برهمکنش پورفیرازین کاتیونی تتراکیس(n,n,n,n 3و4-تتراپیریدینو) کبالت(ii) (co(tmtppa))با پلی-نوکلئوتیدهای سنتزی: poly(g-c) و poly(a-t) و dna غده تیموس گوساله در بافر فسفات 5/7 میلی مولار با ph 2/7 با استفاده از تکنیک های اسپکتروسکوپی جذب نوری و فلورسانس مطالعه شده است. کاهش جذب و جابجایی قرمز در طول .موج طیف uv-vis پورفیرازین به دلیل برهمکنش با هر دو پلی نوکلئوتیدهای poly(g-c) و poly(a-t) مشاهده گردید که مشابه برهمکنش پورفیرازین با dna می باشد. ثابت های ظاهری پیوند (k) با استفاده از ماکزیمم طیف جذبی پورفیرازین در نوارq در غلظتهای مختلف poly(g-c) ، poly(a-t) و dnaتعیین شده است. مقدار k برای poly(g-c) ، poly(a-t) و dnaبه ترتیب ، 1 m- 105 × 19/4 و 1 m- 105 × 66/26 1 m-6- 10 × 38/1 در دمای 25 درجه سانتی گراد به دست آمد. پارامترهای ترمودینامیکی (?g°,?h° and ?s°)با استفاده از معادله ی وانت هوف در دماهای مختلف تعیین شدند. تغییرات آنتالپی و آنتروپی بترتیب k j mol-1 29/5 و j mol-1k-102/105 در دمای 25 درجه سانتی گراد محاسبه شده است. مقادیر آنتروپی و آنتالپی مثبت حاکی از آن است که هر دو نیروهای هیدروفوبیک و الکترواستاتیک در پایداری کمپلکس تشکیل شده نقش مهمی دارند. بررسی اثر قدرت یونی بر ثابت تعادل ظاهری نشان داد که با افزایش قدرت یونی ( na+] ( [ثابت تعادل ظاهری کاهش می یابد. خاموشی فلورسانس اتیدیوم برماید dna- به وسیله پورفیرازین بررسی گردید. مقدار ثابت خاموشی (ksv) با استفاده از معادله ی استرن- ولمر به دست آمد. نتایج نشان می دهد که این پورفیرازین در نواحی غنی از پلی نوکلئوتیدهای dna که شامل بازهای آدنین-تیمین و گوانین-سیتوزین هستند، از طریق پیوند بین شیاری برهمکنش ایجاد می نماید.