نام پژوهشگر: جهان بخش قاسمی

مدلسازی کامپیوتری گروهی از داروهای بیماری قلبی-عروقی و برخی بازدارندههای diaminopimelate aminotransferase به عنوان علف کش و آنتی بیوتیک
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه صنعتی خواجه نصیرالدین طوسی - دانشکده علوم 1389
  مهناز آیتی   جهان بخش قاسمی

چکیده مطالعهqsar سه بعدی بر روی 2-آریل بنزوکسازول به عنوان بازدارنده های cetp انجام گرفت و روش های comfa، comfa rf وcomsia برای تعیین فاکتورهایی که در بروز فعالیت در این ترکیبات ضرورت دارد مورد استفاده قرار گرفت. در این مطالعه مولکول ها با روش های استاندارد در نرم افزار sybyl بهینه سازی انرژی بر روی آنها انجام شد و روشdistil به عنوان روش نهایی برای تراز کردن مولکول ها در نظر گرفته شد. بهترین جهت-گیری مولکول ها بوسیله استراتژی aos که تمام جهت گیری های مولکول را مورد بررسی قرار می دهد انتخاب شد. بعد از تعیین بهترین جهت-گیری میدان های برهمکنش مولکولی محاسبه و بعد از حذف نویز مدلسازی به روش pls با تعداد بهینه متغیرها صورت گرفت. روش-های آماری مختلف برای تعیین اعتبارسنجی استفاده شد. در بررسی قدرت پیشگویی مدل به روش سری تست برای مدل های comfa rf و comsia به ترتیب ضریب همبستگی های 886/0 و 754/0 بدست آمد. حساسیت مدل به همبستگی شانسی نیز در این مطالعه بررسی شد. بر اساس اطلاعات بدست آمده مدل های comfa rf وcomsia هر دو خصوصیات کلیدی را برای طراحی بازدارنده های جدید ارائه می-کنند. همچنین یک سری بازدارنده ها که به عنوان حشره کش و ضد باکتری عمل می کنند تحت عنوان بازدارنده های dap-at برای مطالعه qsar سه بعدی با متغیرهایgrind مورد استفاده قرار گرفتند. این مجموعه تحت بررسی بخش ساختاری مشترکی برای ترازکردن نداشتند بنابراین از روش های مستقل از ترازکردن برای تولید توصیف گرها استفاده شد و توصیف گرهای grind تولید گردید. بعد از تولید میدان ها، استخراج و کدگذاری آنها، از روش pls برای مدلسازی استفاده شد. بعد از بررسی های آماری مشخص شد که توصیف گرهای grind موثر تعیین شده در بررسی سایت فعال پروتئین بسیار مفید عمل می کنند و به طور کیفی منجر به یک مدل فارماکوفوری می گردند.

مطالعه ساختار- فعالیت بعضی از مولکول های ضد افسردگی واضطراب به کمک روشهای آنالیز چند متغیره و فارماکوفور فعالیت محور
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه صنعتی خواجه نصیرالدین طوسی - دانشکده علوم 1389
  حدیث کاویانی   جهان بخش قاسمی

