امکان سنجی تشخیص دانه های آلوده به قارچ fusarium graminearum با پردازش تصویر

پایان نامه
چکیده

چکیده: در میان گیاهان زراعی، گندم با دارا بودن مواد غذایی با ارزش مانند انواع پروتئین ها، ویتامین ها و مواد معدنی، حدود 25% کالری غذایی مردم جهان را تأمین می نماید. به همین جهت، تأمین سلامت آن از اهمیت بالایی برخوردار است. بیماری f.graminearum زیرمجموعه ای از بلایت فوزاریومی سنبله گندم یا fhb می باشد که عموماً تحت عنوان اسکب نامیده می شود. f.graminearum از بیماری های مخرب در مناطق گرم و مرطوب کشت گندم در جهان و ایران است. این بیماری نه تنها باعث از دست رفتن کیفیت و راندمان محصول می گردد، بلکه با ایجاد زهرابه های قارچی، عوارض خطرناکی را برای انسان و حیوانات به دنبال دارد. تشخیص این بیماری به کار آزمایشگاهی و صرف زمان و هزینه بالا نیاز دارد. امروزه، استفاده از پردازش تصویر و سیستم های بینایی ماشین در تشخیص آفات و بیماری های گیاهی، باعث غلبه بر مشکلات در روش های قبلی و بهبود آن ها شده است. پردازش تصاویر از روش های غیرمخرب، دقیق و سریع برای محاسبه و تشخیص و مقایسه ی خصوصیات با همدیگر است. در این پایان نامه، ابتدا دانه های گندم سالم و آلوده به قارچ فوزاریوم تهیه شده و سپس تصاویر دیجیتالی هر گروه به صورت توده های درهم و تصادفی با استفاده از دوربین و محفظه ی مخصوص نورپردازی تهیه شدند. سپس با استفاده از تکنیک های پردازش تصویر، در مجموع 40 ویژگی رنگ، شکل و بافت از تصویر هر دانه به دست آمد. تمامی پردازش ها با نرم افزار matlab انجام شد. جداسازی و تشخیص دانه های سالم و آلوده با استفاده از 40 ویژگی به دست آمده از تصاویر دانه ها، با تحلیل های تشخیصی (da)، k-means، شبکه ی عصبی چند لایه (mlp) و ماشین بردار پشتیبان (svm) بررسی شد. طبقه بندی دانه ها با هرکدام از روش های فوق به صورت جداگانه برای ویژگی های رنگی، شکلی، بافتی و همه ی ویژگی ها انجام پذیرفت. در طبقه بندی بر اساس همه ی ویژگی ها، با استفاده از تحلیل مولفه های اصلی (pca)، 26 مولفه از 40 مولفه انتخاب شد. دقت صحیح جداسازی دانه ها براساس 26 مولفه ی اصلی با تحلیل های تشخیصی، k-means، شبکه های عصبی سه لایه و ماشین بردار پشتیبان غیرخطی به ترتیب 8/99%، 99/85%، 100% و 100% محاسبه شد. کلید واژه ها: قارچ فوزاریوم، پردازش تصویر، طبقه بندی، تحلیل تشخیصی، تحلیل k-means، شبکه ی عصبی چندلایه، ماشین بردار پشتیبان

منابع مشابه

Functional analysis of the Fusarium graminearum phosphatome.

Phosphatases are known to play important roles in the regulation of various cellular processes in eukaryotes. However, systematic characterization of the phosphatome has not been reported in phytopathogenic fungi. The wheat scab fungus Fusarium graminearum contains 82 putative phosphatases. The biological functions of each phosphatase were investigated in this study. Although 11 phosphatase gen...

متن کامل

eFG: an electronic resource for Fusarium graminearum

Fusarium graminearum is a plant pathogen, which causes crop diseases and further leads to huge economic damage worldwide in past decades. Recently, the accumulation of different types of molecular data provides insights into the pathogenic mechanism of F. graminearum, and might help develop efficient strategies to combat this destructive fungus. Unfortunately, most available molecular data rela...

متن کامل

Morphogenesis in germinating Fusarium graminearum macroconidia.

Fusarium graminearum (teleomorph Gibberella zeae) is a significant pathogen of wheat and corn. F. graminearum forms multicellular macroconidia that play an important role in dissemination of the disease. The spatial pattern of morphogenesis in germinating macroconidia is described. Germ tubes preferentially emerge from the apical cells in a bipolar pattern that appears to be common to filamento...

متن کامل

Double-stranded RNA mycovirus from Fusarium graminearum.

Double-stranded RNA (dsRNA) viruses in some fungi are associated with hypovirulence and have been used or proposed as biological control agents. We isolated 7.5-kb dsRNAs from 13 of 286 field strains of Fusarium graminearum isolated from maize in Korea. One of these strains, DK21, was examined in more detail. This strain had pronounced morphological changes, including reduction in mycelial grow...

متن کامل

Protein Subcellular Localization Prediction for Fusarium graminearum∗

The fungal pathogen Fusarium graminearum (telomorph Gibberella zeae) is the causal agent of several destructive crop diseases. Investigating subcellular localizations of F. graminearum proteins can provide insight into pathogenic mechanisms underlying F. graminearum-host interactions. In this paper, we design a novel balanced ensemble classifier based on support vector machines (SVMs) to predic...

متن کامل

FPPI: Fusarium graminearum protein-protein interaction database.

The fungal pathogen Fusarium graminearum (telomorph Gibberella zeae) is the causal agent of several destructive crop diseases. Identifying interactions among F. graminearum proteins and understanding their functions can provide insights into pathogenic mechanisms underlying F. graminearum-host interactions. F. graminearum protein-protein interaction (FPPI) database provides comprehensive inform...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه محقق اردبیلی - دانشکده کشاورزی

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023