مدلسازی کامپیوتری گروهی از داروهای بیماری قلبی-عروقی و برخی بازدارندههای diaminopimelate aminotransferase به عنوان علف کش و آنتی بیوتیک

چکیده مطالعهqsar سه بعدی بر روی 2-آریل بنزوکسازول به عنوان بازدارنده های cetp انجام گرفت و روش های comfa، comfa rf وcomsia برای تعیین فاکتورهایی که در بروز فعالیت در این ترکیبات ضرورت دارد مورد استفاده قرار گرفت. در این مطالعه مولکول ها با روش های استاندارد در نرم افزار sybyl بهینه سازی انرژی بر روی آنها انجام شد و روشdistil به عنوان روش نهایی برای تراز کردن مولکول ها در نظر گرفته شد. بهترین جهت-گیری مولکول ها بوسیله استراتژی aos که تمام جهت گیری های مولکول را مورد بررسی قرار می دهد انتخاب شد. بعد از تعیین بهترین جهت-گیری میدان های برهمکنش مولکولی محاسبه و بعد از حذف نویز مدلسازی به روش pls با تعداد بهینه متغیرها صورت گرفت. روش-های آماری مختلف برای تعیین اعتبارسنجی استفاده شد. در بررسی قدرت پیشگویی مدل به روش سری تست برای مدل های comfa rf و comsia به ترتیب ضریب همبستگی های 886/0 و 754/0 بدست آمد. حساسیت مدل به همبستگی شانسی نیز در این مطالعه بررسی شد. بر اساس اطلاعات بدست آمده مدل های comfa rf وcomsia هر دو خصوصیات کلیدی را برای طراحی بازدارنده های جدید ارائه می-کنند. همچنین یک سری بازدارنده ها که به عنوان حشره کش و ضد باکتری عمل می کنند تحت عنوان بازدارنده های dap-at برای مطالعه qsar سه بعدی با متغیرهایgrind مورد استفاده قرار گرفتند. این مجموعه تحت بررسی بخش ساختاری مشترکی برای ترازکردن نداشتند بنابراین از روش های مستقل از ترازکردن برای تولید توصیف گرها استفاده شد و توصیف گرهای grind تولید گردید. بعد از تولید میدان ها، استخراج و کدگذاری آنها، از روش pls برای مدلسازی استفاده شد. بعد از بررسی های آماری مشخص شد که توصیف گرهای grind موثر تعیین شده در بررسی سایت فعال پروتئین بسیار مفید عمل می کنند و به طور کیفی منجر به یک مدل فارماکوفوری می گردند.