پاسارگاد مجموعه ای از سازه های باستانی باقیمانده از حکومت هخامنشی است که در استان فارس واقع شده است. آرامگاه کوروش بزرگکه از سنگ های آهکی ساخته شده است در قسمت جنوبی این منطقه قرار گرفته است. سنگ های این ساختمان مانند هر سنگ دیگری، متاثر از عوامل فیزیکوشیمیایی و بیولوژیکی است. فرسودگی زیستی مواد فرآیندی برگشت ناپذیر است که طی آن مواد تحت تاثیر ماکروارگانیسم ها و میکروارگانیسم ها قرار گرفته و باعث آسیب ها و هزینه های کلان اقتصادی می شود. تقریبا تمام انواع میکروارگانیسم های محیطی بر سطوح خارجی بناهای تاریخی حضور دارند و میکروارگانیسم های فتوتروف شرایط مناسب برای رشد دیگر ارگانیسم ها را فراهم می کنند. بنابراین، مطالعه حاضر به منظور جداسازی و شناسایی میکروارگانیسم های موثر در فرسودگی انجام شد. استریومیکروسکوپ و میکروسکوپ الکترونی نگاره و انکسار پرتو xبرای بررسی ساختار بیوفیلم ها و آسیب های بستر فوق، مورد استفاده قرار گرفت. برای شناسایی این میکروارگانیسم ها از روش های کشت و آزمایش های بیوشیمیایی به همراه روش های میکروسکوپی استفاده شد. علاوه بر این، جهت شناسایی دقیق تر، استخراج dna، واکنش زنجیره ای پلیمراز (pcr) و توالی یابی محصولات pcr انجام شد. در نهایت نتایجمولکولی با مشاهدات موفولوژیکی مطابقت داده شد.در طی این بررسی،گونه های مختلفی از میکروارگانیسم ها، از جمله جلبک ها و سیانوباکتری ها و اکتینومیست ها جدا گردید. در این مطالعه، بیشترین نوع جلبک های جدا شده متعلق به جنس هایtrebouxia و trentepohliaبودند. از میان سیانوباکتری ها، جنس هایchroococcus ،phormidium ،synechococcus و microcoleus باکتری های جدا شده غالب بودند.streptomycesاز جمله اکتینومیست های شایع ساکن سنگ آهکی محل مورد تحقیق بودند.اولین قدم در حذف و یا کنترل رشد میکروارگانیسم های عامل فرسودگی تشخیص آن ها است. برای پیدا کردن بهترین روش تمیز کردن سطوح سنگ باید آزمایش های بیشتری انجام شود تا مناسب ترین روش برای حذف میکروارگانیسم های جدا شده انتخاب گردد.