مکانیزم در بذر گیاهان به صورت موضوعی نسبتا ناشناخته می باشد. سیر همانند اکثر پیازها، غده ها و بذرها دارای دوره رکود می باشد. این دوره عدم فعالیت پیاز هنوز برای تحلیل گران و محققان، چالشی پیچیده و معما گونه ای می باشد. در پژوهش حاضر، برخی تغییرات درونی سیرچه های سیر، از جمله مقدار قند محلول کل، گلوکز، فروکتوز، ساکارز، نشاسته، کلرفیل a، کلروفیل b، کلروفیل کل، آنتوسیانین، کاروتنوئید، فعالیت برخی از آنزیم ها مانند آلفاآمیلاز، لیپاز و پروتئاز از برداشت تا جوانه زنی مورد بررسی قرار گرفت. هدف از این تحقیق تفحص بیشتر در مکانیسم خواب و ارزیابی تغییرات درونی سیر در طی مراحل رکود و همچنین تکامل جوانه زنی از نقطه نظر فیزیولوژی است. سیرچه های سیر تحت تاثیر دو تیمار دمایی مختلف (c?21 و c?4) و در شرایط کاملاً تاریکی، در سه قسمت خارجی، میانی و داخلی هر سیرچه در فواصل زمانی 2 هفته طی 84 روز مورد بررسی قرار گرفت. این تحقیق به صورت تجزیه مرکب در قالب طرح کاملاً تصادفی و در چهار تکرار صورت گرفت. علی رغم اثرات مثبت گزارش شده (05/0>p) درباره تیمار سرما در تسریع جوانه زنی، نتایج نشان داد که زمان متوسط جوانه زنی در دو تیمار اعمال شده یکسان می باشد. در این بررسی صفات اندازه گیری شده در قسمت های سه گانه سیرچه تغییرات مشابهی نشان دادند. نتایج نشان داد که در شرایط تاریکی نیز کلروفیل تشکیل می شود و کلروفیل به دلایل مختلفی از جمله بزرگ شدن بافت یا کم شدن میزان قند، پس از افزایش اولیه ثابت می ماند. نتایج این تحقیق می تواند در مطالعات پایه ای، کارهای اصلاحی استفاده شود. همچنین بهبود جوانه زنی و افزایش در تولید حداکثر محصول سیر از جمله نتایج دیگر این تحقیق است.