ارزیابی قابلیت کاربرد دمای ذوب محصولات pcr ژن های مورد استفاده در بررسی های فیلوژنتیکی به منظور شناسایی تاکسون های مارها

پایان نامه
چکیده

بررسی توالیهای قطعاتی از dna علیرغم پرهزینه بودن در مطالعات فیلوژنتیکی مولکولی کاربرد وسیعی پیدا کرده است. اغلب برای شناسایی گونه های نزدیک به هم که از لحاظ مورفولوژی موارد ابهام وجود دارد بررسی توالیهای dna و تبارشناخت آن تعیین کننده است. یک روش آسان و ارزان احتمالاً بررسی ویژگیهای بیوشیمی فیزیکی قطعه تکثیر شده dna در گونه های مورد بحث و مقایسه آن با یک الگوی از قبل شناخته شده و نه الزاماً تعیین توالی آن می باشد. برای محک زدن این ایده بر تفاوت در دمای ذوب tm محصولات pcr در ژن های پرکاربرد در مطالعات فیلوژنتیکی 16s) و (cyt b تمرکز نمودیم. این کمیت که عمدتاً تحت تأثیر محتوای نوکلئوتیدی توالی می باشد پس از تکثیر قطعات ژنهای مورد اشاره با استفاده از جفت پرایمرهای مشخص با استفاده از دستگاه real-time pcr اندازه گیری شد. الگوی پراکندگی دمایی برای گونه های مختلف مارهای ایران تهیه شد و برای محک زدن توانایی و دقت آن در شناسایی گونه ها از نمونه های مجهول استفاده گردید. نتایج اولیه از این دو ژن امیدوارکننده است اگرچه برای ارتقای حساسیت آن نیازمند مراحل تکمیلی می باشد. توسعه این روش می تواند در یک ارزیابی سریع تعیین گونه کاربرد داشته باشد.

منابع مشابه

شناسایی ژن های انتروتوکسین استافیلوکوکوس اورئوس با استفاده Multiplex PCR

سابقه و هدف: استافیلوکوکوس اورئوس یکی از مهمترین عوامل مسمومیت غذایی در جهان می باشد. در تحقیقات مختلف مشخص گردیده است که 18-15 درصد سویه های استافیلوکوکوس که از منابع مختلف جدا می شود قادر به تولید انتروتوکسین می باشند که فاکتور اصلی مسمومیت می باشند. هدف از تحقیق حاضر شناسایی ژنهای انتروتوکسین نظیر: (femA،see ،sed ،sec ،seg ،seb، sea) در استافیلوکوکوس اورئوس که با استفاده از روش PCR چندگانه ا...

متن کامل

ارتباط بین گروه های فیلوژنتیکی با ژن های کد کننده فاکتور های حدت در ایزوله های اشریشیاکلای خارج روده ای به روش Multiplex-PCR

خلاصه سابقه و هدف: باکتری اشریشیاکلای خارج روده ای مهمترین عامل عفونت های ادراری-تناسلی در انسان است. چندین فاکتور حدت مثل ژن های کد کننده پروتئین های سیتوتوکسین، ادهسین، رسپتورهای سیدروفور و پروتئاز خارج غشائی در اشریشیاکلای های خارج روده ای انسان شناسایی شده است. این مطالعه به منظور بررسی میزان توزیع ژن های کد کننده فاکتور های حدت و ارتباط آن با گروه های فیلوژنتیکی در ایزوله های اشریشیاکل...

متن کامل

استفاده از مولتی پلکس PCR در شناسایی حذف های شایع ژن آلفاگلوبین در حاملین آلفا تالاسمی

Background and Aim:-thalassemia is the most common inherited disorder of hemoglobin (Hb) synthesis in the world. Alpha thalassemia most frequently results from the loss of one (- ) or both (- -) of the duplicated  genes () on chromosome 16. Carriers of deletional forms of -thalassemia (-/- /-, or --/) are clinically normal but have a mild hypochromic, microcytic anemia. C...

متن کامل

شناسایی روابط فیلوژنتیکی گندم های زراعی و اجداد آن بر اساس توالی یابی ژن (HKT)

شوری یکی از مشکلات مهم در اراضی کشاورزی دنیا می‌باشد، به طوری که سالانه میلیون‌ها تن نمک از طریق آبیاری وارد خاک‌های زراعی می‌شود. گندم اولین و مهمترین گیاه زراعی دنیا است که غذای اصلی بیش از یک سوم مردم جهان را تأمین می‌کند. روش های نوین ژنتیکی همچون توالی‌یابی امکان ارزیابی دقیق و سریع مواد ژنتیکی در سطح DNA و RNA را فراهم نموده است. لذا به منظور شناسایی تنوع آللی ژن HKT از گونه‌های زراعی و و...

متن کامل

شناسایی و غربالگری ژن های مستعد در بروز رفتارهای مجرمانه به منظور پیشگیری از جرم

ﭘﺪﯾﺪه ﺟﺮم و بروز رفتارهای مجرمانه اﻣﺮوزه ﺑﻪ ﯾﮑﯽ از ﻣﺸﮑﻼت اﺳﺎﺳﯽ ﺟﻮاﻣﻊ ﺑﺸﺮی ﺗﺒﺪﯾﻞ ﺷﺪه اﺳت. محققین علوم روان شناسی و روان پزشکی، جرم را نتیجه عدم تعادل شخصیت مجرم که از واکنش متقابل عوامل روانی و بیولوژیکی ناشی می‌شود، تلقی می‌نمایند و این عدم تعادل روانی باعث اختلالات رفتاری افراد شده و آنها را به سوی ارتکاب اعمال خلاف قانون سوق می‌دهد. شناسایی وغربالگری ژن‌های مستعد، علم...

متن کامل

تشخیص ژن های Stx با استفاده از Multiplex PCR در نمونه های بالینی

زمینه و اهداف: تاکنون روش های مختلف تشخیصی از جمله کشت سلولی، الایزا، RFLP برای شناسایی شیگاتوکسین ها بکار رفته ولی باتوجه به داشتن هزینه زیاد، صرف زمان زیاد وداشتن حساسیت پائین کمتر مورد توجه واقع شده اند دراین تحقیق برای شناسایی ژن stx و از روش Multiplex PCR استفاده شد. مواد و روش کار: تاکنون روش های مختلف تشخیصی از جمله کشت سلولی، الایزا، RFLP برای شناسایی شیگاتوکسین ها بکار رفته ولی باتوجه...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

دانشگاه تربیت معلم - سبزوار - دانشکده علوم پایه

کلمات کلیدی

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023