نام پژوهشگر: دلارا محمدآقایی

مطالعات ترمودینامیکی آلبومین سرم انسانی و سینتیکی آنزیم آلفاگلوکوسیداز در حضور ترکیبات سنتزی
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه صنعتی شیراز - دانشکده علوم پایه 1390
  فاطمه مختاری   رضا یوسفی

بیماری دیابت یک اختلال سوخت وسازی است که احتمال بروز آن در سرتاسر دنیا روز به روز در حال افزایش است. یکی از راههای کاهش جذب قند پس از مصرف غذا و درمان این بیماری مهار آنزیم آلفاگلوکوسیداز است که آزاد شدن آلفا-دی- گلوکوپیرانوزید را از انتهای غیر کاهنده مواد کربوهیدراتی مختلف کاتالیز می کند. از این رو در بخش اول این پژوهش فعالیت مهارکنندگی پنج مشتق پلی هیدروکسی حلقه های هتروسیکل به هم چسبیده پیریمیدین، که دارای استخلاف آروماتیک و آلیفاتیک بودند روی این آنزیم پرداخته شد. نتایج این پژوهش نشان داد که از بین این ترکیبات، ترکیبات دارای استخلاف آروماتیک دارای فعالیت مهارکنندگی می باشد وترکیب حاوی استخلاف سولفونیل دارای فعالیت مهارکنندگی بیشتری است. همچنین سازوکار مهارکنندگی آن به صورت غیر رقابتی تعیین شد. پارامتر های ترمودینامیکی برهمکنش این ترکیب با آنزیم آلفا-گلوکوسیداز به روش فلورسانس تعیین شد. نتایج نشان داد که برهمکنش های آبگریز نقش مهمی در این اتصال دارند در حالیکه پیوند هیدروژنی دارای تا ثیرکمتری در این برهمکنش می باشد. ترکیبات آلی- فلزی (ارگانومتالیک) گروه مهمی از داروهای ضد سرطانی را تشکیل می دهند. از اینرو فعالیت ضد سرطانی کمپلکس های پلاتینی زیادی تاکنون بررسی شده از جمله می توان از داروی سیس پلاتین (cisplatin) نام برد که دارای اثرات جانبی زیادی است . بنابراین در بخش دوم این پژوهش میزان فعالیت القای مرگ سلولی دو کمپلکس پلاتینی(با عنوان کمپلکس- iو کمپلکس- ii) و برهمکنش این کمپلکس ها با آلبومین سرم انسانی به عنوان حامل عمومی داروها بررسی شد. بررسی شد. در این پژوهش مشاهده شد که کمپلکس -i فعالیت القای مرگ سلولی بیشتری در مقایسه با کمپلکس - ii بر روی سلول های سرطانی k562 دارد. و همچنین مطالعات طیف سنجی (طیف سنجی uv-vis و دورنگ نمایی دورانی ) نشان داد که کمپلکس- i تغییرات ساختاری کمتری در پروتئین آلبومین سرم انسانی نسبت به کمپلکس - ii ایجاد می کند.

مطالعه ی نظری ایزومرهای کانفورماسیونی و علل پایداری نسبی آن ها در ترکیبات شامل cr3- انتهایی مجاور با گروه های کربونیل و هیدروکسیل
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه صنعتی شیراز - دانشکده علوم پایه 1392
  شیما صفرزاده   عبدالرضا نکوئی

