نام پژوهشگر: فاطمه دادرس مقدم

بررسی برهم کنش های بین مولکولی و پیوند هیدروژنی در جفت باز آدنین -تیمین
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه بیرجند 1387
  فاطمه دادرس مقدم   علی نیک اختر

چکیده ندارد.

بررسی بر هم کنش های بین مولکولی و پیوند هیدروژنی در جفت باز آدنین – تیمین
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه بیرجند - دانشکده علوم انسانی 1387
  فاطمه دادرس مقدم   علی نیک اختر

پیوندهای هیدروژنی بین مولکولی در جفت بازهای اسید نوکلئیک یک نقش کلیدی در اختصاصی کردن ساختار آن ها بازی می کند. ساختار جفت باز a – t و ساختارهای مختلف پیش بینی شده مربوط به این جفت باز با استفاده از محاسبات ab- initio در سطح محاسباتی g** 31-6 hf/و در یک سری از سطوح نظریه تـابعی چگالی ، b3lyp/6-31g** و b3lyp/6-311++g**بهینه شد. پـارامترهای ساختـمانـی و انرژی های بهینه شده به دست آمد و بر روی پایداری ساختارهای مختلف جفت باز بحث گردید.پایدارترین ساختار، در میان ساختارهای مختلف، ساختار (i)at بود. علاوه بر این قدرت پیوند هیدروژنی n – h …n و o – h…n در ساختارهای مختلف جفت باز a – t با یکدیگر مقایسه شد. از طرف دیگر در مورد تأثیر مجموعه پایه بر روی انرژی بر هم کنش جفت باز a – t با استفاده از سطوح محاسباتی مختلف بحث گردید. نتایج محاسبات نشان داد که سطح محاسباتیb3lyp/6-31g** بیشترین برهم کنش با انرژی حدود 384/17- kcal/mol را دارا می باشد. توابع پتانسیل جفت باز a – t بر اثر انتقال یک پروتون و همچنین انتقال همزمان دو پروتون ، که شامل انتقال پروتون نیتروژن گروه آمین مولکول آدنین به نیتروژن گروه کربونیل مولکول تیمین و همچنین انتقال پروتون از نیتروژن تیمین به نیتروژن آدنین است، در سطح محاسباتی g** 31-6/b3lyp به دست آمد و نمودارهای surface و contoure مربوط به انتقالات پروتون ذکر شده رسم گردید