در رساله حاضر سعی بر توسعه روش های جدید مطالعات ارتباط کمی ساختار- فعالیت سه بعدی شده است. لذا در بخش اول مقدمه ای در مورد اساس روش های ساختار- فعالیت دوبعدی بیان خواهد شد و سپس شرح مختصری در مورد روش های ساختار- فعالیت سه بعدی داده و در نهایت به بیان کاربرد ی از دو روش مدل سازی ارتباط کمی ساختار- فعالیت دو بعدی و سه بعدی یعنی comfa و نیز comsia بر روی تعدادی از مشتقات 1-(3-پیریدیل کربامویل) ایندولین می پردازیم. ازآنجایی که این ترکیبات می توانند با اثر بر روی گیرنده ی 5-ht2c به عنوان عوامل ضد افسردگی، تشویش، اضطراب و بی قراری عمل کنند، بنابراین بررسی خواص ساختاری آنها برای اصلاح داروها ی موجود و یا طراحی دارو های جدید بسیار مفید خواهد بود. در بخش مدل سازی qsarدو بعدی به دلیل اهمیت انتخاب متغیر هایی که بیشترین اهمیت را برای مدل-سازی رگرسیونی دارند، هدف اصلی توسعه ی یک متدولوژی انتخاب متغیر و حذف متغیر های نامربوط و یا کمتر مربوط برای روش رگرسیون خطی کمترین مربعات جزیی (pls) است. برای این کار از ترکیبی از روش های انتخاب متغیر ژنتیک الگوریتم و اهمیت متغیر در تصویر سازی (vip) استفاده شده است. با این روش علاوه بر کاهش تعداد متغیر ها به طور موثر، توصیف کننده هایی در مدل نهایی وارد شدند که قابلیت تفسیر پذیری خوبی دارند. در بخش qsar سه بعدی نیز در ابتدا با استفاده از نرم افزار sybyl ، پس از همتراز کردن (alignment)، توصیف گر های میدانی برای این دسته از مولکول ها تولید شده است و سپس با استفاده از روش pls مدل ساختار- فعالیت سه بعدی توسعه یافته و قدرت پیش گویی آن با استفاده از مجموعه ی خارجی آزمون و همچنین روش در هم ریختگی (scrambling) مورد ارزیابی قرار گرفته است. در انتها با استفاده از خروجی گرافیکی (contour map) بدست آمده از مدل رگرسیونی، به بررسی و تفسیر نمودار ها پرداخته و تغییرات لازم جهت اصلاح ساختار این دسته از ترکیبات به منظور افزایش فعالیت دارویی آنها بیان شده است. کلمات کلیدی: روش ساختار- فعالیت دو بعدی، ژنتیک الگوریتم (genetic algorithm)، اهمیت متغیر در طراحی (vip)، روش ساختار- فعالیت سه بعدی، comfa، comsia، آنالیز کمترین مربعات جزیی، 1-(3-پیریدیل کربامویل) ایندولین، گیرنده ی 5-ht2c، sybyl، داروهای ضد اضطراب و افسردگی

بررسی رفتار الکتروشیمیایی(0/1) ag در محیط مذاب ca(no3)2-nh4no3 و بررسی رفتار الکتروشیمیایی و اندازه گیری کمی داروی آتورواستاتین در نمونه دارویی
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه صنعتی خواجه نصیرالدین طوسی 1390
  امید فضل الله زاده   احمد روح الهی

رفتار الکتروشیمیایی و مکانیسم ترسیب الکتریکی نقره در محیط مذاب مورد بررسی قرار گرفت که نشان داد نقره دارای رفتار شبه برگشت یذیر است و تحت کنترا انتشار قرار دارد. در ادامه با استفاده از الکترود hppg مقادیر کم داروی آتورواستاتین در محیط آبی اندازهگیری شد و مکانیسم کاهش آن مورد بررسی قرار گرفت و به حد تشخیص 20.6nm رسیدیم.

توسعه روشهای تجزیه شیمیایی بر مبنای طیف سنجی جذب اتمی به منظور بررسی تاثیر غلظت فلزات سنگین در بیماری ام اس ms))
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه صنعتی خواجه نصیرالدین طوسی - دانشکده علوم 1390
  حمید شیرخانلو   احمد روح الهی

