کاربرد نشانگرهای ریزماهواره در شناسایی کلکسیون های پایه و آنالیزهای فضایی و غیر فضایی انار (punica granatum) با استفاده نشانگرهای مولکولی

پایان نامه
چکیده

انار(punica granatum l.) گیاه بومی ایران است که به دلیل اهمیت اقتصادی، زینتی و دارویی کشت و کار می شود. اگرچه این گیاه یکی از مهمترین محصولات باغبانی کشورمان محسوب می شود، اما تا کنون بررسی دقیقی پیرامون توصیف ذخایر ژنتیکی و ژرم پلاسم آن انجام نشده است. ارزیابی تنوع ژنتیکی یکی از ارکان اصلی توصیف و بکارگیری ژرم پلاسم می باشد. در این مطالعه، تنوع ژنتیکی 738 نمونه انار با منشا جغرافیایی متفاوت از ایران با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره مورد ارزیابی قرار گرفت. با استفاده از 12 نشانگر چند شکل ریزماهواره (ssr)، تعداد 43 آلل با میانگین 59/3 آلل در هر مکان ژنی و متوسط اطلاعات چندشکلی 458/0 را شناسایی کردیم. علاوه بر ارزیابی پارامترهای تنوع ژنتیکی، آزمون اختصاص بایسین و تجزیه و تحلیل شبکه فیلوژنتیک بمنظور ارزیابی ساختار جمعیت مورد استفاده قرار گرفت. نتایج این تحقیق نشان می دهد که ارزیابی تنوع ژنتیکی و ساختار جمعیت در کلکسیون پایه انار می تواند برای استفاده کارامد از ژرم پلاسم و تعیین نقشه ارتباطی مفید باشد. علاوه براین، نشانگرهای ریزماهواره می توانند در گزینش ژنوتیپ های منحصر به فرد و ایجاد کلکسیون هسته موثر باشند. نتایج این تحقیق می تواند در درک بهتر ماهیت ژنتیکی افراد، تعیین روابط ژنتیکی، و منشا جغرافیایی ژرم پلاسم انار مفید بوده و در حفاظت و بکارگیری این ذخایر ژنتیکی نقش موثری ایفا کند. کلمات کلیدی: انار، نشانگر ریز ماهواره (ssr)، کلکسیون هسته، آنالیز فضایی

منابع مشابه

تنوع ژنتیکی ژرم‌پلاسم انار ترش ایران (Punica granatum L.) بر اساس نشانگرهای ریزماهواره

در این مطالعه تنوع ژنتیکی 238 ژنوتیپ انار ترش ایران موجود در کلکسیون انار یزد با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره بررسی شد. تجزیه خوشه‌بندی با روش‌های UPGMA و NJ٬ با استفاده از نرم‌افزار Mega4، و تجزیه ساختار با روش Bayesian با استفاده از نرم‌افزار Structure 2.2 و تجزیه به مختصات اصلی (PCoA) با نرم‌افزار Ntsys، به منظور بررسی روابط ژنتیکی و ساختار جمعیت ژنوتیپ‌ها انجام شد. آغازگرهای SSR-MP26 و S...

متن کامل

ارزیابی تنوع ژنتیکی ارقام انار ایران (Punica granatum L.) با استفاده از نشانگرهای RAPD و ISSR

با توجه به تنوع بالای مورفولوژیکی در ارقام انار ایران، تنوع ژنتیکی 24 رقم انار با استفاده از نشانگرهای RAPD و ISSR مورد بررسی قرار گرفت. آغازگرهای RAPD در مجموع 131 قطعه DNA تکثیر نمودند که 29 قطعه آنها (14/22 درصد) چندشکل بودند. آغازگرهای ISSR نیز از مجموع 173 قطعه تکثیر شده، 29 (37 درصد) چند‌شکلی حاصل نمودند. میانگین محتوای اطلاعات چندشکل (PIC) برای آغازگرهای RAPD و ISSR به ترتیب 128/0 و 163/...

متن کامل

کاربرد نشانگرهای ریزماهواره و برخی از صفات مورفولوژیک در شناسایی کلکسیون های هسته .prunus dulcis mill

کلکسیون هسته مجموعه ای از نمونه های گزینش شده است که معرف تنوع ژنتیکی موجود در کلکسیون پایه می باشد. این استراتژی به منظور به حداقل رساندن هزینه حفاظت از ذخائر ژنتیکی با حفظ حداکثری تنوع ژنتیکی معرفی شده است. در این روش امکان ارزیابی سریع ژرم پلاسم و دسترسی آسانتر به کلکسیون پایه فراهم می شود. در این تحقیق، به منظور ارزیابی تنوع ژنتیکی و تشکیل کلکسیون هسته، 139 نمونه prunus dulcismill. با منشأ ...

متن کامل

تنوع ژنتیکی ژرم پلاسم انار ترش ایران (punica granatum l.) بر اساس نشانگرهای ریزماهواره

در این مطالعه تنوع ژنتیکی 238 ژنوتیپ انار ترش ایران موجود در کلکسیون انار یزد با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره بررسی شد. تجزیه خوشه بندی با روش های upgma و nj٬ با استفاده از نرم افزار mega4، و تجزیه ساختار با روش bayesian با استفاده از نرم افزار structure 2.2 و تجزیه به مختصات اصلی (pcoa) با نرم افزار ntsys، به منظور بررسی روابط ژنتیکی و ساختار جمعیت ژنوتیپ ها انجام شد. آغازگرهای ssr-mp26 و s...

متن کامل

ارزیابی تنوع ژنتیکی ارقام انار ایران (punica granatum l.) با استفاده از نشانگرهای rapd و issr

با توجه به تنوع بالای مورفولوژیکی در ارقام انار ایران، تنوع ژنتیکی 24 رقم انار با استفاده از نشانگرهای rapd و issr مورد بررسی قرار گرفت. آغازگرهای rapd در مجموع 131 قطعه dna تکثیر نمودند که 29 قطعه آنها (14/22 درصد) چندشکل بودند. آغازگرهای issr نیز از مجموع 173 قطعه تکثیر شده، 29 (37 درصد) چند شکلی حاصل نمودند. میانگین محتوای اطلاعات چندشکل (pic) برای آغازگرهای rapd و issr به ترتیب 128/0 و 163/...

متن کامل

کاربرد نشانگرهای ریزماهواره و برخی از صفات مورفولوژیک در شناسایی کلکسیون های پایه بادام

با توجه به ویژگی های خاص موجود در محصول بادام از جمله خاصیت انباری بسیار بالا، سهولت نگهداری و حمل و نقل، ضایعات کم و توان بالای صادراتی به صورت مغز خام و یا همراه با پوست، این محصول نسبت به سایر خشکبار ها از ارزش اقتصادی بالاتری برخوردار است .بنابراین یکی از نخستین مراحل در برنامه های اصلاحی بررسی ژرم پلاسم موجود از نظر صفات مختلف مورفو-پومولوژیکی و مولکولی و نهایتاً انتخاب بهترین ارقام و ژنوتی...

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده کشاورزی

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023