مایعات یونی به عنوان حلال های آلی بی ضرر برای محیط زیست، دسته جالبی از حلال های قابل کنترل در زمینه زیست فناوری می باشند. اثر دو مایع یونی، 1-آلیل 3-متیل ایمیدازولیوم کلراید و 1-اکتیل 3-متیل ایمیدازولیوم کلراید روی ساختار و فعالیت آنزیم آدنوزین دآمیناز توسط طیف سنجی فلورسانس و uv-vis دربافر فسفات50میکرو مولار با 7 ph=و دمای 37 درجه سانتیگراد بررسی شد و با نتایج مطالعات دینامیک مولکولی و اتصال مولکول مقایسه شد. مقادیر پارامترهای سینتیکی kmو vmaxحاصل از طیف سنجی uv-vis برای آنزیم به ترتیب 37/36 میکرو مولار و 019/0 میکرو مولار بر دقیقه و مقدار ki برای این آنزیم در حضور مشتق آلیل و اکتیل به ترتیب 14/13 و 26/5 میکرو مولار به دست آمد. نتایج فلورسانس برای آنزیم در حضور دو مایع یونی نشان داد که مشتق اکتیل مقدار tm را بیشتر کاهش داده است. مقدار انرژی اتصال، مهارکنندگی فعالیت و کاهش ساختار سوم آنزیم برای مشتق اکتیل به علت آبگریزتر آن بیشتر از مشتق آلیل می باشد. در نهایت شبیه سازی دینامیک مولکولی برای سیستم آنزیم، حلال و مایع یونی در 40 نانو ثانیه انجام شد. پارامترهای سطح، شعاع ژیراسیون، پیوند هیدروژنی و تابع توزیع شعاعی به دست آمد و مشاهده شده که مایع یونی پیوند هیدروژنی درون مولکولی آنزیم را کاهش داده و ساختار آنزیم را باز می کند. این نتیجه در تمام داده های شبیه سازی مشهود بوده و در توافق با مطالعات طیف سنجی می باشد