چکیده یکی از فرضیه های ارائه شده در بروز بیماری مولتیپل اسکلروزیس (ms) تاثیر برخی از فلزات سنگین می باشد که نقش آنها در ایجاد بیماری ms به خوبی روشن نیست. در این مطالعه، با توسعه روش های جدید آماده سازی نمونه، غلظت10یون فلزی (جیوه، آرسنیک، کروم، کادمیوم، نیکل، سرب، آلومینیم، مس، روی و وانادیم) در نمونه های زیست محیطی و خون به وسیله طیف سنجی جذب اتمی اندازه گیری شد. در بررسی تاثیر غلظت فلزات سنگین در بروز بیماری ms، فاکتورهای مختلفی مانند جنسیت، سن، آلاینده های زیست محیطی و آزمایشات کلینیکی در نظر گرفته شدند که در این راستا تعداد 100 نمونه خون از بیماران مبتلا به ms، 100 نمونه خون از افراد سالم و 100 نمونه زیست محیطی در استان اصفهان تهیه شد. بررسی نتایج اندازه گیری غلظت یون های فلزی در نمونه های خون با استفاده از روشهای آماری نشان داد که از میان 10 کاتیون اندازه گیری شده، غلظت 9 کاتیون در نمونه های خون افراد سالم و افراد مبتلا به ms اختلاف معنی داری ندارند ولی مقایسه غلظت های مس در نمونه های خون افراد سالم و افراد مبتلا اختلاف معنی داری را نشان داد که حاکی از کمبود مس خون در کمتر از 30% افراد ms بود. همچنین کاهش غلظت مس در مردان مبتلا به ms بیشتر از زنان مبتلا به ms بوده و متعلق به سنین زیر40 سال است. در بررسی غلظت فلزات سنگین در نمونه های زیست محیطی مانند، آب کشاورزی، رودخانه زاینده رود، آب آشامیدنی و محصولات کشاورزی غلظتی بالاتر از حدود مجاز استاندارد مشاهده نشد و بنابراین احتمالا، فلزات سنگین به عنوان آلاینده های زیست محیطی در بروز بیماری ms مطرح نمی باشند. انحراف معیار نتایج در سه بار اندازه گیری فلزات ذکر شده در نمونه های خون کمتر از 7% و در نمونه های زیست محیطی کمتر از 6% بود.

فعال سازی پیوند کربن-هیدروژن در آلکین های انتهایی
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه صنعتی خواجه نصیرالدین طوسی - دانشکده علوم 1392
  مژگان نویدی   برهمن موثق

کار تحقیقاتی ارائه شده در این رساله مشتمل بر شش فصل می باشد: در فصل اول نحوه تهیه، خالص سازی و تعیین ساختار کاتالیست کمپلکس پالادیم (ii)- باز شیف بر روی بستر نانولوله های کربنی چند دیواره (pd-salen@mwcnts) مورد استفاده در این کار تحقیقاتی بررسی شده است.در فصل دوم ?، ?- استیلنیک کتون ها (اینون ها) از طریق واکنش آلکین های انتهایی و بنزوئیل کلرید ها در دمای محیط و شرایط بدون حلال و با استفاده از کمپلکس پالادیم (ii)- باز شیف بر روی بستر نانولوله های کربنی چند دیواره به عنوان کاتالیزور و در مجاورت باز et3n سنتز شده اند.در فصل سوم واکنش سونوگاشیرا با استفاده از واکنش آلکین های انتهایی و آریل یدید ها توسط کمپلکس پالادیم (ii)- باز شیف بر روی بستر نانولوله های کربنی چند دیواره به عنوان کاتالیزور در مجاورت باز et3nو دمای °c90 در حلال آب و همچنین در شرایط بدون حلال انجام گرفته است.در فصل چهارم واکنش آلکین های انتهایی و بنزوئیل کلرید ها در دمای محیط و شرایط بدون حلال و با استفاده از کاتالیزور پالادیم کلرید-کریپتاند22 (pdcl2-c22) و در مجاورت باز et3nانجام شده است.در فصل پنجم 3،2،1-تری آزول های 4،1-استخلافی که در آن ها یکی از استخلاف ها دارای اتم گوگرد می باشد، با استفاده از تیول ها، پروپارژیل برمید و آزید ها و همچنین کاتالیزور cui و باز et3n در حلال آب و در شرایط هوایی سنتز شده اند.در فصل آخر سنتز آلکینیل سلنید ها با استفاده از آلکین های انتهایی و دی سلنید ها در حلال dmf و در مجاورت باز t-buo-k+ مورد بررسی قرار گرفته است.

