي سفنت ت ي هـب لاتـبم سراـن نادازون ردنس د م ي سفنت سرتس ي لکتورپ اب نامرد تحت داح INSURE ماجنا درگ ...
متن کاملمقایسه روش های سنجش فعالیت آنزیم تجزیه کننده ترکیبات ارگانوفسفره با استفاده از تکنیک های اسپکتروسکوپی، FPLC و ISE
سابقه و هدف: امروزه تولید آنزیم های با قابلیت تجزیه ترکیبات ارگانوفسفره مثل ارگانوفسفات هیدرولاز(OPH) شناسایی از اهمیت ویژهای برخوردار است. تولید این آنزیم ها با کارایی بالا یکی از اهداف مهندسی پروتئین است. بنابراین استفاده از تکنیک های کارا برای اندازه گیری فعالیت آنزیم مهم می باشد. مواد و روش ها: در این تحقیق از تکنیک سنجش یونی[1] جهت بررسی میزان تجزیه دی ایزوپروپیل فلوروفسفاتاز( DFP )و با تک...
متن کاملپیش بینی فعالیت آنتی HIV یکسری از مشتقات PETT به عنوان بازدارند ه های غیرنوکلئوزیدی آنزیم نسخه بردار معکوس با استفاده از مدلهای QSAR خطی و غیرخطی
به منظور پیش بینی فعالیت آنتی HIV یکسری از مشتقات فنتیل تیازولیل تیواوره (PEET)، مدلهای ارتباط کمی ساختار- فعالیت (QSAR) با استفاده از توصیفگرهای محاسبه شده، ساخته شد. روش رگرسیون مرحله ای جهت کاهش تعداد توصیفگرهای (متغییرها) محاسبه شده توسط دراگون به گار گرفته شد. متغییرهای انتخاب شده سپس به عنوان ورودی برای تولید مدلهای QSAR با استفاده از رگرسیون خطی خطی چندگانه(MLR) و شبکه عصبی مصنوعی(ANN)...
متن کاملسنتز ترکیبات جدید مشتق 3 ،4-دی آریل-4-تیازولین-2-تیون با اثر بالقوه مهار کننده COX-2
Background and purpose: Nonsteroidal anti-inflammatory drugs (NSAIDs) remain among the most widely prescribed drugs worldwide for the treatment of inflammation including pain-releasing, anti-pyretic and rheumatoid arthritis. The conventional NSAIDs exert their effects by inhibiting cyclooxygenase (COX) enzymes. Subsequent research and rational drug design validated the initial concept that a ...
متن کاملسنتز و شناسایی d-?-s-گالاکتوزیدها با مشتقات 1و3و4-اکسادی آزول 2(3h)-تیون
هیدرازیدها و مشتقات آن ها به عنوان بلوک های ساختمانی مناسب برای سنتز حلقه های هتروسیکل مختلف بکار رفته اند. بنابراین کربوهیدرازیدهای مختلف به عنوان ترکیبات دارویی شناخته شده اند. سنتز ترکیبات دارای حلقه 4،3،1-اُکسادی آزول به علت داشتن اثرات دارویی وسیع مانند ضد میکروبی، ضدالتهاب، مسکن، ضدتومور مورد توجه گسترده ای قرار گرفته اند. بسیاری از n-نوکلئوزیدهای حلقوی اثرات بیولوژیکی قوی دارند. s-نوکلئوز...
15 صفحه اولQSAR Analysis for Some 1, 2-Benzisothiazol-3-one Derivatives as Caspase-3 Inhibitors by Stepwise MLR Method
Caspase-3, one of the dominant effectors caspases, is activated in almost every model of apoptosis with various signaling pathways. Hence, inhibition of caspase-3 has become an attractive target in the treatment of neurodegenerative diseases. Caspase-3 inhibitory activities of some 1,2-benzisothiazol-3-one derivatives were modeled by quantitative structure–activity relationship (QSAR) using ste...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهید باهنر کرمان - دانشکده علوم پایه
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023