ایزومرهای کانفورماسیونی نوعی از استروایزومرها می باشند که با چرخش حول پیوند ساده به یکدیگر تبدیل می شوند. بنابراین یک سد انرژی چرخشی وجود دارد که برای تبدیل یک کانفورمر به کانفورمر دیگر باید بر آن غلبه کرد. آگاهی از میزان سد انرژی و منشا آن، برای تفسیر برخی خواص فیزیکی و شیمیایی مولکولی و برهم کنش های لیگاند-گیرنده حائز اهمیت هستند. به این منظور تمامی کانفورمرهای ممکن فرم انولی در مولکول های استیل استون (aa)، هگزا فلورواستیل استون (hfaa) و6،6،2،2-تترامتیل-5،3-هپتان دی اُن (tmhd) با در نظر گرفتن چرخش گروه های –cr3 مجاور با گروه های عاملی هیدروکسیل و کربونیل، مطالعه شده اند. انرژی نسبی تمامی کانفورمرها، ارتفاع سد انرژی چرخشی و دلایل و عوامل موثر در پایداری نسبی کانفورمرها، مورد ارزیابی قرار گرفته اند. محاسبات پایداری نسبی نشان می دهد، زمانی که گروه –cr3 مجاور با گروه عاملی هیدروکسیل به صورت نپوشیده و گروه –cr3 مجاور با گروه عاملی هیدروکسیل به صورت پوشیده قرار گرفته اند، پایدارترین صورتبندی در هر سه ترکیب شکل می گیرد.

طراحی کامپیوتری برخی عوامل ضدقارچ جدید با استفاده از شبیه سازی های دینامیک مولکولی و داکینگ
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه صنعتی شیراز - دانشکده شیمی 1393
  فرشته حداد   دلارا محمدآقایی

سیتوکروم p450، یک آنزیم هِموپروتئینی است که در دیواره ی سلولی قارچ ها باعث تبدیل لنسترول به اِرگسترول می شود.در این مطالعه این آنزیم هِموپروتئینی که عمده فعالیتش را از طریق گروه هِم خود انجام می دهد، از بانک اطلاعاتی پروتئین استخراج شده و با استفاده از نرم افزار گرومکس تحت شبیه سازی دینامیک مولکولی قرارگرفت. داکینگ (اتصال) پروتئین شبیه سازی شده با داروهای ضدقارچ توسط نرم افزار مولگرو نشان داد که طی شبیه سازی دینامیک مولکولی ساختار پروتئین به گونه ای تغییر یافته که مانع از اتصال داروها به گروه هِم می شود. بنابراین در ادامه، داکینگ داروها مستقیماً با پروتئین گرفته شده از بانک داده های پروتئینی انجام شد.ترکیب با برهم کنش بهتر و کارایی لیگاند بالاتر، به عنوان ترکیب رهبر انتخاب گردید.20 ترکیب جدید بر اساس این ترکیب رهبر طراحی شد و مجدداً مراحل بهینه سازی ساختار و داکینگ صورت گرفت. نهایتاً چند ترکیب با برهم کنش بهتر و کارایی لیگاند بالاتر انتخاب شدند و با استفاده از مرورگرosiris ، سمیت، وزن مولکولی و حلالیت آن ها مورد بررسی قرارگرفت و بهترین ترکیب به عنوان کاندید دارویی پیشنهاد شد.

محاسبه خواص حجمی مخلوط ها و محلول های پلیمری با استفاده از معادله حالت تائو- میسون اصلاح شده
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه صنعتی شیراز - دانشکده علوم پایه 1393
  نغمه آزادی   دلارا محمدآقایی

حضور مواد مختلف پلیمری در بسیاری از صنایع از جمله ی مصالح ساختمانی، کاغذ، لباس، الیاف و غیره، بیانگر اهمیت و قابلیت به کارگیری این ترکیبات است. بنابراین دست یابی خصوصیات پلیمرها، مخلوط ها و محلول های پلیمری بسیار حائز اهمیت است. در این پایان-نامه از معادله ی حالت تائو-میسون اصلاح شده برای محاسبه ی دانسیته ی برخی محلول های پلی اتیلن گلیکول و پلی پروپیلن گلیکول، شامل محلول های پلی اتیلن گلیکول در حلال های آنیزول، 1- اکتانول و محلول های پلی پروپیلن گلیکول در حلال1- اکتانول استفاده شده است. همچنین این معادله حالت برای محاسبه ی دانسیته ی مخلوط های پلیمری شامل )پلی استایرن+پلی وینیل متیل اتر) و (پلی استایرن+ پلی فنیلن اکساید) به کار رفته است.