طراحی و سنتز کاتالیست های نانو و کاربرد آن در روش های نوین و سبز سنتز مشتقات پیریمیدین و ترکیبات هتروسیکل حاوی حلقه پیریمیدین
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه صنعتی خواجه نصیرالدین طوسی - دانشکده علوم پایه 1392
  معصومه نوجوان   شهناز رستمی زاده

این کار پژوهشی شامل 3 فصل می باشد: در فصل اول، سنتز نانو کاتالیزورهای مغناطیسی (fe2o3-mcm-41) عامل دار شده توسط مایعات یونی و شناسایی کامل آن ها به روش های موجود طیفی و تجزیه ای ارائه شده است. در فصل دوم، سنتز مشتقات پیریمیدینی به شرح زیر ارائه شده است: الف) سنتز سه جزئی مشتقات 4-آمینو-2و6-دی آریل-پیریمیدین-5-کربونیتریل با استفاده از مالونونیتریل، آلدهیدآروماتیک و بنزآمیدینیوم هیدروکلرید در حالت بدون حلال با استفاده از کاتالیزور بازی استات سدیم نشانده شده روی آلومینای بازی و همچنین کاتالیزور نانو اکسید آهن (iii) گزارش شده است. ب) مشتقات 2-متیل تیو پیریمیدین-5-کربونیتریل از واکنش سه جزیی بین مالونونیتریل، آلدهیدآروماتیک و s-متیل ایزوتیواورونیوم یدید در حالت بدون حلال و با استفاده از کاتالیزور نانوساختار mcm-41-nprnh2 در دمایc° 80در شرایط بدون حلال سنتز شده است. ج) روش جدید سنتز مشتقات n2- آریل آمینو پیریمیدین–5–کربونیتریل از طریق واکنش جایگزینی استخلاف متیل تیو در مشتقات 2-متیل تیوپیریمیدین -5-کربونیتریل، با آریل آمین ها ارائه شده است. در فصل سوم، سنتز هتروسیکل های دو حلقه ای حاوی هسته پیریمیدینی به شرح زیر ارائه شده است: الف) روش مستقیم سنتز مشتقات4-آریل-6-فنیل-h1-پیرازولو[3، 4-d]پیریمیدین-3-آمین از مشتقات 4-آمینو-6-آریل-2-فنیل پیریمیدین-5-کربونیتریل ارائه شده است. ب) سنتز مشتقات 4-آریل-6-فنیل-h1-پیرازولو[3، 4-d]پیریمیدین-3-آمین به روش تک مرحله ای با استفاده از مشتقات بنزآلدهید، مالونونیتریل، بنزآمیدینیوم هیدروکلرید و هیدرازین هیدرات انجام شده است. ج) مشتقات پیریمیدو[4، 5-d]پیریمیدین، با استفاده از نانو کاتالیزور مغناطیسی عامل دار شده توسط مایع یونی اسیدی 3-سولفوبوتیل-1-(3-پروپیل تری متوکسی سیلان) ایمیدازولیوم هیدروژن سولفات (fe2o3-mcm-41-ail)، سنتز شدند. د) نانوکاتالیزورمغناطیسی عامل دار شده با مایع یونی l-پرولینیوم نیترات به طور موفقیت آمیز در سنتز مشتقات 4(h3) کوئینازولینون، با استفاده از مواد اولیه ایزاتوئیک انیدرید، آمونیم استات یا آمین نوع اول و مشتقات بنز آلدهید یا بنزیل هالید، در دمای c? 100و شرایط بدون حلال به کار برده شدند.